MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Acinetobacter baumannii MDR-TJ chromosome

Total Repeats: 1427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017847	TGAAAA	2	12	5237	5248	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387122093
2	NC_017847	CCGTAA	2	12	5651	5662	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387122093
3	NC_017847	CCGATG	2	12	5836	5847	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387122093
4	NC_017847	TGCTTA	2	12	10903	10914	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387122097
5	NC_017847	TGTGGT	2	12	14331	14342	0 %	50 %	50 %	0 %	387122100
6	NC_017847	CTCCAC	2	12	15608	15619	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	387122102
7	NC_017847	GATCTT	2	12	25317	25328	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387122105
8	NC_017847	CTGGTT	2	12	26859	26870	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387122106
9	NC_017847	AACGTA	2	12	32131	32142	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387122110
10	NC_017847	AAGTCA	2	12	34167	34178	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387122112
11	NC_017847	TCTTCA	2	12	37487	37498	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387122115
12	NC_017847	GCAAAA	2	12	42564	42575	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387122118
13	NC_017847	TGGTAT	2	12	42777	42788	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387122118
14	NC_017847	CCGCAA	2	12	43477	43488	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	387122118
15	NC_017847	TCATGC	2	12	45349	45360	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387122119
16	NC_017847	GGTGAG	2	12	48113	48124	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	387122122
17	NC_017847	TTTTCC	2	12	48625	48636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387122123
18	NC_017847	AAAGTC	2	12	48803	48814	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387122123
19	NC_017847	TGCACC	2	12	49542	49553	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387122124
20	NC_017847	TGCCAA	2	12	50157	50168	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387122124
21	NC_017847	AACAGG	2	12	54124	54135	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387122129
22	NC_017847	AGAAAA	2	12	57417	57428	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387122133
23	NC_017847	TTGCAA	2	12	65616	65627	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387122144
24	NC_017847	ATGACC	2	12	67488	67499	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387122146
25	NC_017847	CTTTAT	2	12	68576	68587	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387122147
26	NC_017847	CTTCAA	2	12	73274	73285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387122151
27	NC_017847	TCGGTT	2	12	76352	76363	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387122154
28	NC_017847	AGCTTT	2	12	77805	77816	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387122155
29	NC_017847	ACTTTT	2	12	78623	78634	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387122156
30	NC_017847	GAAGAT	2	12	78635	78646	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387122156
31	NC_017847	TTTGAT	2	12	78971	78982	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387122156
32	NC_017847	ATTTAA	2	12	82053	82064	50 %	50 %	0 %	0 %	387122159
33	NC_017847	ATTTTT	2	12	82148	82159	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387122159
34	NC_017847	AATAAC	2	12	92381	92392	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387122167
35	NC_017847	CTTCAA	2	12	95816	95827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387122169
36	NC_017847	CACCAA	2	12	98988	98999	50 %	0 %	0 %	50 %	387122174
37	NC_017847	CGATAG	2	12	99299	99310	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387122174
38	NC_017847	TTTAGC	2	12	100896	100907	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387122175
39	NC_017847	ACCGCG	2	12	101750	101761	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	387122176
40	NC_017847	GATTTT	2	12	101776	101787	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387122176
41	NC_017847	ACCAAA	2	12	105863	105874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387122180
42	NC_017847	GCGCAA	2	12	118427	118438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387122192
43	NC_017847	CAATGA	2	12	125650	125661	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387122198
44	NC_017847	GCACAA	2	12	126146	126157	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387122198
45	NC_017847	TGAAGC	2	12	128307	128318	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387122200
46	NC_017847	TCAATT	2	12	136463	136474	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387122207
47	NC_017847	AAAAAC	2	12	138567	138578	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	387122208
48	NC_017847	TTCCAT	2	12	138752	138763	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387122209
49	NC_017847	AGGCAA	2	12	143771	143782	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387122215
50	NC_017847	CTTTAA	2	12	145086	145097	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387122217
51	NC_017847	TGTGAT	2	12	147790	147801	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387122218
52	NC_017847	GCCAAA	2	12	148483	148494	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387122219
53	NC_017847	GCTTTA	2	12	149114	149125	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387122220
54	NC_017847	ATAAAA	2	12	154134	154145	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387122224
55	NC_017847	GGTGGC	2	12	161861	161872	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	387122232
56	NC_017847	AGGTGC	2	12	162010	162021	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387122232
57	NC_017847	AGATGA	2	12	162829	162840	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387122232
58	NC_017847	ATGTAC	2	12	167336	167347	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387122236
59	NC_017847	CCAGCT	2	12	168892	168903	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387122237
60	NC_017847	ACATGC	2	12	178417	178428	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387122247
61	NC_017847	GGACGT	2	12	179342	179353	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387122247
62	NC_017847	ATTTAG	2	12	180799	180810	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387122249
63	NC_017847	GCGGCA	2	12	181416	181427	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	387122249
64	NC_017847	ATTTAA	2	12	186770	186781	50 %	50 %	0 %	0 %	387122255
65	NC_017847	AATATC	2	12	187965	187976	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387122257
66	NC_017847	TAAAAC	2	12	188574	188585	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387122257
