MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis B420 chromosome

Total Repeats: 818

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017866	AGGA	2	8	3645	3652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017866	CTGC	2	8	11473	11480	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017866	CGCA	2	8	11481	11488	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017866	TGCA	2	8	13668	13675	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017866	GTTG	2	8	13879	13886	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017866	CCTC	2	8	15392	15399	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_017866	TGCA	2	8	18222	18229	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017866	ATGT	2	8	19468	19475	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017866	AGAA	2	8	19856	19863	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017866	GGTG	2	8	19923	19930	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017866	ATTC	2	8	19931	19938	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017866	TGAC	2	8	21710	21717	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017866	GCAT	2	8	23016	23023	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017866	TTTC	2	8	23043	23050	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017866	CCAA	2	8	23236	23243	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017866	CCGA	2	8	26277	26284	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017866	ATGC	2	8	26318	26325	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017866	AAGG	2	8	28125	28132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017866	ACTG	2	8	28379	28386	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017866	GCTT	2	8	29053	29060	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017866	GTTT	2	8	29994	30001	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017866	TGGC	2	8	32674	32681	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017866	GTTT	2	8	34200	34207	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017866	AATT	2	8	34339	34346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017866	CTCG	2	8	36208	36215	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017866	TGTC	2	8	36971	36978	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017866	GATT	2	8	44113	44120	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017866	AGAA	2	8	44644	44651	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017866	TGCT	2	8	45948	45955	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017866	TGAA	2	8	50378	50385	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017866	ATCG	2	8	55313	55320	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017866	TACG	2	8	60419	60426	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017866	CAAA	2	8	61992	61999	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017866	TCGC	2	8	64033	64040	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017866	AAGG	2	8	65509	65516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017866	GGTC	2	8	66895	66902	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017866	GGGC	2	8	71414	71421	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017866	TTCC	2	8	73037	73044	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017866	TATC	2	8	85922	85929	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017866	GTCT	2	8	89939	89946	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017866	GCCA	2	8	89987	89994	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017866	AGCG	2	8	92722	92729	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017866	TGCC	2	8	111542	111549	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017866	CCCG	2	8	112118	112125	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
45	NC_017866	AGCT	2	8	116080	116087	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017866	TTGC	2	8	116156	116163	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017866	CATG	2	8	127416	127423	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017866	GCTG	2	8	127516	127523	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017866	TGCA	2	8	131348	131355	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017866	GCTC	2	8	132953	132960	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017866	GGCT	2	8	133155	133162	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017866	CCGC	2	8	133299	133306	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53	NC_017866	GCGG	2	8	136955	136962	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017866	TGTT	2	8	138033	138040	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017866	CGTG	2	8	143580	143587	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017866	GGCC	2	8	143787	143794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017866	CATG	2	8	143987	143994	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017866	CAGA	2	8	157823	157830	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017866	GGGA	2	8	164220	164227	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017866	GCGT	2	8	164398	164405	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017866	TGAG	2	8	164640	164647	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017866	AGAA	2	8	164801	164808	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017866	ATCT	2	8	166319	166326	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017866	GCGT	2	8	166434	166441	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017866	GCAT	2	8	167728	167735	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017866	GTTT	2	8	167877	167884	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017866	GCAT	2	8	168159	168166	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017866	GGGT	2	8	170294	170301	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017866	CTTT	2	8	171746	171753	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017866	GCGG	2	8	171896	171903	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017866	AGTA	2	8	171949	171956	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017866	AATG	2	8	171957	171964	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017866	TGCT	2	8	176872	176879	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017866	AGTG	2	8	177647	177654	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017866	CTTG	2	8	179695	179702	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017866	TAAG	2	8	179824	179831	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017866	CGGT	2	8	183514	183521	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017866	CACG	2	8	190686	190693	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017866	CGGG	2	8	191301	191308	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017866	GAAC	2	8	191515	191522	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017866	ACGA	2	8	191528	191535	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017866	