MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Methylophaga sp. JAM7 plasmid unnamed

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017858	GCTCCT	2	12	2019	2030	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	387128929
2	NC_017858	TAGTGA	2	12	4369	4380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128930
3	NC_017858	CTTCAT	2	12	8926	8937	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387128936
4	NC_017858	AATCAC	2	12	12218	12229	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387128938
5	NC_017858	GACAAC	2	12	13940	13951	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387128940
6	NC_017858	GAACAT	2	12	14044	14055	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387128940
7	NC_017858	GTATCG	2	12	18459	18470	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387128945
8	NC_017858	TTCTCG	2	12	19106	19117	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387128946
9	NC_017858	GGTGGC	2	12	19396	19407	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	387128946
10	NC_017858	CTCTAG	2	12	19533	19544	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387128946
11	NC_017858	GCCAAG	2	12	19756	19767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128946
12	NC_017858	CAAGGT	2	12	19846	19857	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387128946
13	NC_017858	TACCGC	2	12	20483	20494	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387128947
14	NC_017858	CTTTTT	2	12	26337	26348	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387128959
15	NC_017858	GGGCCG	2	12	29116	29127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387128962
16	NC_017858	TGTTCG	2	12	30297	30308	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387128962
17	NC_017858	CTCGTC	2	12	32608	32619	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	387128964
18	NC_017858	TGGCAA	2	12	36141	36152	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387128966
19	NC_017858	TGCGGC	2	12	37050	37061	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	387128967
20	NC_017858	TGGTAG	2	12	41108	41119	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387128971
21	NC_017858	GCTCCT	2	12	41229	41240	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	387128972
22	NC_017858	CTTCCT	2	12	44588	44599	0 %	50 %	0 %	50 %	387128976
23	NC_017858	TTTGAC	2	12	46896	46907	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387128979

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.