MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 1109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017857	GTGG	2	8	252	259	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017857	AACA	2	8	3041	3048	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017857	GTTT	2	8	9932	9939	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017857	TGAA	2	8	13851	13858	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017857	CATT	2	8	14032	14039	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017857	GACA	2	8	14068	14075	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017857	TGCT	2	8	16650	16657	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017857	AGTC	2	8	17185	17192	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017857	TGGG	2	8	18752	18759	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017857	TCAG	2	8	22527	22534	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017857	TACT	2	8	22879	22886	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017857	AAAC	2	8	23039	23046	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017857	ACCA	2	8	23096	23103	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017857	TTGA	2	8	25371	25378	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017857	TTTA	2	8	34472	34479	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017857	ATGA	2	8	34705	34712	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017857	CATA	2	8	34764	34771	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017857	GTGA	2	8	34905	34912	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017857	CGAA	2	8	64910	64917	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017857	TTGG	2	8	67366	67373	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017857	TACA	2	8	68612	68619	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017857	GTCG	2	8	71209	71216	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017857	TCCA	2	8	71265	71272	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017857	TTGA	2	8	71355	71362	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017857	TATT	2	8	73663	73670	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017857	CAGA	2	8	82983	82990	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017857	AACT	2	8	86564	86571	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017857	AATT	2	8	87188	87195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017857	GTCA	2	8	89120	89127	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017857	AGTT	2	8	90647	90654	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017857	TAGA	2	8	92321	92328	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017857	TTTG	2	8	97122	97129	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017857	TGAA	2	8	97184	97191	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017857	TTTA	2	8	98238	98245	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017857	ATGG	2	8	101174	101181	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017857	TAAA	2	8	101291	101298	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017857	GCAG	2	8	101339	101346	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017857	CGTC	2	8	101485	101492	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017857	CAGC	2	8	103040	103047	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017857	CAAA	2	8	103071	103078	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017857	ATTC	2	8	103952	103959	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017857	AACA	2	8	103988	103995	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017857	GAAT	2	8	104258	104265	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017857	TGAT	2	8	104326	104333	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017857	CGCC	2	8	104705	104712	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
46	NC_017857	ACCG	2	8	105173	105180	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017857	TCAG	2	8	105277	105284	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017857	ACCG	2	8	105312	105319	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017857	TGCT	2	8	108011	108018	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017857	GAAA	2	8	108057	108064	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017857	TGTC	2	8	109407	109414	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017857	ACGC	2	8	119846	119853	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017857	AATC	2	8	119885	119892	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017857	CGTT	2	8	130502	130509	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017857	TTTA	2	8	139735	139742	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017857	TTCA	2	8	141105	141112	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017857	CAAA	2	8	150172	150179	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017857	CTTG	2	8	150480	150487	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017857	CTGA	2	8	153432	153439	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017857	CTGT	2	8	159404	159411	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017857	AAAT	2	8	165946	165953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017857	TAAC	2	8	167484	167491	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017857	TAAG	2	8	176259	176266	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017857	TGAA	2	8	180085	180092	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017857	TGAT	2	8	180244	180251	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017857	TTCT	2	8	189934	189941	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017857	AATT	2	8	193965	193972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017857	AATT	2	8	195585	195592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017857	ACTG	2	8	195787	195794	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017857	AAAG	2	8	195995	196002	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017857	TATT	2	8	199704	199711	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017857	ATTA	2	8	201335	201342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017857	GCTC	2	8	201352	201359	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017857	AAAT	2	8	203386	203393	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017857	TAAA	2	8	203466	203473	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017857	AAGC	2	8	205927	205934	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017857	TCAG	2	8	207697	207704	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017857	TCTA	2	8	214400	214407	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017857	AACG	2	8	216286	216293	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017857	TCTT	2	8	216300	216307	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017857	ATAA	2	8	227453	227460	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017857	TTTG	2	8	228359	228366	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017857	TATT	2	8	229748	229755	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017857	CAAA	2	8	231166	231173	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017857	TGCT	2	8	233914	233921	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017857	CGTA	2	8	233927	233934	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017857	ATTT	2	8	238255	238262	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017857	TAAA	2	8	238319	238326	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017857	GTCT	2	8	243947	243954	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017857	CAAT	2	8	253703	253710	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017857	ATTT	2	8	274603	274610	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017857	AGCG	2	8	274676	274683	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017857	TACA	2	8	274887	274894	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017857	ATTG	2	8	275009	275016	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017857	ATAA	2	8	275036	275043	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017857	CCAG	2	8	278358	278365	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017857	ACGC	2	8	283593	283600	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017857	CTTT	2	8	283639	283646	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017857	AAAC	2	8	284123	284130	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017857	GTTT	2	8	284206	284213	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017857	TAAA	2	8	286689	286696	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017857	CTTT	2	8	287895	287902	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017857	GTAT	2	8	287973	287980	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017857	TTTA	2	8	288113	288120	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017857	GGTT	2	8	288140	288147	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017857	TAAA	2	8	305539	305546	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017857	GATC	2	8	305665	305672	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017857	TTTA	2	8	308214	308221	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017857	CAAA	2	8	313100	313107	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017857	GCTG	2	8	315377	315384	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017857	TTTA	2	8	319508	319515	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017857	ACTA	2	8	323148	323155	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017857	ACAA	2	8	323276	323283	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017857	GCAT	2	8	326982	326989	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017857	TTAT	2	8	330688	330695	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017857	AATT	2	8	339761	339768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017857	TAAA	2	8	345119	345126	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017857	TTTC	2	8	345184	345191	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017857	AGAC	2	8	345995	346002	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017857	TCTG	2	8	351263	351270	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017857	AAAT	2	8	351455	351462	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017857	CAAT	2	8	352254	352261	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017857	AGCC	2	8	352329	352336	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017857	TGAT	2	8	356565	356572	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017857	GATT	2	8	356623	356630	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017857	ATTA	2	8	356978	356985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017857	CCAC	2	8	363971	363978	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
128	NC_017857	AAAC	2	8	364208	364215	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017857	CATT	2	8	368586	368593	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017857	CTTA	2	8	368619	368626	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017857	TAAC	2	8	369931	369938	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017857	TATT	2	8	369967	369974	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017857	CTTG	2	8	373180	373187	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017857	GGCG	2	8	373391	373398	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017857	TTGA	2	8	373546	373553	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017857	AATG	2	8	374728	374735	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017857	CAAA	2	8	374776	374783	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017857	AAAC	2	8	375110	375117	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017857	ATGG	2	8	375147	375154	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017857	AACC	2	8	378848	378855	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017857	GAAT	2	8	379243	379250	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017857	AAAG	2	8	379359	379366	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017857	CGGT	2	8	379465	379472	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017857	GATG	2	8	379721	379728	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017857	ATTT	2	8	379919	379926	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017857	AATC	2	8	379979	379986	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017857	GAAA	2	8	386721	386728	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017857	TAAA	2	8	386850	386857	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017857	ATAA	2	8	387268	387275	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_017857	TGAC	2	8	390835	390842	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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