TGAA	2	8	192658	192665	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017866	GTAA	2	8	192680	192687	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017866	GATA	2	8	195354	195361	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017866	GCAA	2	8	201551	201558	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017866	AAAC	2	8	201976	201983	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017866	ACGG	2	8	203400	203407	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017866	TGGT	2	8	203563	203570	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017866	CGGT	2	8	203843	203850	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017866	GGCG	2	8	211195	211202	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017866	ATGA	2	8	215486	215493	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017866	CACG	2	8	223493	223500	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017866	TGCA	2	8	223710	223717	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017866	TCAT	2	8	225747	225754	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017866	AGGC	2	8	227743	227750	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017866	AGGG	2	8	232892	232899	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017866	TTGT	2	8	234696	234703	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017866	CCGG	2	8	235096	235103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017866	GGGC	2	8	239754	239761	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017866	CCAG	2	8	240204	240211	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017866	CGTC	2	8	243799	243806	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017866	GGCA	2	8	245152	245159	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017866	GACA	2	8	249339	249346	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017866	CGGT	2	8	251090	251097	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017866	GTTC	2	8	251129	251136	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017866	GCCG	2	8	254386	254393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017866	GCCG	2	8	256971	256978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017866	CTGG	2	8	257003	257010	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017866	TGAC	2	8	266769	266776	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017866	TCCC	2	8	271022	271029	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
111	NC_017866	CCAT	2	8	274196	274203	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017866	TGAT	2	8	274929	274936	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017866	AGGG	2	8	275032	275039	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017866	GAAC	2	8	275296	275303	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017866	GCTT	2	8	276827	276834	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017866	GCGG	2	8	277014	277021	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017866	TTCG	2	8	278013	278020	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017866	GCGG	2	8	278067	278074	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017866	GAAA	2	8	278313	278320	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017866	CGGA	2	8	279468	279475	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017866	AAAG	2	8	281168	281175	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017866	GGCT	2	8	284622	284629	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017866	TGGC	2	8	286756	286763	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017866	ATGT	2	8	286945	286952	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017866	TACC	2	8	290406	290413	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017866	ACTC	2	8	291164	291171	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017866	ATGA	2	8	291269	291276	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017866	TGAA	2	8	291280	291287	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017866	AGGA	2	8	291611	291618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017866	TGCT	2	8	294689	294696	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017866	CGCT	2	8	296248	296255	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017866	AGCG	2	8	296475	296482	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017866	CCCG	2	8	297518	297525	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
134	NC_017866	CATG	2	8	299148	299155	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017866	TTGC	2	8	300430	300437	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017866	GTTT	2	8	300542	300549	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017866	GCGG	2	8	300567	300574	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017866	GGTT	2	8	310159	310166	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017866	CAGG	2	8	313606	313613	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017866	CCGA	2	8	316811	316818	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017866	GTTC	2	8	316923	316930	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017866	ATGG	2	8	317045	317052	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017866	CGCA	3	12	318289	318300	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017866	ACCA	2	8	319112	319119	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017866	TCAA	2	8	319241	319248	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017866	GGCC	2	8	319387	319394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_017866	AGGC	2	8	319479	319486	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017866	CCCA	2	8	319787	319794	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
149	NC_017866	CCAG	2	8	319869	319876	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017866	AAAG	2	8	320098	320105	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017866	TGCC	2	8	320340	320347	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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162	NC_017866	CCGA	2	8	323738	323745	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
163	NC_017866	CCGA	2	8	323756	323763	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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483	NC_017866	TGCA	2	8	1204463	1204470	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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485	NC_017866	TTCG	2	8	1206633	1206640	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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492	NC_017866	ACGC	2	8	1249889	1249896	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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499	NC_017866	GATG	2	8	1284611	1284618	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
500	NC_017866	CCAT	2	8	1284620	1284627	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

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