MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis B420 chromosome

Total Repeats: 1197

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017866	ACCAC	2	10	1767	1776	40 %	0 %	0 %	60 %	387819931
2	NC_017866	CCGGC	2	10	2784	2793	0 %	0 %	40 %	60 %	387819932
3	NC_017866	CCGTT	2	10	3097	3106	0 %	40 %	20 %	40 %	387819932
4	NC_017866	AACGC	2	10	3315	3324	40 %	0 %	20 %	40 %	387819932
5	NC_017866	CGATC	2	10	5830	5839	20 %	20 %	20 %	40 %	387819935
6	NC_017866	AAGGC	2	10	7644	7653	40 %	0 %	40 %	20 %	387819935
7	NC_017866	GCACG	2	10	14420	14429	20 %	0 %	40 %	40 %	387819940
8	NC_017866	GGTGG	2	10	15065	15074	0 %	20 %	80 %	0 %	387819940
9	NC_017866	GCGAG	2	10	15797	15806	20 %	0 %	60 %	20 %	387819941
10	NC_017866	CGTGC	2	10	15944	15953	0 %	20 %	40 %	40 %	387819941
11	NC_017866	GATTG	2	10	16718	16727	20 %	40 %	40 %	0 %	387819941
12	NC_017866	TTCGA	2	10	17127	17136	20 %	40 %	20 %	20 %	387819943
13	NC_017866	ACCGA	2	10	17784	17793	40 %	0 %	20 %	40 %	387819943
14	NC_017866	CGCAC	2	10	24588	24597	20 %	0 %	20 %	60 %	387819949
15	NC_017866	CGACG	2	10	25256	25265	20 %	0 %	40 %	40 %	387819949
16	NC_017866	CGCTG	2	10	25402	25411	0 %	20 %	40 %	40 %	387819949
17	NC_017866	GGGGA	2	10	27082	27091	20 %	0 %	80 %	0 %	387819950
18	NC_017866	GGGAA	2	10	32962	32971	40 %	0 %	60 %	0 %	387819959
19	NC_017866	TTTTG	2	10	33987	33996	0 %	80 %	20 %	0 %	387819960
20	NC_017866	GATGT	2	10	35032	35041	20 %	40 %	40 %	0 %	387819961
21	NC_017866	TATGC	2	10	38421	38430	20 %	40 %	20 %	20 %	387819962
22	NC_017866	AAAGC	2	10	39670	39679	60 %	0 %	20 %	20 %	387819962
23	NC_017866	CATCA	2	10	40475	40484	40 %	20 %	0 %	40 %	387819963
24	NC_017866	TGCTG	2	10	41065	41074	0 %	40 %	40 %	20 %	387819963
25	NC_017866	GAGAT	2	10	43617	43626	40 %	20 %	40 %	0 %	387819964
26	NC_017866	CAAGC	2	10	44321	44330	40 %	0 %	20 %	40 %	387819965
27	NC_017866	TTCGT	2	10	44833	44842	0 %	60 %	20 %	20 %	387819966
28	NC_017866	GATCG	2	10	45763	45772	20 %	20 %	40 %	20 %	387819969
29	NC_017866	CGCCA	2	10	46431	46440	20 %	0 %	20 %	60 %	387819970
30	NC_017866	CCGAC	2	10	47665	47674	20 %	0 %	20 %	60 %	387819972
31	NC_017866	CTCGG	2	10	48383	48392	0 %	20 %	40 %	40 %	387819973
32	NC_017866	GCCAT	2	10	49083	49092	20 %	20 %	20 %	40 %	387819973
33	NC_017866	GCCCG	2	10	49960	49969	0 %	0 %	40 %	60 %	387819973
34	NC_017866	CGGTC	2	10	52543	52552	0 %	20 %	40 %	40 %	387819977
35	NC_017866	GCACG	2	10	53344	53353	20 %	0 %	40 %	40 %	387819977
36	NC_017866	ATTCA	2	10	55364	55373	40 %	40 %	0 %	20 %	387819979
37	NC_017866	TCCGC	2	10	55585	55594	0 %	20 %	20 %	60 %	387819979
38	NC_017866	TGAAT	2	10	56420	56429	40 %	40 %	20 %	0 %	387819979
39	NC_017866	GGATC	2	10	57076	57085	20 %	20 %	40 %	20 %	387819979
