MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methylophaga sp. JAM7 chromosome

Total Repeats: 1620

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017856	CCTGG	2	10	449	458	0 %	20 %	40 %	40 %	387128983
2	NC_017856	ATCCA	2	10	6022	6031	40 %	20 %	0 %	40 %	387128991
3	NC_017856	GACAA	2	10	6331	6340	60 %	0 %	20 %	20 %	387128992
4	NC_017856	ATTGG	2	10	6386	6395	20 %	40 %	40 %	0 %	387128992
5	NC_017856	ATGGC	2	10	6723	6732	20 %	20 %	40 %	20 %	387128992
6	NC_017856	AAACC	2	10	7028	7037	60 %	0 %	0 %	40 %	387128992
7	NC_017856	AGCCA	2	10	8665	8674	40 %	0 %	20 %	40 %	387128995
8	NC_017856	GTGAT	2	10	9791	9800	20 %	40 %	40 %	0 %	387128995
9	NC_017856	TTTGC	2	10	10065	10074	0 %	60 %	20 %	20 %	387128996
10	NC_017856	ATGCC	2	10	12782	12791	20 %	20 %	20 %	40 %	387128998
11	NC_017856	CCTGT	2	10	14922	14931	0 %	40 %	20 %	40 %	387128999
12	NC_017856	TTAAT	2	10	15113	15122	40 %	60 %	0 %	0 %	387128999
13	NC_017856	AGAAA	2	10	18319	18328	80 %	0 %	20 %	0 %	387129003
14	NC_017856	TCGAA	2	10	19420	19429	40 %	20 %	20 %	20 %	387129006
15	NC_017856	GCATG	2	10	22143	22152	20 %	20 %	40 %	20 %	387129009
16	NC_017856	TTTTC	2	10	22335	22344	0 %	80 %	0 %	20 %	387129009
17	NC_017856	CCAGC	2	10	24190	24199	20 %	0 %	20 %	60 %	387129010
18	NC_017856	ATGGT	2	10	31410	31419	20 %	40 %	40 %	0 %	387129017
19	NC_017856	CAGCG	2	10	31515	31524	20 %	0 %	40 %	40 %	387129018
20	NC_017856	CCATT	2	10	31772	31781	20 %	40 %	0 %	40 %	387129018
21	NC_017856	CAACA	2	10	31878	31887	60 %	0 %	0 %	40 %	387129018
22	NC_017856	CGCGT	2	10	35544	35553	0 %	20 %	40 %	40 %	387129023
23	NC_017856	CGCTG	2	10	36163	36172	0 %	20 %	40 %	40 %	387129023
24	NC_017856	TCGCC	2	10	36203	36212	0 %	20 %	20 %	60 %	387129023
25	NC_017856	GCGCG	2	10	36546	36555	0 %	0 %	60 %	40 %	387129023
26	NC_017856	AAGGC	2	10	36626	36635	40 %	0 %	40 %	20 %	387129023
27	NC_017856	CGCCC	2	10	36714	36723	0 %	0 %	20 %	80 %	387129023
28	NC_017856	CGGTG	2	10	37450	37459	0 %	20 %	60 %	20 %	387129023
29	NC_017856	GATTG	2	10	39129	39138	20 %	40 %	40 %	0 %	387129026
30	NC_017856	GGCTT	2	10	43204	43213	0 %	40 %	40 %	20 %	387129030
31	NC_017856	CAAGC	2	10	43416	43425	40 %	0 %	20 %	40 %	387129030
32	NC_017856	AAACG	2	10	45165	45174	60 %	0 %	20 %	20 %	387129033
33	NC_017856	CTTGC	2	10	46131	46140	0 %	40 %	20 %	40 %	387129033
34	NC_017856	GTTGT	2	10	46652	46661	0 %	60 %	40 %	0 %	387129033
35	NC_017856	TAACG	2	10	46857	46866	40 %	20 %	20 %	20 %	387129033
