MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 8183

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017857	GTGG	2	8	252	259	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017857	AATC	2	8	437	444	50 %	25 %	0 %	25 %	387125903
3	NC_017857	TGGC	2	8	802	809	0 %	25 %	50 %	25 %	387125903
4	NC_017857	ACTT	2	8	1454	1461	25 %	50 %	0 %	25 %	387125904
5	NC_017857	TGAG	2	8	2312	2319	25 %	25 %	50 %	0 %	387125905
6	NC_017857	TCGC	2	8	2630	2637	0 %	25 %	25 %	50 %	387125906
7	NC_017857	CTTC	2	8	2832	2839	0 %	50 %	0 %	50 %	387125906
8	NC_017857	AACA	2	8	3041	3048	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017857	ATTA	2	8	4408	4415	50 %	50 %	0 %	0 %	387125908
10	NC_017857	AATC	2	8	5984	5991	50 %	25 %	0 %	25 %	387125910
11	NC_017857	GAAT	2	8	6134	6141	50 %	25 %	25 %	0 %	387125910
12	NC_017857	CAAA	2	8	6163	6170	75 %	0 %	0 %	25 %	387125910
13	NC_017857	AAAT	2	8	6434	6441	75 %	25 %	0 %	0 %	387125910
14	NC_017857	ATCA	2	8	6985	6992	50 %	25 %	0 %	25 %	387125911
15	NC_017857	TCCT	2	8	7079	7086	0 %	50 %	0 %	50 %	387125912
16	NC_017857	ACAA	2	8	7671	7678	75 %	0 %	0 %	25 %	387125912
17	NC_017857	TAGT	2	8	7999	8006	25 %	50 %	25 %	0 %	387125912
18	NC_017857	TCTG	2	8	8074	8081	0 %	50 %	25 %	25 %	387125913
19	NC_017857	TTGA	2	8	8850	8857	25 %	50 %	25 %	0 %	387125914
20	NC_017857	CACC	2	8	9023	9030	25 %	0 %	0 %	75 %	387125914
21	NC_017857	GTTT	2	8	9932	9939	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017857	AGCG	2	8	12005	12012	25 %	0 %	50 %	25 %	387125917
23	NC_017857	CGCC	2	8	12722	12729	0 %	0 %	25 %	75 %	387125917
24	NC_017857	GTTT	2	8	13338	13345	0 %	75 %	25 %	0 %	387125917
25	NC_017857	CAAC	2	8	13572	13579	50 %	0 %	0 %	50 %	387125917
26	NC_017857	CTGT	2	8	13597	13604	0 %	50 %	25 %	25 %	387125917
27	NC_017857	TGAA	2	8	13851	13858	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017857	CATT	2	8	14032	14039	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017857	GACA	2	8	14068	14075	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017857	TGGT	2	8	14220	14227	0 %	50 %	50 %	0 %	387125918
31	NC_017857	TTCA	2	8	14768	14775	25 %	50 %	0 %	25 %	387125919
32	NC_017857	GGAC	2	8	16353	16360	25 %	0 %	50 %	25 %	387125920
33	NC_017857	TGCT	2	8	16650	16657	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017857	AATT	2	8	16784	16791	50 %	50 %	0 %	0 %	387125921
35	NC_017857	ATTG	2	8	16938	16945	25 %	50 %	25 %	0 %	387125921
36	NC_017857	ACCA	2	8	16983	16990	50 %	0 %	0 %	50 %	387125921
37	NC_017857	CAAA	2	8	17017	17024	75 %	0 %	0 %	25 %	387125921
38	NC_017857	CCAG	2	8	17030	17037	25 %	0 %	25 %	50 %	387125921
39	NC_017857	AGTC	2	8	17185	17192	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017857	CTGC	2	8	17408	17415	0 %	25 %	25 %	50 %	387125922
41	NC_017857	CCAA	2	8	17647	17654	50 %	0 %	0 %	50 %	387125922
42	NC_017857	CAAT	2	8	18009	18016	50 %	25 %	0 %	25 %	387125922
43	NC_017857	TTAG	2	8	18218	18225	25 %	50 %	25 %	0 %	387125922
44	NC_017857	GTTC	2	8	18315	18322	0 %	50 %	25 %	25 %	387125922
45	NC_017857	TGGG	2	8	18752	18759	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017857	CAAT	2	8	18957	18964	50 %	25 %	0 %	25 %	387125923