40	NC_017866	ATCGC	2	10	66393	66402	20 %	20 %	20 %	40 %	387819990
41	NC_017866	TGGGG	2	10	67092	67101	0 %	20 %	80 %	0 %	387819991
42	NC_017866	GGCGC	2	10	69592	69601	0 %	0 %	60 %	40 %	387819992
43	NC_017866	GCTCG	2	10	72756	72765	0 %	20 %	40 %	40 %	387819994
44	NC_017866	GCTGA	2	10	74919	74928	20 %	20 %	40 %	20 %	387819996
45	NC_017866	CATCG	2	10	76719	76728	20 %	20 %	20 %	40 %	387819996
46	NC_017866	CGGTC	2	10	79327	79336	0 %	20 %	40 %	40 %	387819998
47	NC_017866	GCACG	2	10	80128	80137	20 %	0 %	40 %	40 %	387819998
48	NC_017866	CGGTG	2	10	80718	80727	0 %	20 %	60 %	20 %	387819999
49	NC_017866	TCATT	2	10	81634	81643	20 %	60 %	0 %	20 %	387819999
50	NC_017866	CCAAA	2	10	82117	82126	60 %	0 %	0 %	40 %	387820000
51	NC_017866	CCGGG	2	10	82610	82619	0 %	0 %	60 %	40 %	387820001
52	NC_017866	CGAAC	2	10	89401	89410	40 %	0 %	20 %	40 %	387820005
53	NC_017866	GCTCG	2	10	90882	90891	0 %	20 %	40 %	40 %	387820007
54	NC_017866	GGTGC	2	10	96163	96172	0 %	20 %	60 %	20 %	387820012
55	NC_017866	GTCTT	2	10	102629	102638	0 %	60 %	20 %	20 %	387820017
56	NC_017866	GCGCC	2	10	106948	106957	0 %	0 %	40 %	60 %	387820019
57	NC_017866	GCCGC	2	10	107904	107913	0 %	0 %	40 %	60 %	387820020
58	NC_017866	CGGCG	2	10	115051	115060	0 %	0 %	60 %	40 %	387820027
59	NC_017866	TGGCG	2	10	115075	115084	0 %	20 %	60 %	20 %	387820027
60	NC_017866	ACGGC	2	10	115167	115176	20 %	0 %	40 %	40 %	387820027
61	NC_017866	GACGA	2	10	115223	115232	40 %	0 %	40 %	20 %	387820027
62	NC_017866	CCGAG	2	10	115449	115458	20 %	0 %	40 %	40 %	387820027
63	NC_017866	CGATT	2	10	115684	115693	20 %	40 %	20 %	20 %	387820027
64	NC_017866	ACCTG	2	10	116905	116914	20 %	20 %	20 %	40 %	387820028
65	NC_017866	GCCCG	2	10	117612	117621	0 %	0 %	40 %	60 %	387820028
66	NC_017866	AGTCG	2	10	117960	117969	20 %	20 %	40 %	20 %	387820028
67	NC_017866	TGGTG	2	10	121855	121864	0 %	40 %	60 %	0 %	387820031
68	NC_017866	GTTCG	2	10	123971	123980	0 %	40 %	40 %	20 %	387820033
69	NC_017866	TCGAA	2	10	125602	125611	40 %	20 %	20 %	20 %	387820034
70	NC_017866	TGGCA	2	10	128088	128097	20 %	20 %	40 %	20 %	387820038
71	NC_017866	GCCGA	2	10	128127	128136	20 %	0 %	40 %	40 %	387820038
72	NC_017866	TCGCG	2	10	129027	129036	0 %	20 %	40 %	40 %	387820039
73	NC_017866	CGCAT	2	10	135235	135244	20 %	20 %	20 %	40 %	387820045
74	NC_017866	TGCTC	2	10	139189	139198	0 %	40 %	20 %	40 %	387820050
75	NC_017866	CGGCT	2	10	141048	141057	0 %	20 %	40 %	40 %	387820052
76	NC_017866	CAAGA	2	10	147644	147653	60 %	0 %	20 %	20 %	387820057
77	NC_017866	GACAA	2	10	149868	149877	60 %	0 %	20 %	20 %	387820059
78	NC_017866	CCCGA	2	10	150045	150054	20 %	0 %	20 %	60 %	387820059
79	NC_017866	CGACG	2	10	152524	152533	20 %	0 %	40 %	40 %	387820061
80	NC_017866	GCACC	2	10	155958	155967	20 %	0 %	20 %	60 %	387820063