36	NC_017856	ATCCG	2	10	48576	48585	20 %	20 %	20 %	40 %	387129033
37	NC_017856	CCCAG	2	10	49884	49893	20 %	0 %	20 %	60 %	387129034
38	NC_017856	ATCGT	2	10	50649	50658	20 %	40 %	20 %	20 %	387129034
39	NC_017856	GTTGC	2	10	51327	51336	0 %	40 %	40 %	20 %	387129035
40	NC_017856	CTGCC	2	10	54321	54330	0 %	20 %	20 %	60 %	387129037
41	NC_017856	TTGCT	2	10	58443	58452	0 %	60 %	20 %	20 %	387129040
42	NC_017856	GAGGT	2	10	62973	62982	20 %	20 %	60 %	0 %	387129044
43	NC_017856	GCCAA	2	10	66380	66389	40 %	0 %	20 %	40 %	387129046
44	NC_017856	TCAAA	2	10	67972	67981	60 %	20 %	0 %	20 %	387129047
45	NC_017856	GCCTG	2	10	74890	74899	0 %	20 %	40 %	40 %	387129054
46	NC_017856	GCTTG	2	10	75549	75558	0 %	40 %	40 %	20 %	387129055
47	NC_017856	AATGA	2	10	86306	86315	60 %	20 %	20 %	0 %	387129066
48	NC_017856	CGCCA	2	10	86325	86334	20 %	0 %	20 %	60 %	387129066
49	NC_017856	ATGTT	2	10	86734	86743	20 %	60 %	20 %	0 %	387129066
50	NC_017856	AATGA	2	10	88429	88438	60 %	20 %	20 %	0 %	387129068
51	NC_017856	GGTTT	2	10	90625	90634	0 %	60 %	40 %	0 %	387129069
52	NC_017856	CTGAT	2	10	94683	94692	20 %	40 %	20 %	20 %	387129075
53	NC_017856	GCTTG	2	10	95402	95411	0 %	40 %	40 %	20 %	387129076
54	NC_017856	AGAAA	2	10	98838	98847	80 %	0 %	20 %	0 %	387129078
55	NC_017856	CGTTC	2	10	101635	101644	0 %	40 %	20 %	40 %	387129081
56	NC_017856	CGCTT	2	10	102782	102791	0 %	40 %	20 %	40 %	387129082
57	NC_017856	TGATT	2	10	103995	104004	20 %	60 %	20 %	0 %	387129084
58	NC_017856	CCTGG	2	10	106078	106087	0 %	20 %	40 %	40 %	387129087
59	NC_017856	TGGCT	2	10	110738	110747	0 %	40 %	40 %	20 %	387129090
60	NC_017856	CAAAA	2	10	111076	111085	80 %	0 %	0 %	20 %	387129090
61	NC_017856	AATCA	2	10	112387	112396	60 %	20 %	0 %	20 %	387129092
62	NC_017856	CTGAA	2	10	125079	125088	40 %	20 %	20 %	20 %	387129105
63	NC_017856	TAACA	2	10	125637	125646	60 %	20 %	0 %	20 %	387129105
64	NC_017856	ATGGC	2	10	125906	125915	20 %	20 %	40 %	20 %	387129105
65	NC_017856	CTGAT	2	10	129232	129241	20 %	40 %	20 %	20 %	387129108
66	NC_017856	TTTTC	2	10	132962	132971	0 %	80 %	0 %	20 %	387129110
67	NC_017856	TGCCA	2	10	133281	133290	20 %	20 %	20 %	40 %	387129110
68	NC_017856	ATCAC	2	10	133597	133606	40 %	20 %	0 %	40 %	387129110
69	NC_017856	TCGCC	2	10	134155	134164	0 %	20 %	20 %	60 %	387129111
70	NC_017856	GGTAA	2	10	136095	136104	40 %	20 %	40 %	0 %	387129113
71	NC_017856	AACAA	2	10	136664	136673	80 %	0 %	0 %	20 %	387129113
72	NC_017856	GTCCC	2	10	136984	136993	0 %	20 %	20 %	60 %	387129114
