MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Acinetobacter baumannii MDR-TJ plasmid pABTJ1

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017848	GTTAAA	2	12	3180	3191	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387125799
2	NC_017848	CATTGG	2	12	3434	3445	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387125800
3	NC_017848	TCTTTA	2	12	8270	8281	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387125807
4	NC_017848	ATTGCA	2	12	8342	8353	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387125807
5	NC_017848	AAATTT	2	12	9774	9785	50 %	50 %	0 %	0 %	387125810
6	NC_017848	CTCAAT	2	12	10254	10265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125812
7	NC_017848	ATTTAA	2	12	13452	13463	50 %	50 %	0 %	0 %	387125816
8	NC_017848	TTGTGC	2	12	13747	13758	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387125817
9	NC_017848	AAATAA	2	12	14090	14101	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387125818
10	NC_017848	CTTGCT	2	12	14774	14785	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387125819
11	NC_017848	TTACAC	2	12	19533	19544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125824
12	NC_017848	CACGTG	2	12	20183	20194	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387125825
13	NC_017848	ATTTGT	2	12	26531	26542	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387125828
14	NC_017848	CATTGA	2	12	27175	27186	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387125828
15	NC_017848	TGCTTA	2	12	34510	34521	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387125835
16	NC_017848	ACGGAT	2	12	37394	37405	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387125838
17	NC_017848	AGCTTT	2	12	38170	38181	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387125840
18	NC_017848	GCCTAA	2	12	38200	38211	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387125840
19	NC_017848	TTGTAT	2	12	39046	39057	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387125843
20	NC_017848	GTATTT	2	12	47483	47494	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387125859
21	NC_017848	TTTTTG	2	12	51264	51275	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	387125861
22	NC_017848	CCAAAT	2	12	57305	57316	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387125868
23	NC_017848	TTCAAT	2	12	63814	63825	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017848	TTTCCT	2	12	64507	64518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387125881
25	NC_017848	CTTTAG	2	12	64947	64958	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387125882
26	NC_017848	AGATGT	2	12	66079	66090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387125883
27	NC_017848	TAGTTC	2	12	66247	66258	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387125883
28	NC_017848	GCTTAC	2	12	66400	66411	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387125883
29	NC_017848	CGTTTA	2	12	66474	66485	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387125883
30	NC_017848	AGATCA	2	12	67831	67842	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387125885

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.