81	NC_017866	GCTCG	2	10	156863	156872	0 %	20 %	40 %	40 %	387820064
82	NC_017866	CGGCA	2	10	157523	157532	20 %	0 %	40 %	40 %	387820064
83	NC_017866	CGACC	2	10	158592	158601	20 %	0 %	20 %	60 %	387820065
84	NC_017866	GCTCG	2	10	158912	158921	0 %	20 %	40 %	40 %	387820066
85	NC_017866	CACCG	2	10	161606	161615	20 %	0 %	20 %	60 %	387820068
86	NC_017866	TGGCA	2	10	162248	162257	20 %	20 %	40 %	20 %	387820068
87	NC_017866	GCGCC	2	10	164849	164858	0 %	0 %	40 %	60 %	387820072
88	NC_017866	CCGCG	2	10	165533	165542	0 %	0 %	40 %	60 %	387820072
89	NC_017866	TGCCG	2	10	174261	174270	0 %	20 %	40 %	40 %	387820077
90	NC_017866	TGCCC	2	10	177031	177040	0 %	20 %	20 %	60 %	387820080
91	NC_017866	TGCGC	2	10	178043	178052	0 %	20 %	40 %	40 %	387820081
92	NC_017866	GCGTG	2	10	178656	178665	0 %	20 %	60 %	20 %	387820082
93	NC_017866	CCACG	2	10	179562	179571	20 %	0 %	20 %	60 %	387820082
94	NC_017866	CTCGC	2	10	184343	184352	0 %	20 %	20 %	60 %	387820086
95	NC_017866	CGCCA	2	10	185950	185959	20 %	0 %	20 %	60 %	387820087
96	NC_017866	CGTGG	2	10	186641	186650	0 %	20 %	60 %	20 %	387820087
97	NC_017866	TCGCC	2	10	188682	188691	0 %	20 %	20 %	60 %	387820088
98	NC_017866	CAGCG	2	10	193030	193039	20 %	0 %	40 %	40 %	387820091
99	NC_017866	ATGGC	2	10	193251	193260	20 %	20 %	40 %	20 %	387820091
100	NC_017866	GCTCG	2	10	193589	193598	0 %	20 %	40 %	40 %	387820092
101	NC_017866	TCGAA	2	10	194749	194758	40 %	20 %	20 %	20 %	387820092
102	NC_017866	GCGAG	2	10	194902	194911	20 %	0 %	60 %	20 %	387820092
103	NC_017866	CGGCG	2	10	196252	196261	0 %	0 %	60 %	40 %	387820093
104	NC_017866	TGCCG	2	10	196829	196838	0 %	20 %	40 %	40 %	387820093
105	NC_017866	TGTGT	2	10	198689	198698	0 %	60 %	40 %	0 %	387820094
106	NC_017866	TGCCC	2	10	198734	198743	0 %	20 %	20 %	60 %	387820094
107	NC_017866	GCCGC	2	10	202290	202299	0 %	0 %	40 %	60 %	387820098
108	NC_017866	ACTGC	2	10	202981	202990	20 %	20 %	20 %	40 %	387820098
109	NC_017866	TCGTC	2	10	205518	205527	0 %	40 %	20 %	40 %	387820100
110	NC_017866	GCGTG	2	10	206343	206352	0 %	20 %	60 %	20 %	387820100
111	NC_017866	TCGAC	2	10	207056	207065	20 %	20 %	20 %	40 %	387820101
112	NC_017866	GCCGG	2	10	210005	210014	0 %	0 %	60 %	40 %	387820102
113	NC_017866	CACGC	2	10	213192	213201	20 %	0 %	20 %	60 %	387820105
114	NC_017866	CCGTG	2	10	213830	213839	0 %	20 %	40 %	40 %	387820105
115	NC_017866	CGGAA	2	10	214879	214888	40 %	0 %	40 %	20 %	387820106
116	NC_017866	AAGAC	2	10	221027	221036	60 %	0 %	20 %	20 %	387820111
117	NC_017866	TGGCG	2	10	221884	221893	0 %	20 %	60 %	20 %	387820112
118	NC_017866	GGTGG	2	10	225516	225525	0 %	20 %	80 %	0 %	387820114
119	NC_017866	GCGCA	2	10	227063	227072	20 %	0 %	40 %	40 %	387820116
120	NC_017866	AGCAA	2	10	229333	229342	60 %	0 %	20 %	20 %	387820118
