MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 3256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017857	TA	5	10	504	513	50 %	50 %	0 %	0 %	387125903
2	NC_017857	CA	3	6	1348	1353	50 %	0 %	0 %	50 %	387125904
3	NC_017857	TC	3	6	2289	2294	0 %	50 %	0 %	50 %	387125905
4	NC_017857	AT	3	6	3548	3553	50 %	50 %	0 %	0 %	387125907
5	NC_017857	TC	3	6	4030	4035	0 %	50 %	0 %	50 %	387125907
6	NC_017857	GA	3	6	4126	4131	50 %	0 %	50 %	0 %	387125907
7	NC_017857	AT	3	6	5396	5401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017857	TG	3	6	5467	5472	0 %	50 %	50 %	0 %	387125909
9	NC_017857	TC	3	6	5990	5995	0 %	50 %	0 %	50 %	387125910
10	NC_017857	CA	3	6	6695	6700	50 %	0 %	0 %	50 %	387125911
11	NC_017857	TA	3	6	8454	8459	50 %	50 %	0 %	0 %	387125913
12	NC_017857	AC	3	6	11375	11380	50 %	0 %	0 %	50 %	387125917
13	NC_017857	TG	3	6	12262	12267	0 %	50 %	50 %	0 %	387125917
14	NC_017857	AG	3	6	13225	13230	50 %	0 %	50 %	0 %	387125917
15	NC_017857	GA	3	6	13713	13718	50 %	0 %	50 %	0 %	387125917
16	NC_017857	AC	3	6	13916	13921	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017857	GC	3	6	16133	16138	0 %	0 %	50 %	50 %	387125919
18	NC_017857	CA	3	6	17243	17248	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017857	AG	3	6	18715	18720	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017857	TC	3	6	22003	22008	0 %	50 %	0 %	50 %	387125926
21	NC_017857	AT	3	6	23003	23008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017857	CT	3	6	23517	23522	0 %	50 %	0 %	50 %	387125928
23	NC_017857	CG	3	6	24257	24262	0 %	0 %	50 %	50 %	387125928
24	NC_017857	AT	3	6	25479	25484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017857	CT	3	6	25501	25506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017857	CG	3	6	26615	26620	0 %	0 %	50 %	50 %	387125929
27	NC_017857	AC	3	6	27035	27040	50 %	0 %	0 %	50 %	387125929
28	NC_017857	CG	3	6	27204	27209	0 %	0 %	50 %	50 %	387125929
29	NC_017857	TG	3	6	27255	27260	0 %	50 %	50 %	0 %	387125929
30	NC_017857	TA	3	6	28757	28762	50 %	50 %	0 %	0 %	387125930
31	NC_017857	TC	3	6	29326	29331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017857	GC	3	6	30841	30846	0 %	0 %	50 %	50 %	387125933
33	NC_017857	GC	3	6	31233	31238	0 %	0 %	50 %	50 %	387125933
34	NC_017857	GT	3	6	32172	32177	0 %	50 %	50 %	0 %	387125934
35	NC_017857	TG	3	6	32759	32764	0 %	50 %	50 %	0 %	387125934
36	NC_017857	CA	4	8	34011	34018	50 %	0 %	0 %	50 %	387125935
37	NC_017857	CT	3	6	34263	34268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017857	TA	3	6	34634	34639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017857	AT	3	6	37548	37553	50 %	50 %	0 %	0 %	387125941
40	NC_017857	GA	3	6	37935	37940	50 %	0 %	50 %	0 %	387125941
41	NC_017857	TA	3	6	39467	39472	50 %	50 %	0 %	0 %	387125941
42	NC_017857	GT	3	6	40124	40129	0 %	50 %	50 %	0 %	387125941
43	NC_017857	TC	3	6	40279	40284	0 %	50 %	0 %	50 %	387125941
44	NC_017857	GC	3	6	42153	42158	0 %	0 %	50 %	50 %	387125941
45	NC_017857	TC	3	6	42254	42259	0 %	50 %	0 %	50 %	387125941
46	NC_017857	GC	3	6	44063	44068	0 %	0 %	50 %	50 %	387125943
47	NC_017857	TC	3	6	44493	44498	0 %	50 %	0 %	50 %	387125943
