MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Acinetobacter baumannii MDR-TJ plasmid pABTJ1

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017848	CA	3	6	389	394	50 %	0 %	0 %	50 %	387125795
2	NC_017848	AT	3	6	2992	2997	50 %	50 %	0 %	0 %	387125799
3	NC_017848	TA	3	6	3038	3043	50 %	50 %	0 %	0 %	387125799
4	NC_017848	GT	3	6	3914	3919	0 %	50 %	50 %	0 %	387125800
5	NC_017848	CT	3	6	4199	4204	0 %	50 %	0 %	50 %	387125800
6	NC_017848	TC	3	6	4437	4442	0 %	50 %	0 %	50 %	387125800
7	NC_017848	TA	3	6	5189	5194	50 %	50 %	0 %	0 %	387125801
8	NC_017848	TA	4	8	5980	5987	50 %	50 %	0 %	0 %	387125802
9	NC_017848	AT	3	6	6182	6187	50 %	50 %	0 %	0 %	387125803
10	NC_017848	TA	3	6	7787	7792	50 %	50 %	0 %	0 %	387125806
11	NC_017848	AT	3	6	8759	8764	50 %	50 %	0 %	0 %	387125808
12	NC_017848	CT	3	6	8949	8954	0 %	50 %	0 %	50 %	387125808
13	NC_017848	CA	3	6	9285	9290	50 %	0 %	0 %	50 %	387125809
14	NC_017848	CT	3	6	9399	9404	0 %	50 %	0 %	50 %	387125809
15	NC_017848	AT	3	6	9846	9851	50 %	50 %	0 %	0 %	387125810
16	NC_017848	TA	3	6	12013	12018	50 %	50 %	0 %	0 %	387125815
17	NC_017848	TA	4	8	12230	12237	50 %	50 %	0 %	0 %	387125815
18	NC_017848	TA	4	8	12650	12657	50 %	50 %	0 %	0 %	387125815
19	NC_017848	AT	3	6	13075	13080	50 %	50 %	0 %	0 %	387125816
20	NC_017848	TA	3	6	13256	13261	50 %	50 %	0 %	0 %	387125816
21	NC_017848	AT	3	6	13560	13565	50 %	50 %	0 %	0 %	387125817
22	NC_017848	CA	3	6	14315	14320	50 %	0 %	0 %	50 %	387125819
23	NC_017848	TA	3	6	14475	14480	50 %	50 %	0 %	0 %	387125819
24	NC_017848	CA	3	6	18805	18810	50 %	0 %	0 %	50 %	387125823
25	NC_017848	CT	3	6	19561	19566	0 %	50 %	0 %	50 %	387125824
26	NC_017848	CT	3	6	19671	19676	0 %	50 %	0 %	50 %	387125824
27	NC_017848	TC	3	6	20236	20241	0 %	50 %	0 %	50 %	387125825
28	NC_017848	GT	3	6	21490	21495	0 %	50 %	50 %	0 %	387125825
29	NC_017848	AT	3	6	22555	22560	50 %	50 %	0 %	0 %	387125825
30	NC_017848	TC	3	6	23128	23133	0 %	50 %	0 %	50 %	387125826
31	NC_017848	AT	3	6	24221	24226	50 %	50 %	0 %	0 %	387125826
32	NC_017848	AT	3	6	25022	25027	50 %	50 %	0 %	0 %	387125827
33	NC_017848	CT	4	8	25666	25673	0 %	50 %	0 %	50 %	387125828
34	NC_017848	CA	3	6	26087	26092	50 %	0 %	0 %	50 %	387125828
35	NC_017848	TA	3	6	26459	26464	50 %	50 %	0 %	0 %	387125828
36	NC_017848	AT	3	6	27217	27222	50 %	50 %	0 %	0 %	387125828
37	NC_017848	TA	3	6	27663	27668	50 %	50 %	0 %	0 %	387125828
38	NC_017848	TA	3	6	28650	28655	50 %	50 %	0 %	0 %	387125829
39	NC_017848	TG	3	6	29168	29173	0 %	50 %	50 %	0 %	387125830
40	NC_017848	AG	3	6	29187	29192	50 %	0 %	50 %	0 %	387125830
41	NC_017848	AT	3	6	29255	29260	50 %	50 %	0 %	0 %	387125830
42	NC_017848	AT	3	6	29299	29304	50 %	50 %	0 %	0 %	387125830
43	NC_017848	AT	3	6	29625	29630	50 %	50 %	0 %	0 %	387125830
44	NC_017848	TG	3	6	30504	30509	0 %	50 %	50 %	0 %	387125832
45	NC_017848	TA	3	6	31245	31250	50 %	50 %	0 %	0 %	387125833
46	NC_017848	AT	3	6	31437	31442	50 %	50 %	0 %	0 %	387125834
47	NC_017848	CA	3	6	32851	32856	50 %	0 %	0 %	50 %	387125834
48	NC_017848	GA	3	6	34790	34795	50 %	0 %	50 %	0 %	387125836
49	NC_017848	TC	3	6	37503	37508	0 %	50 %	0 %	50 %	387125839
50	NC_017848	CA	3	6	37677	37682	50 %	0 %	0 %	50 %	387125839
51	NC_017848	CT	3	6	39462	39467	0 %	50 %	0 %	50 %	387125843
52	NC_017848	TA	4	8	40335	40342	50 %	50 %	0 %	0 %	387125846
53	NC_017848	TA	3	6	40594	40599	50 %	50 %	0 %	0 %	387125846
54	NC_017848	TA	3	6	41847	41852	50 %	50 %	0 %	0 %	387125849
55	NC_017848	AT	3	6	41935	41940	50 %	50 %	0 %	0 %	387125849