73	NC_017856	AAGCA	2	10	137120	137129	60 %	0 %	20 %	20 %	387129114
74	NC_017856	ACCAA	2	10	139154	139163	60 %	0 %	0 %	40 %	387129117
75	NC_017856	GGTCT	2	10	142594	142603	0 %	40 %	40 %	20 %	387129120
76	NC_017856	ACAGC	2	10	145130	145139	40 %	0 %	20 %	40 %	387129121
77	NC_017856	TCGAC	2	10	145470	145479	20 %	20 %	20 %	40 %	387129122
78	NC_017856	CGTTT	2	10	155898	155907	0 %	60 %	20 %	20 %	387129130
79	NC_017856	ATCAG	2	10	156446	156455	40 %	20 %	20 %	20 %	387129131
80	NC_017856	GCATG	2	10	156768	156777	20 %	20 %	40 %	20 %	387129131
81	NC_017856	CATCA	2	10	158276	158285	40 %	20 %	0 %	40 %	387129134
82	NC_017856	TTGCT	2	10	158303	158312	0 %	60 %	20 %	20 %	387129134
83	NC_017856	CCCAT	2	10	158873	158882	20 %	20 %	0 %	60 %	387129134
84	NC_017856	ATGTT	2	10	160254	160263	20 %	60 %	20 %	0 %	387129136
85	NC_017856	AATTG	2	10	160612	160621	40 %	40 %	20 %	0 %	387129136
86	NC_017856	ACCAC	2	10	161416	161425	40 %	0 %	0 %	60 %	387129136
87	NC_017856	TCATG	2	10	162302	162311	20 %	40 %	20 %	20 %	387129137
88	NC_017856	GCCGC	2	10	164269	164278	0 %	0 %	40 %	60 %	387129138
89	NC_017856	CCGCC	2	10	164979	164988	0 %	0 %	20 %	80 %	387129139
90	NC_017856	GCAAC	2	10	165427	165436	40 %	0 %	20 %	40 %	387129139
91	NC_017856	ATCCG	2	10	165549	165558	20 %	20 %	20 %	40 %	387129140
92	NC_017856	ATCGT	2	10	167217	167226	20 %	40 %	20 %	20 %	387129142
93	NC_017856	TCAAA	2	10	168591	168600	60 %	20 %	0 %	20 %	387129143
94	NC_017856	TTTTG	2	10	168782	168791	0 %	80 %	20 %	0 %	387129143
95	NC_017856	GATTG	2	10	170123	170132	20 %	40 %	40 %	0 %	387129143
96	NC_017856	TATTT	2	10	170701	170710	20 %	80 %	0 %	0 %	387129144
97	NC_017856	CGAAA	2	10	171150	171159	60 %	0 %	20 %	20 %	387129144
98	NC_017856	AGCGC	2	10	174322	174331	20 %	0 %	40 %	40 %	387129149
99	NC_017856	TTGCG	2	10	175153	175162	0 %	40 %	40 %	20 %	387129150
100	NC_017856	CAACT	2	10	178645	178654	40 %	20 %	0 %	40 %	387129154
101	NC_017856	TGGTC	2	10	180451	180460	0 %	40 %	40 %	20 %	387129157
102	NC_017856	TCAGC	2	10	183145	183154	20 %	20 %	20 %	40 %	387129162
103	NC_017856	TGCTT	2	10	190315	190324	0 %	60 %	20 %	20 %	387129167
104	NC_017856	GTTGT	2	10	190392	190401	0 %	60 %	40 %	0 %	387129167
105	NC_017856	TGAAG	2	10	192521	192530	40 %	20 %	40 %	0 %	387129169
106	NC_017856	GAAAA	2	10	194078	194087	80 %	0 %	20 %	0 %	387129170
107	NC_017856	GTGAA	2	10	196080	196089	40 %	20 %	40 %	0 %	387129171
108	NC_017856	ACTCA	2	10	196564	196573	40 %	20 %	0 %	40 %	387129172
