MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Methylophaga sp. JAM7 chromosome

Total Repeats: 2918

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017856	CA	3	6	875	880	50 %	0 %	0 %	50 %	387128985
2	NC_017856	TG	3	6	884	889	0 %	50 %	50 %	0 %	387128985
3	NC_017856	CA	3	6	1063	1068	50 %	0 %	0 %	50 %	387128985
4	NC_017856	TG	3	6	1200	1205	0 %	50 %	50 %	0 %	387128986
5	NC_017856	CA	3	6	1270	1275	50 %	0 %	0 %	50 %	387128986
6	NC_017856	AC	3	6	1282	1287	50 %	0 %	0 %	50 %	387128986
7	NC_017856	CT	3	6	3376	3381	0 %	50 %	0 %	50 %	387128987
8	NC_017856	GT	3	6	4682	4687	0 %	50 %	50 %	0 %	387128989
9	NC_017856	CT	3	6	4829	4834	0 %	50 %	0 %	50 %	387128989
10	NC_017856	GC	3	6	5008	5013	0 %	0 %	50 %	50 %	387128989
11	NC_017856	AG	3	6	9159	9164	50 %	0 %	50 %	0 %	387128995
12	NC_017856	GC	3	6	9847	9852	0 %	0 %	50 %	50 %	387128995
13	NC_017856	GA	3	6	10863	10868	50 %	0 %	50 %	0 %	387128997
14	NC_017856	TC	3	6	10897	10902	0 %	50 %	0 %	50 %	387128997
15	NC_017856	AG	3	6	10908	10913	50 %	0 %	50 %	0 %	387128997
16	NC_017856	GA	3	6	11116	11121	50 %	0 %	50 %	0 %	387128997
17	NC_017856	TG	3	6	12658	12663	0 %	50 %	50 %	0 %	387128998
18	NC_017856	GT	3	6	13590	13595	0 %	50 %	50 %	0 %	387128998
19	NC_017856	TG	3	6	16195	16200	0 %	50 %	50 %	0 %	387129001
20	NC_017856	TG	3	6	16227	16232	0 %	50 %	50 %	0 %	387129001
21	NC_017856	AG	3	6	16404	16409	50 %	0 %	50 %	0 %	387129001
22	NC_017856	CA	3	6	19719	19724	50 %	0 %	0 %	50 %	387129006
23	NC_017856	CG	4	8	20555	20562	0 %	0 %	50 %	50 %	387129008
24	NC_017856	CA	3	6	20970	20975	50 %	0 %	0 %	50 %	387129008
25	NC_017856	TA	3	6	21416	21421	50 %	50 %	0 %	0 %	387129008
26	NC_017856	GC	3	6	24464	24469	0 %	0 %	50 %	50 %	387129010
27	NC_017856	AC	3	6	25400	25405	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017856	GA	3	6	25850	25855	50 %	0 %	50 %	0 %	387129012
29	NC_017856	TC	3	6	27781	27786	0 %	50 %	0 %	50 %	387129014
30	NC_017856	TC	3	6	28358	28363	0 %	50 %	0 %	50 %	387129014
31	NC_017856	GA	3	6	28376	28381	50 %	0 %	50 %	0 %	387129014
32	NC_017856	GT	3	6	30576	30581	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017856	GA	3	6	31234	31239	50 %	0 %	50 %	0 %	387129017
34	NC_017856	TA	3	6	31578	31583	50 %	50 %	0 %	0 %	387129018
35	NC_017856	GC	3	6	31814	31819	0 %	0 %	50 %	50 %	387129018
36	NC_017856	TA	3	6	32335	32340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017856	CT	3	6	32876	32881	0 %	50 %	0 %	50 %	387129019
38	NC_017856	TC	3	6	34559	34564	0 %	50 %	0 %	50 %	387129022
39	NC_017856	AC	3	6	35115	35120	50 %	0 %	0 %	50 %	387129022
40	NC_017856	TG	3	6	35765	35770	0 %	50 %	50 %	0 %	387129023
41	NC_017856	CG	3	6	36445	36450	0 %	0 %	50 %	50 %	387129023
42	NC_017856	CT	3	6	36757	36762	0 %	50 %	0 %	50 %	387129023
43	NC_017856	CA	3	6	39140	39145	50 %	0 %	0 %	50 %	387129026
44	NC_017856	CA	3	6	39901	39906	50 %	0 %	0 %	50 %	387129026
45	NC_017856	GC	3	6	40554	40559	0 %	0 %	50 %	50 %	387129027
46	NC_017856	GC	3	6	41310	41315	0 %	0 %	50 %	50 %	387129029
47	NC_017856	GT	3	6	42369	42374	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017856	CT	3	6	47251	47256	0 %	50 %	0 %	50 %	387129033
49	NC_017856	AC	3	6	47570	47575	50 %	0 %	0 %	50 %	387129033
50	NC_017856	GT	3	6	47583	47588	0 %	50 %	50 %	0 %	387129033
51	NC_017856	TA	3	6	49436	49441	50 %	50 %	0 %	0 %	387129034
52	NC_017856	AT	3	6	49615	49620	50 %	50 %	0 %	0 %	387129034
53	NC_017856	TG	3	6	50415	50420	0 %	50 %	50 %	0 %	387129034
54	NC_017856	AG	3	6	51926	51931	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017856	AG	3	6	52868	52873	50 %	0 %	50 %	0 %	387129036
56	NC_017856	TA	3	6	54365	54370	50 %	50 %	0 %	0 %	387129037
