MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylophaga sp. JAM7 chromosome

Total Repeats: 387

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017856	AC	3	6	25400	25405	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017856	GT	3	6	30576	30581	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017856	TA	3	6	32335	32340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017856	GT	3	6	42369	42374	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017856	AG	3	6	51926	51931	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017856	AT	3	6	60443	60448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017856	CT	3	6	63237	63242	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017856	TA	3	6	67432	67437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017856	TC	3	6	70079	70084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017856	TA	3	6	71023	71028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017856	GA	3	6	80477	80482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017856	CA	3	6	82678	82683	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017856	TA	4	8	89826	89833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017856	AC	3	6	91319	91324	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017856	GA	3	6	102277	102282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017856	TC	3	6	103110	103115	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017856	TC	3	6	105767	105772	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017856	TA	3	6	182944	182949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017856	GC	3	6	193631	193636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017856	TG	3	6	193768	193773	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017856	AC	3	6	194642	194647	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017856	TA	3	6	200072	200077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017856	AG	3	6	208017	208022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017856	GC	3	6	223088	223093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017856	GC	3	6	223283	223288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017856	CT	4	8	224793	224800	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017856	TG	3	6	232703	232708	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017856	GC	3	6	232836	232841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017856	CT	3	6	269269	269274	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017856	AC	3	6	269442	269447	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017856	AC	3	6	275906	275911	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017856	TG	3	6	303808	303813	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017856	AT	3	6	303867	303872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017856	GA	3	6	318587	318592	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017856	CT	3	6	319036	319041	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017856	AT	3	6	319983	319988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017856	TC	3	6	319993	319998	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017856	AT	3	6	320721	320726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017856	TG	3	6	320876	320881	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017856	TG	3	6	344268	344273	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017856	CA	3	6	366387	366392	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017856	AG	3	6	371472	371477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017856	AT	4	8	371527	371534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017856	TC	3	6	385524	385529	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017856	AT	3	6	420654	420659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017856	TC	6	12	422853	422864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017856	AC	3	6	444504	444509	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017856	TA	3	6	473868	473873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017856	TC	3	6	478546	478551	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017856	CT	3	6	481850	481855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017856	TC	3	6	492905	492910	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017856	TC	3	6	495397	495402	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017856	TA	3	6	495503	495508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017856	AC	3	6	497210	497215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017856	CT	3	6	497227	497232	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017856	GA	3	6	498970	498975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017856	GT	4	8	507892	507899	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017856	AG	3	6	518083	518088	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017856	AG	3	6	518151	518156	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017856	AC	3	6	524515	524520	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017856	TA	3	6	539112	539117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017856	AT	3	6	539177	539182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017856	TG	3	6	544063	544068	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017856	AT	3	6	544187	544192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017856	GA	3	6	553384	553389	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017856	CT	3	6	560769	560774	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017856	TC	3	6	561098	561103	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017856	AG	3	6	599368	599373	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017856	AC	3	6	606478	606483	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017856	AC	3	6	606506	606511	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017856	AC	3	6	606728	606733	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017856	CG	3	6	609185	609190	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017856	AT	3	6	613158	613163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017856	TC	3	6	630533	630538	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017856	CG	4	8	638193	638200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017856	CT	3	6	638237	638242	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017856	CA	3	6	638246	638251	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017856	TC	3	6	643591	643596	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017856	GT	3	6	674713	674718	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017856	TG	3	6	685458	685463	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017856	TG	3	6	693311	693316	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017856	AG	3	6	710674	710679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017856	TC	3	6	736842	736847	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017856	TA	4	8	736952	736959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017856	AC	3	6	753466	753471	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017856	AT	3	6	753537	753542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017856	GT	3	6	753557	753562	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017856	AG	3	6	759487	759492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017856	TA	3	6	763779	763784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017856	CA	3	6	772455	772460	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017856	TG	3	6	773362	773367	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017856	GC	3	6	773395	773400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017856	AT	3	6	788062	788067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017856	TA	3	6	800007	800012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017856	AT	3	6	825447	825452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017856	AG	3	6	827961	827966	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017856	AG	3	6	831051	831056	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017856	GA	3	6	836016	836021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017856	TG	3	6	842419	842424	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017856	CG	3	6	850441	850446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017856	AG	3	6	858114	858119	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017856	CG	3	6	869651	869656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017856	AC	3	6	869696	869701	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017856	AG	3	6	877294	877299	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017856	GA	3	6	880385	880390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017856	TA	5	10	884613	884622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017856	AC	3	6	884644	884649	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017856	AC	3	6	889740	889745	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017856	CG	4	8	894397	894404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017856	TC	4	8	894507	894514	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017856	GA	3	6	907155	907160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017856	CG	3	6	926505	926510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017856	AC	3	6	935315	935320	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017856	TG	3	6	935334	935339	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017856	TA	3	6	946469	946474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017856	TC	3	6	949748	949753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017856	TA	3	6	954195	954200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017856	GA	3	6	959305	959310	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017856	GC	3	6	968424	968429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017856	GC	4	8	968521	968528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017856	GC	3	6	968532	968537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017856	GC	3	6	970229	970234	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017856	GC	3	6	975194	975199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017856	TC	3	6	983525	983530	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017856	CG	3	6	992919	992924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017856	GC	3	6	993073	993078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017856	GA	3	6	1001429	1001434	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017856	CA	3	6	1005937	1005942	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017856	TA	3	6	1007866	1007871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017856	TC	4	8	1008493	1008500	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017856	AC	3	6	1010962	1010967	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017856	AG	3	6	1019670	1019675	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017856	CT	3	6	1021853	1021858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017856	TA	3	6	1021876	1021881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017856	TC	3	6	1023327	1023332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017856	GT	3	6	1024026	1024031	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017856	TC	3	6	1025042	1025047	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017856	TG	3	6	1025630	1025635	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017856	GT	3	6	1025806	1025811	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017856	GT	3	6	1025975	1025980	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017856	CG	3	6	1026624	1026629	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017856	CA	3	6	1026795	1026800	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017856	TC	3	6	1026903	1026908	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017856	CA	3	6	1027303	1027308	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017856	AG	3	6	1028713	1028718	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017856	GA	3	6	1030556	1030561	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017856	TC	3	6	1037705	1037710	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017856	CT	3	6	1053832	1053837	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_017856	GC	3	6	1054326	1054331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017856	CA	3	6	1056590	1056595	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_017856	TA	3	6	1057990	1057995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017856	TA	3	6	1073818	1073823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.