MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis B420 chromosome

Total Repeats: 28578

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017866	GGT	2	6	265	270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387819931
2	NC_017866	CAC	2	6	274	279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387819931
3	NC_017866	GCC	2	6	406	411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387819931
4	NC_017866	GGA	2	6	445	450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387819931
5	NC_017866	GCC	2	6	482	487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387819931
6	NC_017866	GCG	3	9	563	571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387819931
7	NC_017866	CGA	2	6	610	615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819931
8	NC_017866	GCA	2	6	658	663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819931
9	NC_017866	ACG	2	6	681	686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819931
10	NC_017866	CAC	2	6	751	756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387819931
11	NC_017866	CGC	2	6	771	776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387819931
12	NC_017866	CGG	2	6	961	966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387819931
13	NC_017866	TGC	2	6	1164	1169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387819931
14	NC_017866	CGA	2	6	1174	1179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819931
15	NC_017866	CGG	2	6	1192	1197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387819931
16	NC_017866	TTC	2	6	1220	1225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387819931
17	NC_017866	GCC	2	6	1282	1287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387819931
18	NC_017866	GGA	2	6	1297	1302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387819931
19	NC_017866	GCC	2	6	1357	1362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387819931
20	NC_017866	ACG	2	6	1428	1433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819931
21	NC_017866	CAA	2	6	1462	1467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387819931
22	NC_017866	ACC	2	6	1521	1526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387819931
23	NC_017866	CAC	2	6	1573	1578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387819931
24	NC_017866	CAT	2	6	1603	1608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387819931
25	NC_017866	CGA	2	6	1642	1647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819931
26	NC_017866	GCC	2	6	1662	1667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387819931
27	NC_017866	CGG	2	6	1756	1761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387819931
28	NC_017866	AGC	2	6	1866	1871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819931
29	NC_017866	GAC	2	6	2536	2541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819932
30	NC_017866	GGC	2	6	2596	2601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387819932
31	NC_017866	CGT	2	6	2686	2691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387819932
32	NC_017866	GCT	2	6	2704	2709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387819932
33	NC_017866	TGC	2	6	2727	2732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387819932
34	NC_017866	GAC	2	6	2764	2769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819932
35	NC_017866	CGA	2	6	3037	3042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819932
36	NC_017866	GCG	2	6	3059	3064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387819932
37	NC_017866	CCG	2	6	3216	3221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387819932
38	NC_017866	TGG	2	6	3306	3311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387819932
39	NC_017866	GAC	2	6	3508	3513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819932
40	NC_017866	GCA	2	6	3541	3546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819932
41	NC_017866	GAG	2	6	3560	3565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387819932
42	NC_017866	TCG	2	6	3777	3782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387819933
43	NC_017866	TCG	2	6	3840	3845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387819933
44	NC_017866	GCC	2	6	3863	3868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387819933
45	NC_017866	AGA	2	6	3883	3888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387819933
46	NC_017866	ACA	2	6	3909	3914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387819933
47	NC_017866	GAC	2	6	3934	3939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819933
48	NC_017866	CGG	2	6	3991	3996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387819933
49	NC_017866	TCG	2	6	4038	4043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387819933
50	NC_017866	CGA	2	6	4054	4059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819933
51	NC_017866	GCC	2	6	4112	4117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387819933
52	NC_017866	AGG	2	6	4209	4214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387819933
53	NC_017866	GAG	2	6	4229	4234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387819933
54	NC_017866	CGT	2	6	4407	4412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387819933
55	NC_017866	CGA	2	6	4414	4419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819933
56	NC_017866	GGC	2	6	4477	4482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387819933
57	NC_017866	GAC	2	6	4556	4561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819933
58	NC_017866	TCG	2	6	4601	4606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387819933
59	NC_017866	TCT	2	6	4657	4662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387819933
60	NC_017866	GTG	2	6	4691	4696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387819933
61	NC_017866	CGA	2	6	4699	4704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819933
62	NC_017866	CGT	2	6	4730	4735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387819933
63	NC_017866	ATC	2	6	4775	4780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387819933
64	NC_017866	GCG	2	6	4787	4792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387819933
65	NC_017866	GGC	2	6	4846	4851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387819933
66	NC_017866	GGC	2	6	4871	4876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387819933
67	NC_017866	GCC	2	6	4937	4942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387819933