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60	NC_017856	GT	3	6	58434	58439	0 %	50 %	50 %	0 %	387129040
61	NC_017856	AT	3	6	60443	60448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017856	AC	3	6	60844	60849	50 %	0 %	0 %	50 %	387129043
63	NC_017856	CT	3	6	62726	62731	0 %	50 %	0 %	50 %	387129044
64	NC_017856	CT	3	6	63237	63242	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017856	TA	3	6	67432	67437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017856	CG	3	6	68004	68009	0 %	0 %	50 %	50 %	387129047
67	NC_017856	TC	3	6	68604	68609	0 %	50 %	0 %	50 %	387129048
68	NC_017856	AT	3	6	69139	69144	50 %	50 %	0 %	0 %	387129049
69	NC_017856	TA	3	6	69419	69424	50 %	50 %	0 %	0 %	387129049
70	NC_017856	TC	3	6	70079	70084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017856	TC	3	6	70194	70199	0 %	50 %	0 %	50 %	387129050
72	NC_017856	TA	3	6	71023	71028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017856	GC	3	6	74018	74023	0 %	0 %	50 %	50 %	387129052
74	NC_017856	TA	3	6	75452	75457	50 %	50 %	0 %	0 %	387129055
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80	NC_017856	CG	3	6	81648	81653	0 %	0 %	50 %	50 %	387129059
81	NC_017856	CA	3	6	82678	82683	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017856	CA	3	6	84032	84037	50 %	0 %	0 %	50 %	387129062
83	NC_017856	CA	3	6	84468	84473	50 %	0 %	0 %	50 %	387129063
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85	NC_017856	TA	4	8	89826	89833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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88	NC_017856	TA	3	6	91009	91014	50 %	50 %	0 %	0 %	387129069
89	NC_017856	AC	3	6	91319	91324	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017856	CA	3	6	92409	92414	50 %	0 %	0 %	50 %	387129072
91	NC_017856	AT	3	6	92646	92651	50 %	50 %	0 %	0 %	387129072
92	NC_017856	CT	3	6	92667	92672	0 %	50 %	0 %	50 %	387129072
93	NC_017856	GA	3	6	94153	94158	50 %	0 %	50 %	0 %	387129074
94	NC_017856	TG	3	6	94403	94408	0 %	50 %	50 %	0 %	387129074
95	NC_017856	TA	3	6	95305	95310	50 %	50 %	0 %	0 %	387129076
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100	NC_017856	GA	3	6	102277	102282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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102	NC_017856	TC	3	6	105767	105772	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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104	NC_017856	AT	3	6	110914	110919	50 %	50 %	0 %	0 %	387129090
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106	NC_017856	TG	3	6	115440	115445	0 %	50 %	50 %	0 %	387129095
107	NC_017856	AT	3	6	120042	120047	50 %	50 %	0 %	0 %	387129097
108	NC_017856	AC	3	6	122028	122033	50 %	0 %	0 %	50 %	387129099
109	NC_017856	GC	3	6	122588	122593	0 %	0 %	50 %	50 %	387129100
110	NC_017856	TC	3	6	123870	123875	0 %	50 %	0 %	50 %	387129102
111	NC_017856	AC	3	6	124368	124373	50 %	0 %	0 %	50 %	387129103
112	NC_017856	CG	3	6	126808	126813	0 %	0 %	50 %	50 %	387129106
113	NC_017856	AT	3	6	127245	127250	50 %	50 %	0 %	0 %	387129106
114	NC_017856	TG	3	6	128456	128461	0 %	50 %	50 %	0 %	387129107
115	NC_017856	GC	3	6	130654	130659	0 %	0 %	50 %	50 %	387129109
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117	NC_017856	GT	4	8	132057	132064	0 %	50 %	50 %	0 %	387129110
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125	NC_017856	CG	3	6	135729	135734	0 %	0 %	50 %	50 %	387129113
126	NC_017856	AC	3	6	135834	135839	50 %	0 %	0 %	50 %	387129113
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129	NC_017856	CA	3	6	138868	138873	50 %	0 %	0 %	50 %	387129117
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