MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methylophaga sp. JAM7 plasmid unnamed

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017858	TCCTT	2	10	3057	3066	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_017858	TCGCC	2	10	5004	5013	0 %	20 %	20 %	60 %	387128930
3	NC_017858	TGTGC	2	10	5925	5934	0 %	40 %	40 %	20 %	387128932
4	NC_017858	GCGGA	2	10	6963	6972	20 %	0 %	60 %	20 %	387128933
5	NC_017858	CTGGC	2	10	7050	7059	0 %	20 %	40 %	40 %	387128933
6	NC_017858	TGCGG	2	10	8036	8045	0 %	20 %	60 %	20 %	387128936
7	NC_017858	CCGTT	2	10	9434	9443	0 %	40 %	20 %	40 %	387128936
8	NC_017858	AATGG	2	10	9703	9712	40 %	20 %	40 %	0 %	387128936
9	NC_017858	GAAAT	2	10	9762	9771	60 %	20 %	20 %	0 %	387128936
10	NC_017858	TGGAC	2	10	11144	11153	20 %	20 %	40 %	20 %	387128937
11	NC_017858	CACCG	2	10	11814	11823	20 %	0 %	20 %	60 %	387128938
12	NC_017858	GCGTC	2	10	12793	12802	0 %	20 %	40 %	40 %	387128940
13	NC_017858	AGCGC	2	10	14422	14431	20 %	0 %	40 %	40 %	387128941
14	NC_017858	GCGTC	2	10	16479	16488	0 %	20 %	40 %	40 %	387128944
15	NC_017858	TAGCT	2	10	17433	17442	20 %	40 %	20 %	20 %	387128944
16	NC_017858	GGCGC	2	10	19198	19207	0 %	0 %	60 %	40 %	387128946
17	NC_017858	AGGGC	2	10	19617	19626	20 %	0 %	60 %	20 %	387128946
18	NC_017858	TGAAA	2	10	20188	20197	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017858	TGCGG	2	10	20318	20327	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017858	GGGCA	2	10	21301	21310	20 %	0 %	60 %	20 %	387128948
21	NC_017858	TTTGA	2	10	21923	21932	20 %	60 %	20 %	0 %	387128949
22	NC_017858	TTTGC	2	10	26981	26990	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017858	TCCGA	2	10	30987	30996	20 %	20 %	20 %	40 %	387128962
24	NC_017858	TGCAG	2	10	31056	31065	20 %	20 %	40 %	20 %	387128962
25	NC_017858	TGTTC	2	10	31378	31387	0 %	60 %	20 %	20 %	387128962
26	NC_017858	GGTGC	2	10	31599	31608	0 %	20 %	60 %	20 %	387128962
27	NC_017858	TTCGG	2	10	34911	34920	0 %	40 %	40 %	20 %	387128966
28	NC_017858	GCGAA	2	10	36850	36859	40 %	0 %	40 %	20 %	387128967
29	NC_017858	TTCGT	2	10	37173	37182	0 %	60 %	20 %	20 %	387128967
30	NC_017858	GCTTT	2	10	37940	37949	0 %	60 %	20 %	20 %	387128967
31	NC_017858	CGTCC	2	10	38046	38055	0 %	20 %	20 %	60 %	387128967
32	NC_017858	GAAGT	2	10	39222	39231	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017858	CAGCA	2	10	43175	43184	40 %	0 %	20 %	40 %	387128974
34	NC_017858	TGCTG	2	10	43297	43306	0 %	40 %	40 %	20 %	387128974
35	NC_017858	GCTTC	2	10	43351	43360	0 %	40 %	20 %	40 %	387128974
36	NC_017858	AGGGT	2	10	43929	43938	20 %	20 %	60 %	0 %	387128974
37	NC_017858	AAGGG	2	10	45773	45782	40 %	0 %	60 %	0 %	387128977

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.