47	NC_017857	ATTC	2	8	19583	19590	25 %	50 %	0 %	25 %	387125923
48	NC_017857	TCAG	2	8	19881	19888	25 %	25 %	25 %	25 %	387125923
49	NC_017857	CCAG	2	8	19896	19903	25 %	0 %	25 %	50 %	387125923
50	NC_017857	TCGC	2	8	20013	20020	0 %	25 %	25 %	50 %	387125923
51	NC_017857	TCAG	2	8	20202	20209	25 %	25 %	25 %	25 %	387125923
52	NC_017857	GAAA	2	8	21614	21621	75 %	0 %	25 %	0 %	387125925
53	NC_017857	TACA	2	8	22328	22335	50 %	25 %	0 %	25 %	387125926
54	NC_017857	CGGC	2	8	22344	22351	0 %	0 %	50 %	50 %	387125926
55	NC_017857	TTTG	2	8	22480	22487	0 %	75 %	25 %	0 %	387125926
56	NC_017857	TCAG	2	8	22527	22534	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017857	TACT	2	8	22879	22886	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017857	AAAC	2	8	23039	23046	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017857	ACCA	2	8	23096	23103	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017857	ATTT	2	8	23599	23606	25 %	75 %	0 %	0 %	387125928
61	NC_017857	TGAT	2	8	23859	23866	25 %	50 %	25 %	0 %	387125928
62	NC_017857	ATTT	2	8	23993	24000	25 %	75 %	0 %	0 %	387125928
63	NC_017857	CTGA	2	8	24077	24084	25 %	25 %	25 %	25 %	387125928
64	NC_017857	ATCG	2	8	24149	24156	25 %	25 %	25 %	25 %	387125928
65	NC_017857	TTGG	2	8	24875	24882	0 %	50 %	50 %	0 %	387125928
66	NC_017857	TTGA	2	8	25371	25378	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017857	GCTG	2	8	26268	26275	0 %	25 %	50 %	25 %	387125929
68	NC_017857	GTTG	2	8	26549	26556	0 %	50 %	50 %	0 %	387125929
69	NC_017857	AAAC	2	8	26959	26966	75 %	0 %	0 %	25 %	387125929
70	NC_017857	CAGG	2	8	29608	29615	25 %	0 %	50 %	25 %	387125932
71	NC_017857	TGGA	2	8	29879	29886	25 %	25 %	50 %	0 %	387125932
72	NC_017857	ATTC	2	8	30686	30693	25 %	50 %	0 %	25 %	387125933
73	NC_017857	ATTC	2	8	30822	30829	25 %	50 %	0 %	25 %	387125933
74	NC_017857	CAAG	2	8	31342	31349	50 %	0 %	25 %	25 %	387125933
75	NC_017857	AAAC	2	8	31861	31868	75 %	0 %	0 %	25 %	387125934
76	NC_017857	TGGC	2	8	32268	32275	0 %	25 %	50 %	25 %	387125934
77	NC_017857	CAGC	2	8	33002	33009	25 %	0 %	25 %	50 %	387125935
78	NC_017857	TCTA	2	8	33426	33433	25 %	50 %	0 %	25 %	387125935
79	NC_017857	ATGC	2	8	33590	33597	25 %	25 %	25 %	25 %	387125935
80	NC_017857	AAAT	2	8	34059	34066	75 %	25 %	0 %	0 %	387125935
81	NC_017857	TTTA	2	8	34472	34479	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017857	ATGA	2	8	34705	34712	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017857	CATA	2	8	34764	34771	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017857	GTGA	2	8	34905	34912	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017857	CAAG	2	8	35176	35183	50 %	0 %	25 %	25 %	387125937
86	NC_017857	GTAT	2	8	35361	35368	25 %	50 %	25 %	0 %	387125938
87	NC_017857	GCAG	2	8	35424	35431	25 %	0 %	50 %	25 %	387125938
88	NC_017857	AATT	2	8	35459	35466	50 %	50 %	0 %	0 %	387125938
89	NC_017857	GATG	2	8	35469	35476	25 %	25 %	50 %	0 %	387125938
90	NC_017857	CAGC	2	8	35747	35754	25 %	0 %	25 %	50 %	387125939
91	NC_017857	GCCA	2	8	36849	36856	25 %	0 %	25 %	50 %	387125940
92	NC_017857	AGTC	2	8	37495	37502	25 %	25 %	25 %	25 %	387125940
93	NC_017857	AATT	2	8	38447	38454	50 %	50 %	0 %	0 %	387125941
94	NC_017857	TCAG	2	8	38528	38535	25 %	25 %	25 %	25 %	387125941
