MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Acinetobacter baumannii MDR-TJ chromosome

Total Repeats: 1630

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017847	TTTATT	2	12	19	30	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017847	TTGATT	2	12	90	101	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017847	AATTTA	2	12	358	369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017847	TGAAAA	2	12	5237	5248	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387122093
5	NC_017847	CCGTAA	2	12	5651	5662	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387122093
6	NC_017847	CCGATG	2	12	5836	5847	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387122093
7	NC_017847	TGCTTA	2	12	10903	10914	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387122097
8	NC_017847	CAAAAA	2	12	12861	12872	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017847	TGTGGT	2	12	14331	14342	0 %	50 %	50 %	0 %	387122100
10	NC_017847	CTCCAC	2	12	15608	15619	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	387122102
11	NC_017847	GAAATC	2	12	22785	22796	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017847	GATCTT	2	12	25317	25328	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387122105
13	NC_017847	CTGGTT	2	12	26859	26870	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387122106
14	NC_017847	AACGTA	2	12	32131	32142	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387122110
15	NC_017847	AAGTCA	2	12	34167	34178	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387122112
16	NC_017847	TCTTCA	2	12	37487	37498	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387122115
17	NC_017847	GCAAAA	2	12	42564	42575	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387122118
18	NC_017847	TGGTAT	2	12	42777	42788	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387122118
19	NC_017847	CCGCAA	2	12	43477	43488	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	387122118
20	NC_017847	TCATGC	2	12	45349	45360	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387122119
21	NC_017847	GGTGAG	2	12	48113	48124	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	387122122
22	NC_017847	TTTTCC	2	12	48625	48636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387122123
23	NC_017847	AAAGTC	2	12	48803	48814	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387122123
24	NC_017847	TGCACC	2	12	49542	49553	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387122124
25	NC_017847	TGCCAA	2	12	50157	50168	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387122124
26	NC_017847	TACAGA	2	12	52446	52457	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017847	AACAGG	2	12	54124	54135	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387122129
28	NC_017847	GTTCAT	2	12	56638	56649	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017847	AGAAAA	2	12	57417	57428	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387122133
30	NC_017847	ATTTAT	2	12	63381	63392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017847	TTGCAA	2	12	65616	65627	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387122144
32	NC_017847	ATGACC	2	12	67488	67499	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387122146
33	NC_017847	CTTTAT	2	12	68576	68587	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387122147
34	NC_017847	ACAAGC	2	12	70355	70366	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017847	CTTCAA	2	12	73274	73285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387122151
36	NC_017847	TCGGTT	2	12	76352	76363	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387122154
37	NC_017847	AGCTTT	2	12	77805	77816	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387122155
38	NC_017847	ACTTTT	2	12	78623	78634	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387122156
39	NC_017847	GAAGAT	2	12	78635	78646	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387122156
40	NC_017847	TTTGAT	2	12	78971	78982	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387122156
41	NC_017847	ATTTAA	2	12	82053	82064	50 %	50 %	0 %	0 %	387122159
42	NC_017847	ATTTTT	2	12	82148	82159	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387122159
43	NC_017847	AATAAC	2	12	92381	92392	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387122167
44	NC_017847	CTTCAA	2	12	95816	95827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387122169
45	NC_017847	CACCAA	2	12	98988	98999	50 %	0 %	0 %	50 %	387122174
46	NC_017847	CGATAG	2	12	99299	99310	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387122174
47	NC_017847	TTTAGC	2	12	100896	100907	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387122175
48	NC_017847	ACCGCG	2	12	101750	101761	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	387122176
49	NC_017847	GATTTT	2	12	101776	101787	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387122176
50	NC_017847	ACCAAA	2	12	105863	105874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387122180
51	NC_017847	AATATA	2	12	111174	111185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017847	AAAACA	2	12	114832	114843	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017847	GCGCAA	2	12	118427	118438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387122192
54	NC_017847	CAATGA	2	12	125650	125661	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387122198
55	NC_017847	GCACAA	2	12	126146	126157	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387122198
56	NC_017847	TGAAGC	2	12	128307	128318	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387122200
57	NC_017847	TCAATT	2	12	136463	136474	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387122207
58	NC_017847	AAAAAC	2	12	138567	138578	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	387122208
59	NC_017847	TTCCAT	2	12	138752	138763	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387122209
60	NC_017847	AGGCAA	2	12	143771	143782	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387122215
61	NC_017847	CTTTAA	2	12	145086	145097	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387122217
62	NC_017847	TGTGAT	2	12	147790	147801	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387122218
63	NC_017847	GCCAAA	2	12	148483	148494	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387122219
64	NC_017847	GCTTTA	2	12	149114	149125	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387122220
65	NC_017847	ATAAAA	2	12	154134	154145	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387122224
66	NC_017847	GGTGGC	2	12	161861	161872	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	387122232
67	NC_017847	AGGTGC	2	12	162010	162021	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387122232
68	NC_017847	AGATGA	2	12	162829	162840	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387122232
69	NC_017847	CAAGGT	2	12	165325	165336	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017847	ATGTAC	2	12	167336	167347	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387122236
71	NC_017847	CCAGCT	2	12	168892	168903	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387122237
72	NC_017847	TTTTTG	2	12	178043	178054	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017847	ACATGC	2	12	178417	178428	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387122247
74	NC_017847	GGACGT	2	12	179342	179353	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387122247
75	NC_017847	ATTTAG	2	12	180799	180810	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387122249
76	NC_017847	GCGGCA	2	12	181416	181427	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	387122249
77	NC_017847	ATTTAA	2	12	186770	186781	50 %	50 %	0 %	0 %	387122255