68	NC_017866	GAG	2	6	5200	5205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387819934
69	NC_017866	CGA	2	6	5235	5240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819934
70	NC_017866	GTT	2	6	5256	5261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387819934
71	NC_017866	CGT	2	6	5414	5419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387819934
72	NC_017866	TGC	2	6	5441	5446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387819934
73	NC_017866	ACG	2	6	5874	5879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819935
74	NC_017866	GAC	2	6	5888	5893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819935
75	NC_017866	ACG	2	6	5913	5918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819935
76	NC_017866	CAC	2	6	6005	6010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387819935
77	NC_017866	TCG	2	6	6024	6029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387819935
78	NC_017866	CGA	2	6	6112	6117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819935
79	NC_017866	CGA	2	6	6136	6141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819935
80	NC_017866	CGG	2	6	6196	6201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387819935
81	NC_017866	CGG	4	12	6208	6219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387819935
82	NC_017866	CGG	2	6	6232	6237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387819935
83	NC_017866	GGT	2	6	6259	6264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387819935
84	NC_017866	CTA	2	6	6310	6315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387819935
85	NC_017866	CGA	3	9	6379	6387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819935
86	NC_017866	GAC	2	6	6436	6441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819935
87	NC_017866	GCA	2	6	6465	6470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819935
88	NC_017866	CAG	2	6	6476	6481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819935
89	NC_017866	CGA	2	6	6535	6540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819935
90	NC_017866	GGA	2	6	6580	6585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387819935
91	NC_017866	CCA	2	6	6792	6797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387819935
92	NC_017866	GGC	2	6	6803	6808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387819935
93	NC_017866	GAG	2	6	6815	6820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387819935
94	NC_017866	TGA	2	6	7026	7031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387819935
95	NC_017866	GAA	2	6	7075	7080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387819935
96	NC_017866	CAT	2	6	7081	7086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387819935
97	NC_017866	GAA	2	6	7126	7131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387819935
98	NC_017866	CGC	2	6	7148	7153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387819935
99	NC_017866	CCG	2	6	7170	7175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387819935
100	NC_017866	GGC	2	6	7256	7261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387819935
101	NC_017866	CGG	3	9	7393	7401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387819935
102	NC_017866	ATC	2	6	7448	7453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387819935
103	NC_017866	TTC	2	6	7508	7513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387819935
104	NC_017866	GCC	2	6	7561	7566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387819935
105	NC_017866	ACC	2	6	7736	7741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387819935
106	NC_017866	ACC	2	6	7752	7757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387819935
107	NC_017866	CGA	2	6	7798	7803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819935
108	NC_017866	CGA	2	6	7825	7830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819935
109	NC_017866	CCG	2	6	7840	7845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387819935
110	NC_017866	AAC	2	6	7981	7986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387819936
111	NC_017866	CGA	2	6	8019	8024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819936
112	NC_017866	AGG	2	6	8066	8071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387819936
113	NC_017866	ACA	2	6	8075	8080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387819936
114	NC_017866	TGG	2	6	8096	8101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387819936
115	NC_017866	CCG	2	6	8223	8228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387819936
116	NC_017866	ACG	2	6	8246	8251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819936
117	NC_017866	ACA	2	6	8276	8281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387819936
118	NC_017866	ACC	2	6	8318	8323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387819936
119	NC_017866	TCG	2	6	8393	8398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387819936
120	NC_017866	CGA	2	6	8427	8432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819936
121	NC_017866	CGG	2	6	8435	8440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387819936
122	NC_017866	ACG	2	6	8534	8539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819936
123	NC_017866	TGC	2	6	8561	8566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387819936
124	NC_017866	CTC	2	6	8598	8603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387819936
125	NC_017866	ACC	2	6	8684	8689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387819936
126	NC_017866	GAG	2	6	8704	8709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387819936
127	NC_017866	CGA	2	6	8762	8767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819936
128	NC_017866	TCA	2	6	8816	8821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387819936
129	NC_017866	GAG	2	6	8845	8850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387819936
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254	NC_017866	GCC	2	6	15606	15611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387819941
255	NC_017866	TCA	2	6	15725	15730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387819941
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257	NC_017866	GAA	2	6	15840	15845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387819941
258	NC_017866	GAA	2	6	15918	15923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387819941
259	NC_017866	CGC	2	6	16076	16081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387819941
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