121	NC_017866	CGGCA	2	10	232269	232278	20 %	0 %	40 %	40 %	387820120
122	NC_017866	GCCCG	2	10	233158	233167	0 %	0 %	40 %	60 %	387820121
123	NC_017866	CGTGG	2	10	233848	233857	0 %	20 %	60 %	20 %	387820121
124	NC_017866	TGCTC	2	10	235217	235226	0 %	40 %	20 %	40 %	387820123
125	NC_017866	GGGGC	2	10	235761	235770	0 %	0 %	80 %	20 %	387820123
126	NC_017866	CGTTT	2	10	236150	236159	0 %	60 %	20 %	20 %	387820124
127	NC_017866	CTCAC	2	10	236471	236480	20 %	20 %	0 %	60 %	387820124
128	NC_017866	CTCGA	2	10	237218	237227	20 %	20 %	20 %	40 %	387820125
129	NC_017866	TCCGG	2	10	237273	237282	0 %	20 %	40 %	40 %	387820125
130	NC_017866	GCGCG	2	10	237593	237602	0 %	0 %	60 %	40 %	387820125
131	NC_017866	CTCGA	2	10	238140	238149	20 %	20 %	20 %	40 %	387820125
132	NC_017866	TCGTC	2	10	239050	239059	0 %	40 %	20 %	40 %	387820125
133	NC_017866	ACCCG	2	10	241960	241969	20 %	0 %	20 %	60 %	387820127
134	NC_017866	TCGGC	2	10	242997	243006	0 %	20 %	40 %	40 %	387820128
135	NC_017866	GCGAT	2	10	245010	245019	20 %	20 %	40 %	20 %	387820132
136	NC_017866	GGCGA	2	10	245957	245966	20 %	0 %	60 %	20 %	387820133
137	NC_017866	CCGCA	2	10	247566	247575	20 %	0 %	20 %	60 %	387820133
138	NC_017866	CGGCC	2	10	255980	255989	0 %	0 %	40 %	60 %	387820140
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244	NC_017866	ACCGT	2	10	407507	407516	20 %	20 %	20 %	40 %	387820248
245	NC_017866	ACCGG	2	10	407661	407670	20 %	0 %	40 %	40 %	387820248
246	NC_017866	TCACG	2	10	407722	407731	20 %	20 %	20 %	40 %	387820248
247	NC_017866	CCCGA	2	10	410331	410340	20 %	0 %	20 %	60 %	387820251
248	NC_017866	CCGCC	2	10	410717	410726	0 %	0 %	20 %	80 %	387820251
249	NC_017866	ACTCG	2	10	410732	410741	20 %	20 %	20 %	40 %	387820251
250	NC_017866	GCGCG	2	10	411285	411294	0 %	0 %	60 %	40 %	387820252
251	NC_017866	TGCAT	2	10	411498	411507	20 %	40 %	20 %	20 %	387820252
252	NC_017866	GCCGT	2	10	411702	411711	0 %	20 %	40 %	40 %	387820252
253	NC_017866	CGGCC	2	10	413770	413779	0 %	0 %	40 %	60 %	387820254
254	NC_017866	CGCCT	2	10	416401	416410	0 %	20 %	20 %	60 %	387820257
255	NC_017866	GCGCA	2	10	416611	416620	20 %	0 %	40 %	40 %	387820257
256	NC_017866	TTCGA	2	10	417538	417547	20 %	40 %	20 %	20 %	387820257
257	NC_017866	CGACC	2	10	418629	418638	20 %	0 %	20 %	60 %	387820258
258	NC_017866	TGCGA	2	10	419583	419592	20 %	20 %	40 %	20 %	387820259
259	NC_017866	TGCCG	2	10	421276	421285	0 %	20 %	40 %	40 %	387820260
260	NC_017866	AGGCG	2	10	422035	422044	20 %	0 %	60 %	20 %	387820260
261	NC_017866	CGGTG	2	10	422551	422560	0 %	20 %	60 %	20 %	387820260
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263	NC_017866	AGGGG	2	10	426149	426158	20 %	0 %	80 %	0 %	387820263
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