MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Acinetobacter baumannii MDR-TJ plasmid pABTJ1

Total Repeats: 207

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017848	ACTT	2	8	148	155	25 %	50 %	0 %	25 %	387125795
2	NC_017848	CTAT	2	8	720	727	25 %	50 %	0 %	25 %	387125795
3	NC_017848	TGAT	2	8	800	807	25 %	50 %	25 %	0 %	387125795
4	NC_017848	AAAT	2	8	826	833	75 %	25 %	0 %	0 %	387125795
5	NC_017848	TGTT	2	8	1261	1268	0 %	75 %	25 %	0 %	387125796
6	NC_017848	AAAG	2	8	1583	1590	75 %	0 %	25 %	0 %	387125797
7	NC_017848	ATAG	2	8	2358	2365	50 %	25 %	25 %	0 %	387125798
8	NC_017848	TTTC	2	8	2963	2970	0 %	75 %	0 %	25 %	387125799
9	NC_017848	AATT	2	8	3396	3403	50 %	50 %	0 %	0 %	387125800
10	NC_017848	TAAT	2	8	3699	3706	50 %	50 %	0 %	0 %	387125800
11	NC_017848	GAAT	2	8	3890	3897	50 %	25 %	25 %	0 %	387125800
12	NC_017848	CAAT	2	8	4080	4087	50 %	25 %	0 %	25 %	387125800
13	NC_017848	CGGT	2	8	4096	4103	0 %	25 %	50 %	25 %	387125800
14	NC_017848	ATAA	2	8	4188	4195	75 %	25 %	0 %	0 %	387125800
15	NC_017848	CTTT	2	8	4307	4314	0 %	75 %	0 %	25 %	387125800
16	NC_017848	ATTT	2	8	5107	5114	25 %	75 %	0 %	0 %	387125801
17	NC_017848	TTGA	2	8	5232	5239	25 %	50 %	25 %	0 %	387125801
18	NC_017848	TATC	2	8	5284	5291	25 %	50 %	0 %	25 %	387125801
19	NC_017848	GGTT	2	8	5604	5611	0 %	50 %	50 %	0 %	387125802
20	NC_017848	ATAA	2	8	5673	5680	75 %	25 %	0 %	0 %	387125802
21	NC_017848	AAAT	2	8	5846	5853	75 %	25 %	0 %	0 %	387125802
22	NC_017848	TTGA	2	8	6320	6327	25 %	50 %	25 %	0 %	387125803
23	NC_017848	CTTT	2	8	6647	6654	0 %	75 %	0 %	25 %	387125803
24	NC_017848	CTTT	2	8	7706	7713	0 %	75 %	0 %	25 %	387125806
25	NC_017848	TCTT	2	8	8201	8208	0 %	75 %	0 %	25 %	387125807
26	NC_017848	TAAT	2	8	8562	8569	50 %	50 %	0 %	0 %	387125807
27	NC_017848	ATCA	2	8	9322	9329	50 %	25 %	0 %	25 %	387125809
28	NC_017848	CTTT	2	8	9406	9413	0 %	75 %	0 %	25 %	387125809
29	NC_017848	ATTG	2	8	9431	9438	25 %	50 %	25 %	0 %	387125809
30	NC_017848	TGTA	2	8	9509	9516	25 %	50 %	25 %	0 %	387125810
31	NC_017848	CTTT	2	8	9612	9619	0 %	75 %	0 %	25 %	387125810
32	NC_017848	ATCT	2	8	9646	9653	25 %	50 %	0 %	25 %	387125810
33	NC_017848	CAAA	2	8	9747	9754	75 %	0 %	0 %	25 %	387125810
34	NC_017848	ATCA	2	8	10994	11001	50 %	25 %	0 %	25 %	387125813
35	NC_017848	TAGT	2	8	11178	11185	25 %	50 %	25 %	0 %	387125814
36	NC_017848	CAAG	2	8	11306	11313	50 %	0 %	25 %	25 %	387125814
37	NC_017848	AGAA	2	8	11395	11402	75 %	0 %	25 %	0 %	387125814
38	NC_017848	AATG	2	8	11807	11814	50 %	25 %	25 %	0 %	387125815
39	NC_017848	ACTT	2	8	11900	11907	25 %	50 %	0 %	25 %	387125815
40	NC_017848	AAAT	2	8	12362	12369	75 %	25 %	0 %	0 %	387125815
41	NC_017848	TTTC	2	8	12699	12706	0 %	75 %	0 %	25 %	387125815
42	NC_017848	TTCA	2	8	12867	12874	25 %	50 %	0 %	25 %	387125816
43	NC_017848	TTCT	2	8	12939	12946	0 %	75 %	0 %	25 %	387125816
44	NC_017848	AATT	2	8	13005	13012	50 %	50 %	0 %	0 %	387125816
45	NC_017848	GATT	2	8	13491	13498	25 %	50 %	25 %	0 %	387125816
46	NC_017848	TACT	2	8	14079	14086	25 %	50 %	0 %	25 %	387125818