109	NC_017856	TACGA	2	10	197605	197614	40 %	20 %	20 %	20 %	387129174
110	NC_017856	GGACT	2	10	198516	198525	20 %	20 %	40 %	20 %	387129175
111	NC_017856	TATTT	2	10	198569	198578	20 %	80 %	0 %	0 %	387129175
112	NC_017856	AAAGT	2	10	201967	201976	60 %	20 %	20 %	0 %	387129181
113	NC_017856	GAACG	2	10	202262	202271	40 %	0 %	40 %	20 %	387129181
114	NC_017856	TGTGG	2	10	204362	204371	0 %	40 %	60 %	0 %	387129184
115	NC_017856	CGGCG	2	10	204598	204607	0 %	0 %	60 %	40 %	387129184
116	NC_017856	AATAA	2	10	206090	206099	80 %	20 %	0 %	0 %	387129185
117	NC_017856	TCATG	2	10	209882	209891	20 %	40 %	20 %	20 %	387129189
118	NC_017856	CCGTT	2	10	211219	211228	0 %	40 %	20 %	40 %	387129191
119	NC_017856	CCAAA	2	10	213397	213406	60 %	0 %	0 %	40 %	387129193
120	NC_017856	TGTAA	2	10	215054	215063	40 %	40 %	20 %	0 %	387129196
121	NC_017856	TGGTT	3	15	217128	217142	0 %	60 %	40 %	0 %	387129197
122	NC_017856	AGCAA	2	10	218310	218319	60 %	0 %	20 %	20 %	387129198
123	NC_017856	ACCCT	2	10	218891	218900	20 %	20 %	0 %	60 %	387129200
124	NC_017856	CGATG	2	10	219909	219918	20 %	20 %	40 %	20 %	387129200
125	NC_017856	GAAGA	2	10	220948	220957	60 %	0 %	40 %	0 %	387129200
126	NC_017856	TCAAA	2	10	221693	221702	60 %	20 %	0 %	20 %	387129201
127	NC_017856	ACTTT	2	10	222310	222319	20 %	60 %	0 %	20 %	387129201
128	NC_017856	TAAAG	2	10	230338	230347	60 %	20 %	20 %	0 %	387129210
129	NC_017856	CAGCG	2	10	231039	231048	20 %	0 %	40 %	40 %	387129212
130	NC_017856	GAAAA	2	10	231984	231993	80 %	0 %	20 %	0 %	387129214
131	NC_017856	GTTTG	2	10	235144	235153	0 %	60 %	40 %	0 %	387129217
132	NC_017856	ATCTC	2	10	235531	235540	20 %	40 %	0 %	40 %	387129217
133	NC_017856	ACACC	2	10	236137	236146	40 %	0 %	0 %	60 %	387129218
134	NC_017856	AATGC	2	10	237336	237345	40 %	20 %	20 %	20 %	387129219
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252	NC_017856	GCCAT	2	10	428137	428146	20 %	20 %	20 %	40 %	387129377
253	NC_017856	TTTTA	2	10	430001	430010	20 %	80 %	0 %	0 %	387129380
254	NC_017856	CAATG	2	10	430786	430795	40 %	20 %	20 %	20 %	387129380
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257	NC_017856	GTCTC	2	10	436429	436438	0 %	40 %	20 %	40 %	387129384
258	NC_017856	TAACT	2	10	436460	436469	40 %	40 %	0 %	20 %	387129384
259	NC_017856	TCCGG	2	10	437435	437444	0 %	20 %	40 %	40 %	387129385
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261	NC_017856	TTTCA	2	10	438311	438320	20 %	60 %	0 %	20 %	387129387
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