MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Methylophaga sp. JAM7 plasmid unnamed

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017858	A	7	7	1946	1952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017858	T	6	6	2957	2962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017858	T	6	6	2970	2975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017858	T	6	6	3019	3024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017858	G	7	7	3249	3255	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017858	G	6	6	3292	3297	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017858	C	6	6	3301	3306	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8	NC_017858	T	6	6	3388	3393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017858	A	6	6	3429	3434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017858	T	6	6	3462	3467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017858	G	6	6	3679	3684	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017858	C	6	6	3698	3703	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13	NC_017858	A	6	6	3980	3985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017858	T	6	6	5114	5119	0 %	100 %	0 %	0 %	387128930
15	NC_017858	A	7	7	5984	5990	100 %	0 %	0 %	0 %	387128932
16	NC_017858	T	7	7	6028	6034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017858	A	6	6	6075	6080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017858	T	6	6	6191	6196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017858	A	6	6	8543	8548	100 %	0 %	0 %	0 %	387128936
20	NC_017858	A	6	6	10101	10106	100 %	0 %	0 %	0 %	387128936
21	NC_017858	A	6	6	12378	12383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017858	A	6	6	12779	12784	100 %	0 %	0 %	0 %	387128940
23	NC_017858	T	6	6	15244	15249	0 %	100 %	0 %	0 %	387128943
24	NC_017858	C	6	6	15674	15679	0 %	0 %	0 %	100 %	387128943
25	NC_017858	T	6	6	15691	15696	0 %	100 %	0 %	0 %	387128943
26	NC_017858	T	6	6	17064	17069	0 %	100 %	0 %	0 %	387128944
27	NC_017858	A	6	6	18210	18215	100 %	0 %	0 %	0 %	387128944
28	NC_017858	T	7	7	22031	22037	0 %	100 %	0 %	0 %	387128949
29	NC_017858	A	6	6	22546	22551	100 %	0 %	0 %	0 %	387128952
30	NC_017858	A	6	6	22590	22595	100 %	0 %	0 %	0 %	387128952
31	NC_017858	A	6	6	23388	23393	100 %	0 %	0 %	0 %	387128954
32	NC_017858	T	6	6	26325	26330	0 %	100 %	0 %	0 %	387128959
33	NC_017858	T	6	6	26488	26493	0 %	100 %	0 %	0 %	387128959
34	NC_017858	T	6	6	26991	26996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017858	C	6	6	27052	27057	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
36	NC_017858	T	6	6	27439	27444	0 %	100 %	0 %	0 %	387128960
37	NC_017858	T	6	6	27568	27573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017858	G	6	6	28358	28363	0 %	0 %	100 %	0 %	387128961
39	NC_017858	G	6	6	29698	29703	0 %	0 %	100 %	0 %	387128962
40	NC_017858	T	6	6	31658	31663	0 %	100 %	0 %	0 %	387128962
41	NC_017858	G	6	6	34359	34364	0 %	0 %	100 %	0 %	387128965
42	NC_017858	T	6	6	36892	36897	0 %	100 %	0 %	0 %	387128967
43	NC_017858	T	6	6	37455	37460	0 %	100 %	0 %	0 %	387128967
44	NC_017858	T	6	6	37725	37730	0 %	100 %	0 %	0 %	387128967
45	NC_017858	T	6	6	38694	38699	0 %	100 %	0 %	0 %	387128967
46	NC_017858	G	6	6	40860	40865	0 %	0 %	100 %	0 %	387128971
47	NC_017858	A	6	6	40873	40878	100 %	0 %	0 %	0 %	387128971
48	NC_017858	C	6	6	42044	42049	0 %	0 %	0 %	100 %	387128972
49	NC_017858	A	6	6	42918	42923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017858	A	6	6	43002	43007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017858	A	8	8	44084	44091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017858	T	7	7	45463	45469	0 %	100 %	0 %	0 %	387128977
53	NC_017858	A	6	6	45963	45968	100 %	0 %	0 %	0 %	387128977
54	NC_017858	T	6	6	47059	47064	0 %	100 %	0 %	0 %	387128980

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.