47	NC_017848	TTCA	2	8	14102	14109	25 %	50 %	0 %	25 %	387125818
48	NC_017848	ATAA	2	8	14241	14248	75 %	25 %	0 %	0 %	387125819
49	NC_017848	TGCT	2	8	15870	15877	0 %	50 %	25 %	25 %	387125820
50	NC_017848	ATTG	2	8	18900	18907	25 %	50 %	25 %	0 %	387125823
51	NC_017848	AAAT	2	8	19120	19127	75 %	25 %	0 %	0 %	387125823
52	NC_017848	TCTT	2	8	19138	19145	0 %	75 %	0 %	25 %	387125823
53	NC_017848	ATTG	3	12	21408	21419	25 %	50 %	25 %	0 %	387125825
54	NC_017848	ACAT	2	8	22279	22286	50 %	25 %	0 %	25 %	387125825
55	NC_017848	TACC	2	8	22763	22770	25 %	25 %	0 %	50 %	387125825
56	NC_017848	ATTG	2	8	23087	23094	25 %	50 %	25 %	0 %	387125826
57	NC_017848	AATT	2	8	23356	23363	50 %	50 %	0 %	0 %	387125826
58	NC_017848	TTTA	2	8	24196	24203	25 %	75 %	0 %	0 %	387125826
59	NC_017848	ATAA	2	8	24305	24312	75 %	25 %	0 %	0 %	387125826
60	NC_017848	TTCA	2	8	24400	24407	25 %	50 %	0 %	25 %	387125826
61	NC_017848	AGAT	2	8	24438	24445	50 %	25 %	25 %	0 %	387125826
62	NC_017848	TTCG	2	8	24561	24568	0 %	50 %	25 %	25 %	387125827
63	NC_017848	ATTT	2	8	25113	25120	25 %	75 %	0 %	0 %	387125827
64	NC_017848	GAAG	2	8	26711	26718	50 %	0 %	50 %	0 %	387125828
65	NC_017848	GTTT	2	8	27002	27009	0 %	75 %	25 %	0 %	387125828
66	NC_017848	ACTG	2	8	27064	27071	25 %	25 %	25 %	25 %	387125828
67	NC_017848	AACT	2	8	27245	27252	50 %	25 %	0 %	25 %	387125828
68	NC_017848	TCTT	2	8	27642	27649	0 %	75 %	0 %	25 %	387125828
69	NC_017848	TTTA	2	8	27686	27693	25 %	75 %	0 %	0 %	387125828
70	NC_017848	TCGT	2	8	27726	27733	0 %	50 %	25 %	25 %	387125828
71	NC_017848	AAAG	2	8	28019	28026	75 %	0 %	25 %	0 %	387125829
72	NC_017848	TGCA	2	8	28081	28088	25 %	25 %	25 %	25 %	387125829
73	NC_017848	GAAA	2	8	28660	28667	75 %	0 %	25 %	0 %	387125829
74	NC_017848	CAAT	2	8	28714	28721	50 %	25 %	0 %	25 %	387125830
75	NC_017848	TTTC	2	8	28759	28766	0 %	75 %	0 %	25 %	387125830
76	NC_017848	TTTG	2	8	28874	28881	0 %	75 %	25 %	0 %	387125830
77	NC_017848	TGTT	2	8	31110	31117	0 %	75 %	25 %	0 %	387125833
78	NC_017848	TCTA	2	8	31311	31318	25 %	50 %	0 %	25 %	387125833
79	NC_017848	CAAA	2	8	31897	31904	75 %	0 %	0 %	25 %	387125834
80	NC_017848	CCAA	2	8	32051	32058	50 %	0 %	0 %	50 %	387125834
81	NC_017848	TTCG	2	8	32335	32342	0 %	50 %	25 %	25 %	387125834
82	NC_017848	CGAC	2	8	32400	32407	25 %	0 %	25 %	50 %	387125834
83	NC_017848	ATTA	2	8	32780	32787	50 %	50 %	0 %	0 %	387125834
84	NC_017848	AATG	2	8	33032	33039	50 %	25 %	25 %	0 %	387125834
85	NC_017848	ATAC	2	8	33926	33933	50 %	25 %	0 %	25 %	387125834
86	NC_017848	TTTG	2	8	34033	34040	0 %	75 %	25 %	0 %	387125834
87	NC_017848	CATT	2	8	34054	34061	25 %	50 %	0 %	25 %	387125834
88	NC_017848	AGGT	2	8	34533	34540	25 %	25 %	50 %	0 %	387125835
89	NC_017848	TGAT	2	8	34931	34938	25 %	50 %	25 %	0 %	387125836
90	NC_017848	ATTG	2	8	35031	35038	25 %	50 %	25 %	0 %	387125836
91	NC_017848	GATA	2	8	35420	35427	50 %	25 %	25 %	0 %	387125836
92	NC_017848	ACTA	2	8	35800	35807	50 %	25 %	0 %	25 %	387125837
93	NC_017848	CGAA	2	8	36092	36099	50 %	0 %	25 %	25 %	387125837