67	NC_017847	GTTCAG	2	12	198707	198718	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387122267
68	NC_017847	GGGTAT	2	12	205510	205521	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387122271
69	NC_017847	CAGAAG	2	12	207015	207026	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387122271
70	NC_017847	TATTGA	2	12	210457	210468	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387122273
71	NC_017847	ACCTGA	2	12	213473	213484	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387122275
72	NC_017847	CTTTTT	2	12	214817	214828	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387122275
73	NC_017847	TATCAA	2	12	214846	214857	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387122275
74	NC_017847	ACCTTG	2	12	214889	214900	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387122275
75	NC_017847	CATCTA	2	12	216256	216267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387122276
76	NC_017847	TAAATT	2	12	218788	218799	50 %	50 %	0 %	0 %	387122280
77	NC_017847	AATAAA	2	12	223159	223170	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387122285
78	NC_017847	GCATGT	2	12	225916	225927	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387122288
79	NC_017847	AAGGCG	2	12	228088	228099	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	387122289
80	NC_017847	TTTAAA	2	12	235170	235181	50 %	50 %	0 %	0 %	387122295
81	NC_017847	TACCAC	2	12	239778	239789	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	387122300
82	NC_017847	AAAAAG	2	12	239956	239967	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387122300
83	NC_017847	AAGCCA	2	12	241734	241745	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387122303
84	NC_017847	TTAATT	2	12	246507	246518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387122308
85	NC_017847	TAAAAA	2	12	248417	248428	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387122310
86	NC_017847	CCAATA	2	12	254079	254090	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387122316
87	NC_017847	ATTTCA	2	12	255815	255826	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387122318
88	NC_017847	GAAGCA	2	12	274621	274632	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387122340
89	NC_017847	TTTTAG	2	12	278248	278259	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387122341
90	NC_017847	AGCAAA	2	12	278308	278319	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387122341
91	NC_017847	CCATAA	2	12	284083	284094	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387122346
92	NC_017847	GCCTAC	2	12	287749	287760	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387122351
93	NC_017847	GAACAG	2	12	291357	291368	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387122353
94	NC_017847	AACTGG	2	12	292501	292512	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387122353
95	NC_017847	ATATGT	2	12	296467	296478	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387122357
96	NC_017847	ATTTTC	2	12	300426	300437	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387122360
97	NC_017847	CCTTAG	2	12	301077	301088	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387122361
98	NC_017847	GATAAA	2	12	301502	301513	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387122361
99	NC_017847	TCAATT	2	12	301532	301543	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387122361
100	NC_017847	GCTTTA	2	12	302391	302402	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387122362
101	NC_017847	GCCAAT	2	12	303504	303515	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387122364
102	NC_017847	TGACCG	2	12	306299	306310	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387122365
103	NC_017847	CAAGCT	2	12	306498	306509	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387122365
104	NC_017847	CGGTAT	2	12	309003	309014	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387122367
105	NC_017847	CTTTAA	2	12	311786	311797	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387122370
106	NC_017847	AAAGAA	2	12	314882	314893	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387122373
107	NC_017847	TAAATG	2	12	316767	316778	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387122375
108	NC_017847	GGTTGA	2	12	320170	320181	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387122378
109	NC_017847	GCAATT	2	12	324039	324050	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387122379
110	NC_017847	TGAATA	2	12	327527	327538	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387122381
111	NC_017847	TATTAA	2	12	331768	331779	50 %	50 %	0 %	0 %	387122386
112	NC_017847	GGTGTT	2	12	350667	350678	0 %	50 %	50 %	0 %	387122405
113	NC_017847	GCAGAA	2	12	353929	353940	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387122408
114	NC_017847	TGATTG	2	12	354384	354395	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387122409
115	NC_017847	TACGCG	2	12	357431	357442	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387122413
116	NC_017847	GAAGCA	2	12	357486	357497	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387122413
117	NC_017847	AGTTTT	2	12	359711	359722	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387122414
118	NC_017847	AATTTT	2	12	360970	360981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387122416
119	NC_017847	CTTCAG	2	12	361708	361719	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387122417
120	NC_017847	CTTTAG	2	12	362876	362887	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387122419
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124	NC_017847	TTAAAT	2	12	373051	373062	50 %	50 %	0 %	0 %	387122428
125	NC_017847	GTTTAC	2	12	382289	382300	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387122434
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151	NC_017847	AACCTT	2	12	441609	441620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387122499
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219	NC_017847	TCAATA	2	12	623131	623142	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387122663
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222	NC_017847	AATACG	2	12	633659	633670	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387122674
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224	NC_017847	CCGTAT	2	12	635786	635797	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387122675
225	NC_017847	CTGGTA	2	12	635860	635871	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387122675
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227	NC_017847	AACGTA	2	12	636268	636279	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387122675
228	NC_017847	ACTAAA	2	12	642162	642173	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387122684