78	NC_017847	AATATC	2	12	187965	187976	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387122257
79	NC_017847	TAAAAC	2	12	188574	188585	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387122257
80	NC_017847	TAAAAG	2	12	189633	189644	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017847	TTTATT	2	12	194271	194282	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017847	TTATTT	2	12	195454	195465	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017847	AATAAA	2	12	196406	196417	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017847	GTTCAG	2	12	198707	198718	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387122267
85	NC_017847	GGGTAT	2	12	205510	205521	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387122271
86	NC_017847	CAGAAG	2	12	207015	207026	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387122271
87	NC_017847	TATTGA	2	12	210457	210468	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387122273
88	NC_017847	ACCTGA	2	12	213473	213484	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387122275
89	NC_017847	CTTTTT	2	12	214817	214828	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387122275
90	NC_017847	TATCAA	2	12	214846	214857	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387122275
91	NC_017847	ACCTTG	2	12	214889	214900	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387122275
92	NC_017847	CATCTA	2	12	216256	216267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387122276
93	NC_017847	TAAATT	2	12	218788	218799	50 %	50 %	0 %	0 %	387122280
94	NC_017847	AATAAA	2	12	223159	223170	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387122285
95	NC_017847	GCATGT	2	12	225916	225927	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387122288
96	NC_017847	AAGGCG	2	12	228088	228099	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	387122289
97	NC_017847	TTTAAA	2	12	235170	235181	50 %	50 %	0 %	0 %	387122295
98	NC_017847	TTTAAA	2	12	236382	236393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017847	CATGAC	2	12	238164	238175	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017847	AAATTA	2	12	238224	238235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017847	TACCAC	2	12	239778	239789	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	387122300
102	NC_017847	AAAAAG	2	12	239956	239967	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387122300
103	NC_017847	AAGCCA	2	12	241734	241745	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387122303
104	NC_017847	TTAAAT	2	12	244067	244078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017847	TTAAAT	2	12	245354	245365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017847	TTAATT	2	12	246507	246518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387122308
107	NC_017847	TAAAAA	2	12	248417	248428	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387122310
108	NC_017847	CCAATA	2	12	254079	254090	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387122316
109	NC_017847	ATTTCA	2	12	255815	255826	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387122318
110	NC_017847	AAAAAG	2	12	258519	258530	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017847	TAAATA	2	12	259206	259217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017847	TGGTCT	2	12	273688	273699	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017847	GAAGCA	2	12	274621	274632	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387122340
114	NC_017847	TTTTAG	2	12	278248	278259	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387122341
115	NC_017847	AGCAAA	2	12	278308	278319	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387122341
116	NC_017847	AGGGGC	2	12	279560	279571	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_017847	ATTTTT	2	12	279590	279601	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017847	TAAAAA	2	12	279765	279776	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017847	CCATAA	2	12	284083	284094	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387122346
120	NC_017847	TAAAGA	2	12	286282	286293	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017847	GCCTAC	2	12	287749	287760	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387122351
122	NC_017847	GAACAG	2	12	291357	291368	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387122353
123	NC_017847	AACTGG	2	12	292501	292512	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387122353
124	NC_017847	ATATGT	2	12	296467	296478	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387122357
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127	NC_017847	CCTTAG	2	12	301077	301088	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387122361
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144	NC_017847	TATTTT	2	12	351867	351878	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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148	NC_017847	TACGCG	2	12	357431	357442	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387122413
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162	NC_017847	TAAACG	2	12	390128	390139	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387122444
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174	NC_017847	GCCTAT	2	12	407536	407547	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387122458
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223	NC_017847	AGCGAT	2	12	547168	547179	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387122599
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233	NC_017847	TCAAAG	2	12	564611	564622	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387122614
234	NC_017847	TATAAA	2	12	564635	564646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387122614
235	NC_017847	AAAATT	2	12	565673	565684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
236	NC_017847	ATTTTA	2	12	569026	569037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387122618
237	NC_017847	GAAAAT	2	12	569784	569795	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387122619
238	NC_017847	GACCAT	2	12	570555	570566	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387122619
239	NC_017847	ATCAAT	2	12	575344	575355	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387122624
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344	NC_017847	GTAACA	2	12	791875	791886	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387122818
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347	NC_017847	TGTGGG	2	12	811911	811922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387122832
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457	NC_017847	AAAAGA	2	12	1096726	1096737	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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463	NC_017847	CATTTT	2	12	1107218	1107229	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387123108
464	NC_017847	TAATAT	2	12	1108445	1108456	50 %	50 %	0 %	0 %	387123110
465	NC_017847	CTGTAG	2	12	1108912	1108923	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387123111
466	NC_017847	CAAGCT	2	12	1109299	1109310	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387123111
467	NC_017847	TTTTTC	2	12	1110852	1110863	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387123113
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470	NC_017847	AAATTG	2	12	1119929	1119940	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387123119
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481	NC_017847	TTATAA	2	12	1158253	1158264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_017847	TCTTTT	2	12	1164199	1164210	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387123157
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