94	NC_017848	TCAT	2	8	36230	36237	25 %	50 %	0 %	25 %	387125837
95	NC_017848	TGTT	2	8	36329	36336	0 %	75 %	25 %	0 %	387125837
96	NC_017848	TTCA	2	8	36448	36455	25 %	50 %	0 %	25 %	387125837
97	NC_017848	ATAA	2	8	36656	36663	75 %	25 %	0 %	0 %	387125837
98	NC_017848	TTTG	2	8	36728	36735	0 %	75 %	25 %	0 %	387125837
99	NC_017848	GTTT	2	8	36745	36752	0 %	75 %	25 %	0 %	387125837
100	NC_017848	AGGT	2	8	37602	37609	25 %	25 %	50 %	0 %	387125839
101	NC_017848	CAAA	2	8	38291	38298	75 %	0 %	0 %	25 %	387125840
102	NC_017848	GAAC	2	8	38853	38860	50 %	0 %	25 %	25 %	387125842
103	NC_017848	TTCA	2	8	38920	38927	25 %	50 %	0 %	25 %	387125842
104	NC_017848	AGCA	2	8	39293	39300	50 %	0 %	25 %	25 %	387125843
105	NC_017848	AAAT	2	8	39335	39342	75 %	25 %	0 %	0 %	387125843
106	NC_017848	CTTT	2	8	39595	39602	0 %	75 %	0 %	25 %	387125843
107	NC_017848	TTAT	2	8	39812	39819	25 %	75 %	0 %	0 %	387125844
108	NC_017848	TGAA	2	8	39947	39954	50 %	25 %	25 %	0 %	387125845
109	NC_017848	TTTC	2	8	40271	40278	0 %	75 %	0 %	25 %	387125846
110	NC_017848	ATTA	2	8	40849	40856	50 %	50 %	0 %	0 %	387125847
111	NC_017848	TGAA	2	8	41853	41860	50 %	25 %	25 %	0 %	387125849
112	NC_017848	ATTA	2	8	42453	42460	50 %	50 %	0 %	0 %	387125849
113	NC_017848	GTAT	2	8	42537	42544	25 %	50 %	25 %	0 %	387125850
114	NC_017848	GATT	2	8	42921	42928	25 %	50 %	25 %	0 %	387125851
115	NC_017848	ACAT	2	8	43205	43212	50 %	25 %	0 %	25 %	387125852
116	NC_017848	AATT	2	8	44142	44149	50 %	50 %	0 %	0 %	387125854
117	NC_017848	TTTA	2	8	44274	44281	25 %	75 %	0 %	0 %	387125854
118	NC_017848	TATG	2	8	44578	44585	25 %	50 %	25 %	0 %	387125855
119	NC_017848	ATTG	2	8	44976	44983	25 %	50 %	25 %	0 %	387125856
120	NC_017848	CTTA	2	8	45103	45110	25 %	50 %	0 %	25 %	387125856
121	NC_017848	CATT	2	8	45344	45351	25 %	50 %	0 %	25 %	387125856
122	NC_017848	AAGT	2	8	45569	45576	50 %	25 %	25 %	0 %	387125857
123	NC_017848	AGGT	2	8	45848	45855	25 %	25 %	50 %	0 %	387125857
124	NC_017848	TTTG	2	8	46029	46036	0 %	75 %	25 %	0 %	387125857
125	NC_017848	TAAA	2	8	46116	46123	75 %	25 %	0 %	0 %	387125857
126	NC_017848	TCAT	2	8	46235	46242	25 %	50 %	0 %	25 %	387125858
127	NC_017848	AAAT	2	8	46603	46610	75 %	25 %	0 %	0 %	387125858
128	NC_017848	AATG	2	8	47707	47714	50 %	25 %	25 %	0 %	387125859
129	NC_017848	CTAT	2	8	48447	48454	25 %	50 %	0 %	25 %	387125861
130	NC_017848	AGAA	2	8	48641	48648	75 %	0 %	25 %	0 %	387125861
131	NC_017848	TAAT	2	8	49361	49368	50 %	50 %	0 %	0 %	387125861
132	NC_017848	CTTT	2	8	50861	50868	0 %	75 %	0 %	25 %	387125861
133	NC_017848	GCTG	2	8	50904	50911	0 %	25 %	50 %	25 %	387125861
134	NC_017848	ACTG	2	8	51103	51110	25 %	25 %	25 %	25 %	387125861
135	NC_017848	TATT	2	8	51448	51455	25 %	75 %	0 %	0 %	387125861
136	NC_017848	TCTT	2	8	51844	51851	0 %	75 %	0 %	25 %	387125862
137	NC_017848	TGAT	2	8	52335	52342	25 %	50 %	25 %	0 %	387125862
138	NC_017848	TACT	2	8	52468	52475	25 %	50 %	0 %	25 %	387125862
139	NC_017848	CATC	2	8	52556	52563	25 %	25 %	0 %	50 %	387125862
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.