229	NC_017847	CAAGTA	2	12	643123	643134	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387122685
230	NC_017847	CGTATG	2	12	643344	643355	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387122685
231	NC_017847	GTTTTG	2	12	646924	646935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387122689
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342	NC_017847	TATTGA	2	12	977465	977476	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387122973
343	NC_017847	ATTAAA	2	12	977651	977662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387122973
344	NC_017847	CACGTA	2	12	978804	978815	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387122974
345	NC_017847	CGATGA	2	12	979267	979278	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387122974
346	NC_017847	TTGAGC	2	12	982915	982926	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387122979
347	NC_017847	TCAAGT	2	12	984397	984408	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387122983
348	NC_017847	TTAGAA	2	12	984901	984912	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387122983
349	NC_017847	AAACAT	2	12	988338	988349	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387122988
350	NC_017847	TATTTT	2	12	988599	988610	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387122988
351	NC_017847	GATCAT	2	12	998029	998040	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387123008
352	NC_017847	TTACCT	2	12	1001420	1001431	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387123011
353	NC_017847	ACAGGT	2	12	1009710	1009721	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387123025
354	NC_017847	TAAACA	2	12	1012447	1012458	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387123030
355	NC_017847	TTGAAT	2	12	1014838	1014849	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387123030
356	NC_017847	CTGAAA	2	12	1014937	1014948	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387123030
357	NC_017847	ACTACC	2	12	1021426	1021437	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	387123036
358	NC_017847	TGCAAA	2	12	1024866	1024877	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387123036
359	NC_017847	AAGTAC	2	12	1027554	1027565	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387123036
360	NC_017847	CTCAGT	2	12	1031815	1031826	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387123045
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362	NC_017847	GATGCG	2	12	1036013	1036024	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387123049
363	NC_017847	AAATGA	2	12	1036763	1036774	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387123050
364	NC_017847	TGAAAA	2	12	1037487	1037498	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387123051
365	NC_017847	TAGAAA	2	12	1038271	1038282	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387123051
366	NC_017847	CTTACG	2	12	1038439	1038450	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387123051
367	NC_017847	TTTACC	2	12	1043469	1043480	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387123055
368	NC_017847	ACAATA	2	12	1049074	1049085	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387123060
369	NC_017847	TAAGCA	2	12	1049686	1049697	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387123061
370	NC_017847	GTGCTT	2	12	1050071	1050082	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387123061
371	NC_017847	TTACGT	2	12	1051870	1051881	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387123062
372	NC_017847	TGACAA	2	12	1054732	1054743	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387123063
373	NC_017847	TGAACG	2	12	1055345	1055356	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387123064
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379	NC_017847	CGTAAG	2	12	1068865	1068876	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387123075
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401	NC_017847	AAATTG	2	12	1119929	1119940	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387123119
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404	NC_017847	TGGCGG	2	12	1123127	1123138	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	387123121
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407	NC_017847	AGATGC	2	12	1144501	1144512	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387123138
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423	NC_017847	TCTGAG	2	12	1191042	1191053	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387123178
424	NC_017847	TTAGCT	2	12	1193554	1193565	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387123181
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429	NC_017847	CAGATG	2	12	1208488	1208499	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387123193
430	NC_017847	TGAACG	2	12	1211919	1211930	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387123194
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432	NC_017847	CTTCAA	2	12	1228139	1228150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387123208
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437	NC_017847	CTTTTT	2	12	1244709	1244720	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387123220
438	NC_017847	AATATT	2	12	1245808	1245819	50 %	50 %	0 %	0 %	387123220
439	NC_017847	TTACCT	2	12	1246995	1247006	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387123221
440	NC_017847	ATTACT	2	12	1247231	1247242	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387123221
441	NC_017847	ACCATC	2	12	1247393	1247404	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	387123221
442	NC_017847	GAATAT	2	12	1250945	1250956	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387123225
443	NC_017847	CTTTAA	2	12	1252364	1252375	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387123227
444	NC_017847	CGTTGA	2	12	1256545	1256556	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387123232
445	NC_017847	CTAATA	2	12	1256672	1256683	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387123232
446	NC_017847	TTTCAT	2	12	1261164	1261175	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387123237
447	NC_017847	AATGAA	2	12	1262550	1262561	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387123239
448	NC_017847	TTCGAT	2	12	1264395	1264406	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387123240
449	NC_017847	TTTAAT	2	12	1272496	1272507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387123246
450	NC_017847	AGGGTT	2	12	1288778	1288789	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387123262
451	NC_017847	TTTCAC	2	12	1290838	1290849	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387123266
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