95	NC_017857	GATT	2	8	39390	39397	25 %	50 %	25 %	0 %	387125941
96	NC_017857	ATTT	2	8	40208	40215	25 %	75 %	0 %	0 %	387125941
97	NC_017857	GCAG	2	8	40440	40447	25 %	0 %	50 %	25 %	387125941
98	NC_017857	CAGC	2	8	40602	40609	25 %	0 %	25 %	50 %	387125941
99	NC_017857	CGCT	2	8	40673	40680	0 %	25 %	25 %	50 %	387125941
100	NC_017857	TAAA	2	8	41897	41904	75 %	25 %	0 %	0 %	387125941
101	NC_017857	TGAT	2	8	42173	42180	25 %	50 %	25 %	0 %	387125941
102	NC_017857	ATCA	2	8	42327	42334	50 %	25 %	0 %	25 %	387125941
103	NC_017857	CCTA	2	8	42511	42518	25 %	25 %	0 %	50 %	387125941
104	NC_017857	AACA	2	8	42998	43005	75 %	0 %	0 %	25 %	387125941
105	NC_017857	ATGG	2	8	43042	43049	25 %	25 %	50 %	0 %	387125941
106	NC_017857	AGAA	2	8	43284	43291	75 %	0 %	25 %	0 %	387125942
107	NC_017857	CTGA	2	8	43385	43392	25 %	25 %	25 %	25 %	387125942
108	NC_017857	TGAT	2	8	43455	43462	25 %	50 %	25 %	0 %	387125942
109	NC_017857	ATCA	2	8	43856	43863	50 %	25 %	0 %	25 %	387125943
110	NC_017857	TGGC	2	8	44094	44101	0 %	25 %	50 %	25 %	387125943
111	NC_017857	CTGG	2	8	44230	44237	0 %	25 %	50 %	25 %	387125943
112	NC_017857	GCTG	2	8	45381	45388	0 %	25 %	50 %	25 %	387125943
113	NC_017857	GCCG	2	8	45562	45569	0 %	0 %	50 %	50 %	387125943
114	NC_017857	GACT	2	8	46440	46447	25 %	25 %	25 %	25 %	387125944
115	NC_017857	AGCT	2	8	46960	46967	25 %	25 %	25 %	25 %	387125944
116	NC_017857	GATT	2	8	47204	47211	25 %	50 %	25 %	0 %	387125945
117	NC_017857	CTGA	2	8	48082	48089	25 %	25 %	25 %	25 %	387125946
118	NC_017857	TGGT	2	8	48539	48546	0 %	50 %	50 %	0 %	387125946
119	NC_017857	TTAT	2	8	49625	49632	25 %	75 %	0 %	0 %	387125947
120	NC_017857	GCGG	2	8	49819	49826	0 %	0 %	75 %	25 %	387125947
121	NC_017857	ATCG	2	8	49947	49954	25 %	25 %	25 %	25 %	387125948
122	NC_017857	GACC	2	8	50072	50079	25 %	0 %	25 %	50 %	387125948
123	NC_017857	TAAG	2	8	50450	50457	50 %	25 %	25 %	0 %	387125948
124	NC_017857	ATCC	2	8	50693	50700	25 %	25 %	0 %	50 %	387125949
125	NC_017857	TGAG	2	8	51376	51383	25 %	25 %	50 %	0 %	387125950
126	NC_017857	TCTA	2	8	51555	51562	25 %	50 %	0 %	25 %	387125951
127	NC_017857	TAAA	2	8	51624	51631	75 %	25 %	0 %	0 %	387125951
128	NC_017857	TGAT	2	8	52008	52015	25 %	50 %	25 %	0 %	387125951
129	NC_017857	TGGC	2	8	52578	52585	0 %	25 %	50 %	25 %	387125952
130	NC_017857	GTTG	2	8	52625	52632	0 %	50 %	50 %	0 %	387125952
131	NC_017857	AATC	2	8	52668	52675	50 %	25 %	0 %	25 %	387125952
132	NC_017857	CAGC	2	8	53203	53210	25 %	0 %	25 %	50 %	387125952
133	NC_017857	AATC	2	8	53759	53766	50 %	25 %	0 %	25 %	387125953
134	NC_017857	GCTC	2	8	54137	54144	0 %	25 %	25 %	50 %	387125953
135	NC_017857	CGAT	2	8	54393	54400	25 %	25 %	25 %	25 %	387125953
136	NC_017857	TTAA	2	8	55256	55263	50 %	50 %	0 %	0 %	387125955
137	NC_017857	GGCA	2	8	56205	56212	25 %	0 %	50 %	25 %	387125955
138	NC_017857	GAAA	2	8	56313	56320	75 %	0 %	25 %	0 %	387125955
139	NC_017857	AATT	2	8	56742	56749	50 %	50 %	0 %	0 %	387125956
140	NC_017857	AGTC	2	8	57011	57018	25 %	25 %	25 %	25 %	387125956
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142	NC_017857	AATA	2	8	57469	57476	75 %	25 %	0 %	0 %	387125956
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