56	NC_017848	AT	3	6	42467	42472	50 %	50 %	0 %	0 %	387125850
57	NC_017848	AG	3	6	42994	42999	50 %	0 %	50 %	0 %	387125851
58	NC_017848	AT	3	6	43146	43151	50 %	50 %	0 %	0 %	387125852
59	NC_017848	TA	3	6	43590	43595	50 %	50 %	0 %	0 %	387125852
60	NC_017848	TA	3	6	43755	43760	50 %	50 %	0 %	0 %	387125853
61	NC_017848	TA	3	6	44201	44206	50 %	50 %	0 %	0 %	387125854
62	NC_017848	GA	3	6	45792	45797	50 %	0 %	50 %	0 %	387125857
63	NC_017848	AT	3	6	46244	46249	50 %	50 %	0 %	0 %	387125858
64	NC_017848	AT	3	6	46609	46614	50 %	50 %	0 %	0 %	387125858
65	NC_017848	TA	3	6	47782	47787	50 %	50 %	0 %	0 %	387125859
66	NC_017848	TA	3	6	47797	47802	50 %	50 %	0 %	0 %	387125859
67	NC_017848	GT	3	6	48121	48126	0 %	50 %	50 %	0 %	387125860
68	NC_017848	CT	3	6	49263	49268	0 %	50 %	0 %	50 %	387125861
69	NC_017848	AG	3	6	49967	49972	50 %	0 %	50 %	0 %	387125861
70	NC_017848	TG	3	6	50349	50354	0 %	50 %	50 %	0 %	387125861
71	NC_017848	TC	3	6	50494	50499	0 %	50 %	0 %	50 %	387125861
72	NC_017848	TC	3	6	50554	50559	0 %	50 %	0 %	50 %	387125861
73	NC_017848	TC	3	6	50614	50619	0 %	50 %	0 %	50 %	387125861
74	NC_017848	TC	3	6	50674	50679	0 %	50 %	0 %	50 %	387125861
75	NC_017848	TC	3	6	50872	50877	0 %	50 %	0 %	50 %	387125861
76	NC_017848	AG	3	6	51233	51238	50 %	0 %	50 %	0 %	387125861
77	NC_017848	AG	3	6	52885	52890	50 %	0 %	50 %	0 %	387125862
78	NC_017848	CA	3	6	53714	53719	50 %	0 %	0 %	50 %	387125862
79	NC_017848	AT	3	6	54121	54126	50 %	50 %	0 %	0 %	387125863
80	NC_017848	CT	4	8	54176	54183	0 %	50 %	0 %	50 %	387125863
81	NC_017848	TA	3	6	54255	54260	50 %	50 %	0 %	0 %	387125863
82	NC_017848	AT	3	6	58804	58809	50 %	50 %	0 %	0 %	387125870
83	NC_017848	CT	4	8	60750	60757	0 %	50 %	0 %	50 %	387125874
84	NC_017848	TA	3	6	60772	60777	50 %	50 %	0 %	0 %	387125874
85	NC_017848	TA	4	8	61595	61602	50 %	50 %	0 %	0 %	387125875
86	NC_017848	CT	3	6	61789	61794	0 %	50 %	0 %	50 %	387125876
87	NC_017848	TC	4	8	64742	64749	0 %	50 %	0 %	50 %	387125881
88	NC_017848	TC	3	6	64867	64872	0 %	50 %	0 %	50 %	387125881
89	NC_017848	TA	3	6	66187	66192	50 %	50 %	0 %	0 %	387125883
90	NC_017848	CT	3	6	66422	66427	0 %	50 %	0 %	50 %	387125883
91	NC_017848	AT	3	6	66721	66726	50 %	50 %	0 %	0 %	387125884
92	NC_017848	TA	4	8	68836	68843	50 %	50 %	0 %	0 %	387125886
93	NC_017848	CT	3	6	69030	69035	0 %	50 %	0 %	50 %	387125887
94	NC_017848	AG	3	6	69660	69665	50 %	0 %	50 %	0 %	387125888
95	NC_017848	GA	3	6	69801	69806	50 %	0 %	50 %	0 %	387125889
96	NC_017848	AC	3	6	69865	69870	50 %	0 %	0 %	50 %	387125889
97	NC_017848	TG	3	6	70546	70551	0 %	50 %	50 %	0 %	387125891
98	NC_017848	TC	3	6	70768	70773	0 %	50 %	0 %	50 %	387125891
99	NC_017848	AT	3	6	71509	71514	50 %	50 %	0 %	0 %	387125892
100	NC_017848	CT	3	6	71663	71668	0 %	50 %	0 %	50 %	387125893
101	NC_017848	TA	3	6	71740	71745	50 %	50 %	0 %	0 %	387125893
102	NC_017848	AT	3	6	71821	71826	50 %	50 %	0 %	0 %	387125893
103	NC_017848	AT	3	6	72483	72488	50 %	50 %	0 %	0 %	387125894
104	NC_017848	TA	3	6	72886	72891	50 %	50 %	0 %	0 %	387125895
105	NC_017848	AT	3	6	72942	72947	50 %	50 %	0 %	0 %	387125895
106	NC_017848	AT	3	6	73411	73416	50 %	50 %	0 %	0 %	387125896
107	NC_017848	CT	3	6	74604	74609	0 %	50 %	0 %	50 %	387125899
108	NC_017848	CA	3	6	74946	74951	50 %	0 %	0 %	50 %	387125899
109	NC_017848	CT	3	6	75676	75681	0 %	50 %	0 %	50 %	387125900
110	NC_017848	TA	3	6	76515	76520	50 %	50 %	0 %	0 %	387125900
111	NC_017848	AG	3	6	76633	76638	50 %	0 %	50 %	0 %	387125900

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.