MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acinetobacter baumannii MDR-TJ plasmid pABTJ1

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017848	CATCA	2	10	494	503	40 %	20 %	0 %	40 %	387125795
2	NC_017848	ATTGA	2	10	938	947	40 %	40 %	20 %	0 %	387125796
3	NC_017848	TTATT	2	10	1501	1510	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017848	AAATT	2	10	5474	5483	60 %	40 %	0 %	0 %	387125802
5	NC_017848	TTGGC	2	10	7223	7232	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017848	AATAA	2	10	7261	7270	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017848	TCTCT	2	10	7610	7619	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_017848	GATTT	2	10	7992	8001	20 %	60 %	20 %	0 %	387125806
9	NC_017848	TAAAT	2	10	13606	13615	60 %	40 %	0 %	0 %	387125817
10	NC_017848	AGTTA	2	10	14202	14211	40 %	40 %	20 %	0 %	387125819
11	NC_017848	GTTGC	2	10	18114	18123	0 %	40 %	40 %	20 %	387125822
12	NC_017848	CAATT	2	10	18262	18271	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017848	TCAAT	2	10	18469	18478	40 %	40 %	0 %	20 %	387125823
14	NC_017848	CTAAG	2	10	18997	19006	40 %	20 %	20 %	20 %	387125823
15	NC_017848	CATTA	2	10	19173	19182	40 %	40 %	0 %	20 %	387125823
16	NC_017848	ACTTT	2	10	20419	20428	20 %	60 %	0 %	20 %	387125825
17	NC_017848	TGATT	2	10	22598	22607	20 %	60 %	20 %	0 %	387125825
18	NC_017848	AGTTA	2	10	23452	23461	40 %	40 %	20 %	0 %	387125826
19	NC_017848	TGGTT	2	10	26095	26104	0 %	60 %	40 %	0 %	387125828
20	NC_017848	TTTGC	2	10	27406	27415	0 %	60 %	20 %	20 %	387125828
21	NC_017848	TTGAA	2	10	27890	27899	40 %	40 %	20 %	0 %	387125828
22	NC_017848	TTTGA	2	10	29673	29682	20 %	60 %	20 %	0 %	387125830
23	NC_017848	TCCAT	2	10	30673	30682	20 %	40 %	0 %	40 %	387125832
24	NC_017848	GTAAA	2	10	31161	31170	60 %	20 %	20 %	0 %	387125833
25	NC_017848	AAGCA	2	10	31272	31281	60 %	0 %	20 %	20 %	387125833
26	NC_017848	GCATT	2	10	34445	34454	20 %	40 %	20 %	20 %	387125835
27	NC_017848	CGTTT	2	10	35306	35315	0 %	60 %	20 %	20 %	387125836
28	NC_017848	ATTTA	2	10	35429	35438	40 %	60 %	0 %	0 %	387125836
29	NC_017848	TTGAC	2	10	35707	35716	20 %	40 %	20 %	20 %	387125837
30	NC_017848	CCAAC	2	10	35946	35955	40 %	0 %	0 %	60 %	387125837
31	NC_017848	AAAGA	2	10	37983	37992	80 %	0 %	20 %	0 %	387125839
32	NC_017848	ATTGA	2	10	38025	38034	40 %	40 %	20 %	0 %	387125839
33	NC_017848	GTAAT	2	10	38332	38341	40 %	40 %	20 %	0 %	387125840
34	NC_017848	CATTT	2	10	40086	40095	20 %	60 %	0 %	20 %	387125845
35	NC_017848	AGTAG	2	10	40991	41000	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017848	CAAAA	2	10	43318	43327	80 %	0 %	0 %	20 %	387125852
37	NC_017848	TTGTT	2	10	45206	45215	0 %	80 %	20 %	0 %	387125856
38	NC_017848	CAGAA	2	10	45638	45647	60 %	0 %	20 %	20 %	387125857
39	NC_017848	CATTT	2	10	46106	46115	20 %	60 %	0 %	20 %	387125857
40	NC_017848	ATCTA	2	10	48107	48116	40 %	40 %	0 %	20 %	387125860
41	NC_017848	ATTTT	2	10	49099	49108	20 %	80 %	0 %	0 %	387125861
42	NC_017848	ACCAT	2	10	51576	51585	40 %	20 %	0 %	40 %	387125861
43	NC_017848	AGTTT	2	10	52798	52807	20 %	60 %	20 %	0 %	387125862
44	NC_017848	ATCAC	2	10	53221	53230	40 %	20 %	0 %	40 %	387125862
45	NC_017848	TTGAT	2	10	53367	53376	20 %	60 %	20 %	0 %	387125862
46	NC_017848	CATGC	2	10	57091	57100	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_017848	GTAAA	2	10	57522	57531	60 %	20 %	20 %	0 %	387125869
48	NC_017848	TTATT	2	10	59166	59175	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017848	ATGGA	2	10	59961	59970	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017848	ATTGA	2	10	60546	60555	40 %	40 %	20 %	0 %	387125873
51	NC_017848	TAAGA	2	10	62233	62242	60 %	20 %	20 %	0 %	387125876
52	NC_017848	ATCCA	2	10	63318	63327	40 %	20 %	0 %	40 %	387125879
53	NC_017848	CTTTT	2	10	64520	64529	0 %	80 %	0 %	20 %	387125881
54	NC_017848	ATTTA	2	10	64559	64568	40 %	60 %	0 %	0 %	387125881
55	NC_017848	TAAGA	2	10	69474	69483	60 %	20 %	20 %	0 %	387125887
56	NC_017848	ATTTT	2	10	70326	70335	20 %	80 %	0 %	0 %	387125890
57	NC_017848	AATTG	2	10	70600	70609	40 %	40 %	20 %	0 %	387125891
58	NC_017848	GAAAA	2	10	71519	71528	80 %	0 %	20 %	0 %	387125892
59	NC_017848	AATTT	2	10	71670	71679	40 %	60 %	0 %	0 %	387125893
60	NC_017848	ATATT	2	10	72469	72478	40 %	60 %	0 %	0 %	387125894
61	NC_017848	TTTAA	2	10	73527	73536	40 %	60 %	0 %	0 %	387125897
62	NC_017848	CTGTA	2	10	74815	74824	20 %	40 %	20 %	20 %	387125899
63	NC_017848	ACCTT	2	10	75340	75349	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_017848	TTAAA	2	10	75420	75429	60 %	40 %	0 %	0 %	387125900
65	NC_017848	CAAGC	2	10	76986	76995	40 %	0 %	20 %	40 %	387125901

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.