MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 1058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017857	ATCGTA	2	12	2926894	2926905	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387128706
1002	NC_017857	CATTTT	2	12	2930226	2930237	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387128709
1003	NC_017857	CTCTTT	2	12	2935383	2935394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387128714
1004	NC_017857	GCCACC	2	12	2936226	2936237	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	387128714
1005	NC_017857	CATCAA	2	12	2942150	2942161	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387128719
1006	NC_017857	GGCAAT	2	12	2950760	2950771	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387128726
1007	NC_017857	TAAAAT	2	12	2952939	2952950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017857	TGACGA	2	12	2954227	2954238	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387128731
1009	NC_017857	CAGGAT	2	12	2956661	2956672	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387128733
1010	NC_017857	ACGTTG	2	12	2959963	2959974	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387128737
1011	NC_017857	ATACCA	2	12	2961571	2961582	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387128739
1012	NC_017857	TACCGG	2	12	2966058	2966069	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387128744
1013	NC_017857	ACGCAT	2	12	2973436	2973447	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387128749
1014	NC_017857	AATTTG	2	12	2975541	2975552	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387128752
1015	NC_017857	GCCGGT	2	12	2980771	2980782	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	387128759
1016	NC_017857	TTTCCG	2	12	2988453	2988464	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387128766
1017	NC_017857	GCCGAA	2	12	2991514	2991525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128770
1018	NC_017857	ATAGGC	2	12	2995231	2995242	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387128774
1019	NC_017857	TGGTAA	2	12	2998241	2998252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128777
1020	NC_017857	GCCGGA	2	12	2998738	2998749	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	387128778
1021	NC_017857	TTGGTT	2	12	3013064	3013075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387128794
1022	NC_017857	TGGTTT	2	12	3013083	3013094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387128794
1023	NC_017857	GGTTCA	2	12	3013315	3013326	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387128794
1024	NC_017857	CATGCC	2	12	3014937	3014948	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387128794
1025	NC_017857	AGGATC	2	12	3027483	3027494	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387128805
1026	NC_017857	AGCCTG	2	12	3029755	3029766	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387128807
1027	NC_017857	GCATCG	2	12	3030318	3030329	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_017857	TGTTCC	2	12	3036314	3036325	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387128817
1029	NC_017857	GTTATT	2	12	3042110	3042121	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_017857	GCCAAT	2	12	3047639	3047650	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387128831
1031	NC_017857	CCGGTA	2	12	3051337	3051348	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387128834
1032	NC_017857	GCCATT	2	12	3052778	3052789	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387128836
1033	NC_017857	TTAATT	2	12	3052991	3053002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387128836
1034	NC_017857	CATCTT	2	12	3053398	3053409	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387128837
1035	NC_017857	AACGCA	2	12	3058541	3058552	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387128842
1036	NC_017857	TGTCTA	2	12	3060890	3060901	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387128844
1037	NC_017857	TTGCCT	2	12	3061285	3061296	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387128844
1038	NC_017857	AACTGC	2	12	3063139	3063150	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387128848
1039	NC_017857	TTGCTG	2	12	3066168	3066179	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387128850
1040	NC_017857	AGTTTT	2	12	3070051	3070062	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017857	TGGATA	2	12	3071238	3071249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128855
1042	NC_017857	CCTATA	2	12	3071677	3071688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387128856
1043	NC_017857	GTATTT	2	12	3072111	3072122	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387128856
1044	NC_017857	TTGGTT	2	12	3073337	3073348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387128857
1045	NC_017857	GCAATT	2	12	3079802	3079813	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1046	NC_017857	CAGTTT	2	12	3081827	3081838	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387128865
1047	NC_017857	AGCAAG	2	12	3082035	3082046	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387128865
1048	NC_017857	ATCACC	2	12	3086456	3086467	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	387128871
1049	NC_017857	AGCGAA	2	12	3087789	3087800	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1050	NC_017857	CAATCA	2	12	3089429	3089440	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387128875
1051	NC_017857	TTCAAT	2	12	3090882	3090893	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387128876
1052	NC_017857	CTTCTG	2	12	3094621	3094632	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387128881
1053	NC_017857	AGCAAT	2	12	3097505	3097516	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387128884
1054	NC_017857	ATCAGA	2	12	3102121	3102132	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387128889
1055	NC_017857	ACTGAA	2	12	3102563	3102574	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387128890
1056	NC_017857	GCACCG	2	12	3104453	3104464	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	387128892
1057	NC_017857	AGTAAC	2	12	3111841	3111852	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387128901
1058	NC_017857	CAATTT	2	12	3132444	3132455	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

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