48	NC_017857	AC	3	6	44706	44711	50 %	0 %	0 %	50 %	387125943
49	NC_017857	AC	4	8	44794	44801	50 %	0 %	0 %	50 %	387125943
50	NC_017857	GC	3	6	45314	45319	0 %	0 %	50 %	50 %	387125943
51	NC_017857	AT	3	6	45734	45739	50 %	50 %	0 %	0 %	387125944
52	NC_017857	TC	3	6	49063	49068	0 %	50 %	0 %	50 %	387125947
53	NC_017857	GT	3	6	50237	50242	0 %	50 %	50 %	0 %	387125948
54	NC_017857	TG	3	6	51256	51261	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017857	GT	3	6	54731	54736	0 %	50 %	50 %	0 %	387125954
56	NC_017857	AG	3	6	55070	55075	50 %	0 %	50 %	0 %	387125954
57	NC_017857	AC	3	6	56361	56366	50 %	0 %	0 %	50 %	387125955
58	NC_017857	AT	3	6	58042	58047	50 %	50 %	0 %	0 %	387125956
59	NC_017857	AT	3	6	59682	59687	50 %	50 %	0 %	0 %	387125959
60	NC_017857	TA	3	6	63611	63616	50 %	50 %	0 %	0 %	387125963
61	NC_017857	CT	3	6	64087	64092	0 %	50 %	0 %	50 %	387125964
62	NC_017857	TG	3	6	64764	64769	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017857	GT	3	6	64875	64880	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017857	TA	4	8	64882	64889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017857	GA	3	6	65113	65118	50 %	0 %	50 %	0 %	387125965
66	NC_017857	CT	3	6	65386	65391	0 %	50 %	0 %	50 %	387125965
67	NC_017857	GA	3	6	68026	68031	50 %	0 %	50 %	0 %	387125966
68	NC_017857	GC	3	6	69707	69712	0 %	0 %	50 %	50 %	387125967
69	NC_017857	CT	3	6	70541	70546	0 %	50 %	0 %	50 %	387125969
70	NC_017857	GC	3	6	70648	70653	0 %	0 %	50 %	50 %	387125969
71	NC_017857	AT	3	6	72145	72150	50 %	50 %	0 %	0 %	387125971
72	NC_017857	CT	3	6	75819	75824	0 %	50 %	0 %	50 %	387125975
73	NC_017857	TC	3	6	76451	76456	0 %	50 %	0 %	50 %	387125975
74	NC_017857	AC	3	6	78290	78295	50 %	0 %	0 %	50 %	387125977
75	NC_017857	AT	3	6	78844	78849	50 %	50 %	0 %	0 %	387125978
76	NC_017857	GT	3	6	79312	79317	0 %	50 %	50 %	0 %	387125978
77	NC_017857	CG	3	6	79861	79866	0 %	0 %	50 %	50 %	387125979
78	NC_017857	TA	4	8	79868	79875	50 %	50 %	0 %	0 %	387125979
79	NC_017857	AT	3	6	80023	80028	50 %	50 %	0 %	0 %	387125979
80	NC_017857	CA	3	6	80631	80636	50 %	0 %	0 %	50 %	387125979
81	NC_017857	CT	3	6	83855	83860	0 %	50 %	0 %	50 %	387125984
82	NC_017857	AG	3	6	86027	86032	50 %	0 %	50 %	0 %	387125985
83	NC_017857	TA	3	6	87995	88000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017857	CA	3	6	89293	89298	50 %	0 %	0 %	50 %	387125992
85	NC_017857	TC	3	6	90730	90735	0 %	50 %	0 %	50 %	387125993
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87	NC_017857	CG	3	6	93334	93339	0 %	0 %	50 %	50 %	387125994
88	NC_017857	AT	3	6	94384	94389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017857	AT	3	6	94402	94407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017857	AT	4	8	94416	94423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017857	AC	3	6	94884	94889	50 %	0 %	0 %	50 %	387125995
92	NC_017857	GC	3	6	96222	96227	0 %	0 %	50 %	50 %	387125996
93	NC_017857	TC	3	6	97544	97549	0 %	50 %	0 %	50 %	387125998
94	NC_017857	AG	3	6	98186	98191	50 %	0 %	50 %	0 %	387125998
95	NC_017857	AG	3	6	99264	99269	50 %	0 %	50 %	0 %	387126000
96	NC_017857	GA	3	6	100340	100345	50 %	0 %	50 %	0 %	387126002
97	NC_017857	TG	3	6	101192	101197	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017857	GA	3	6	102242	102247	50 %	0 %	50 %	0 %	387126004
99	NC_017857	GT	3	6	102337	102342	0 %	50 %	50 %	0 %	387126004
100	NC_017857	GT	3	6	103630	103635	0 %	50 %	50 %	0 %	387126005
101	NC_017857	TC	3	6	104141	104146	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017857	CA	3	6	104240	104245	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017857	AC	3	6	105862	105867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017857	AT	3	6	108468	108473	50 %	50 %	0 %	0 %	387126008
105	NC_017857	TG	3	6	108671	108676	0 %	50 %	50 %	0 %	387126009
106	NC_017857	CG	3	6	109512	109517	0 %	0 %	50 %	50 %	387126010
107	NC_017857	GA	3	6	110900	110905	50 %	0 %	50 %	0 %	387126011
108	NC_017857	CA	3	6	111090	111095	50 %	0 %	0 %	50 %	387126011
109	NC_017857	TA	3	6	111170	111175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017857	CT	3	6	111446	111451	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017857	AG	3	6	112357	112362	50 %	0 %	50 %	0 %	387126013
112	NC_017857	GA	3	6	114271	114276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017857	TG	4	8	115162	115169	0 %	50 %	50 %	0 %	387126016
114	NC_017857	TC	3	6	116929	116934	0 %	50 %	0 %	50 %	387126017
115	NC_017857	AT	3	6	116990	116995	50 %	50 %	0 %	0 %	387126017
116	NC_017857	TC	3	6	118702	118707	0 %	50 %	0 %	50 %	387126018
117	NC_017857	AC	3	6	119403	119408	50 %	0 %	0 %	50 %	387126018
118	NC_017857	AT	3	6	119989	119994	50 %	50 %	0 %	0 %	387126019
119	NC_017857	AT	3	6	120903	120908	50 %	50 %	0 %	0 %	387126019
120	NC_017857	GC	3	6	122128	122133	0 %	0 %	50 %	50 %	387126020
121	NC_017857	CA	3	6	122152	122157	50 %	0 %	0 %	50 %	387126020
122	NC_017857	TA	3	6	122490	122495	50 %	50 %	0 %	0 %	387126021
123	NC_017857	GC	3	6	124895	124900	0 %	0 %	50 %	50 %	387126023
124	NC_017857	GC	3	6	126266	126271	0 %	0 %	50 %	50 %	387126024
125	NC_017857	TA	3	6	126522	126527	50 %	50 %	0 %	0 %	387126024
126	NC_017857	GT	4	8	128176	128183	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017857	AC	3	6	131243	131248	50 %	0 %	0 %	50 %	387126028
128	NC_017857	AC	3	6	132177	132182	50 %	0 %	0 %	50 %	387126029
129	NC_017857	AC	3	6	132848	132853	50 %	0 %	0 %	50 %	387126031
130	NC_017857	CG	3	6	133141	133146	0 %	0 %	50 %	50 %	387126031
131	NC_017857	TG	3	6	134792	134797	0 %	50 %	50 %	0 %	387126032
132	NC_017857	TG	3	6	135203	135208	0 %	50 %	50 %	0 %	387126032
133	NC_017857	CT	3	6	139761	139766	0 %	50 %	0 %	50 %	387126038
134	NC_017857	TC	4	8	140225	140232	0 %	50 %	0 %	50 %	387126038
135	NC_017857	GC	4	8	142134	142141	0 %	0 %	50 %	50 %	387126040
136	NC_017857	CA	3	6	142525	142530	50 %	0 %	0 %	50 %	387126040
137	NC_017857	AT	3	6	143158	143163	50 %	50 %	0 %	0 %	387126041
138	NC_017857	TG	3	6	144405	144410	0 %	50 %	50 %	0 %	387126041
139	NC_017857	CT	3	6	145505	145510	0 %	50 %	0 %	50 %	387126041
140	NC_017857	AT	4	8	145692	145699	50 %	50 %	0 %	0 %	387126041
141	NC_017857	CT	3	6	146914	146919	0 %	50 %	0 %	50 %	387126042
142	NC_017857	GT	3	6	149017	149022	0 %	50 %	50 %	0 %	387126044
143	NC_017857	TA	3	6	149685	149690	50 %	50 %	0 %	0 %	387126044
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