MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans D7S-1 chromosome

Total Repeats: 886

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017846	ATTCTG	2	12	12150	12161	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387119847
2	NC_017846	TGCAGG	2	12	12475	12486	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387119847
3	NC_017846	ACGGCA	2	12	16294	16305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387119850
4	NC_017846	GCGGTG	2	12	16749	16760	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	387119851
5	NC_017846	GGTGTT	2	12	17727	17738	0 %	50 %	50 %	0 %	387119853
6	NC_017846	TCCATA	2	12	18079	18090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387119853
7	NC_017846	GTCGAT	2	12	21676	21687	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387119855
8	NC_017846	AAAAAT	2	12	22297	22308	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017846	TAAATT	2	12	24494	24505	50 %	50 %	0 %	0 %	387119858
10	NC_017846	GTTACT	2	12	27956	27967	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387119860
11	NC_017846	GCTTGA	2	12	33608	33619	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387119866
12	NC_017846	AATTCC	2	12	38614	38625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387119873
13	NC_017846	CGGCAA	2	12	39989	40000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387119874
14	NC_017846	GAAGCG	2	12	42387	42398	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	387119876
15	NC_017846	CGTTCC	2	12	50090	50101	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	387119883
16	NC_017846	CCTAAA	2	12	56332	56343	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387119887
17	NC_017846	TCAATT	2	12	61195	61206	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387119890
18	NC_017846	CGTGAA	2	12	62228	62239	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387119891
19	NC_017846	TCGGTG	2	12	65560	65571	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	387119893
20	NC_017846	TTTTGT	2	12	66313	66324	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	387119894
21	NC_017846	AACGCT	2	12	73618	73629	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387119900
22	NC_017846	GTTCAA	2	12	74723	74734	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387119900
23	NC_017846	TTAAAT	2	12	84151	84162	50 %	50 %	0 %	0 %	387119907
24	NC_017846	TACCGG	2	12	85578	85589	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387119909
25	NC_017846	ACTTCA	2	12	98068	98079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387119916
26	NC_017846	TTCGGC	2	12	98500	98511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387119917
27	NC_017846	AACTCC	2	12	108360	108371	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	387119929
28	NC_017846	TATTTA	2	12	111512	111523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017846	CAAAAA	2	12	111609	111620	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	387119932
30	NC_017846	CAACGC	2	12	113861	113872	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	387119933
31	NC_017846	GCGAAA	2	12	115071	115082	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387119933
32	NC_017846	TGCCCG	2	12	122554	122565	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	387119942
33	NC_017846	GTTTCC	2	12	123881	123892	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387119943
34	NC_017846	AATAAA	2	12	126834	126845	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017846	TCCACT	2	12	127741	127752	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	387119945
36	NC_017846	TCGCCG	2	12	128975	128986	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	387119946
37	NC_017846	AAAATG	2	12	130605	130616	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387119947
38	NC_017846	GATATT	2	12	133782	133793	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387119952
39	NC_017846	TAATCA	2	12	135221	135232	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387119953
40	NC_017846	GGACAG	2	12	143100	143111	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	387119962
41	NC_017846	CAATAA	2	12	146934	146945	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387119965
42	NC_017846	CACCAA	2	12	147129	147140	50 %	0 %	0 %	50 %	387119965
43	NC_017846	AAATAG	2	12	152176	152187	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387119970
44	NC_017846	AACGCC	2	12	158546	158557	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	387119976
45	NC_017846	AACGCC	2	12	159961	159972	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	387119977
46	NC_017846	TTTTTG	2	12	166420	166431	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	387119982
47	NC_017846	TTGGTA	2	12	168960	168971	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387119984
48	NC_017846	ATTTTC	2	12	169470	169481	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387119984
49	NC_017846	TTATCA	2	12	170419	170430	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017846	GGTAAA	2	12	173621	173632	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387119988
51	NC_017846	AAATGA	2	12	173806	173817	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387119988
52	NC_017846	CGGAAC	2	12	175456	175467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387119991
53	NC_017846	AATTCT	2	12	179215	179226	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387119995
54	NC_017846	AACGTA	2	12	181965	181976	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387119998
55	NC_017846	TTCTAT	2	12	182858	182869	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387119998
56	NC_017846	AAAAAT	2	12	183360	183371	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387119998
57	NC_017846	CAAAAT	2	12	186092	186103	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387119999
58	NC_017846	TTTCGG	2	12	187271	187282	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387120001
59	NC_017846	AACATT	2	12	192591	192602	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387120004
60	NC_017846	TCTTTG	2	12	197042	197053	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387120008
61	NC_017846	CGGCAA	2	12	197640	197651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387120009
62	NC_017846	ATCAGG	2	12	203579	203590	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387120012
63	NC_017846	AGATTC	2	12	206652	206663	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387120015
64	NC_017846	CGGCTT	2	12	212817	212828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387120019
65	NC_017846	TCCTGC	2	12	214273	214284	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	387120020
66	NC_017846	ATACAA	2	12	218046	218057	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387120025
67	NC_017846	AAGCGG	2	12	220067	220078	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	387120026
68	NC_017846	TGCCTT	2	12	228145	228156	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387120033
69	NC_017846	TAAGAC	2	12	234821	234832	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387120041
70	NC_017846	ATAAAA	2	12	236879	236890	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387120044
71	NC_017846	GATATT	2	12	241179	241190	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387120048
72	NC_017846	CTGGAA	2	12	241377	241388	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387120048
73	NC_017846	ATTTTT	2	12	242760	242771	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017846	GCCTTA	2	12	245622	245633	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387120053
75	NC_017846	TAAAAA	2	12	247558	247569	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017846	GCTCAA	2	12	247771	247782	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387120055
77	NC_017846	CAGGAA	2	12	251189	251200	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387120058
78	NC_017846	TTAAGT	2	12	253869	253880	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387120060
79	NC_017846	ATATTT	2	12	254747	254758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387120061
80	NC_017846	GGCTAC	2	12	257001	257012	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387120064
81	NC_017846	ATTAAT	2	12	258053	258064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017846	TATAAT	2	12	259073	259084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017846	CAAAAA	2	12	261243	261254	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017846	CGCGCC	2	12	266108	266119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387120071
85	NC_017846	ATTCAG	2	12	269632	269643	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387120076
86	NC_017846	AATATC	2	12	271636	271647	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387120077
87	NC_017846	CAAAAC	2	12	273446	273457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387120079
88	NC_017846	ATTTGC	2	12	275761	275772	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017846	AGGTAA	2	12	277866	277877	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017846	AGGTAA	2	12	277985	277996	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017846	CTTTTT	2	12	280865	280876	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387120094
92	NC_017846	AAATTT	2	12	282976	282987	50 %	50 %	0 %	0 %	387120098
93	NC_017846	GAAACC	2	12	288646	288657	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387120102
94	NC_017846	AATTTA	2	12	289227	289238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017846	TCTTCC	2	12	293708	293719	0 %	50 %	0 %	50 %	387120107
96	NC_017846	CGGGAA	2	12	296819	296830	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	387120109
97	NC_017846	CGCCCC	2	12	308290	308301	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	387120121
98	NC_017846	GTTTTT	2	12	311283	311294	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	387120124
99	NC_017846	TACCGT	2	12	314292	314303	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387120125
100	NC_017846	AAAATT	2	12	315627	315638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387120126
101	NC_017846	AAAGAA	2	12	315985	315996	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387120126
102	NC_017846	CCGGCA	2	12	321322	321333	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	387120128
103	NC_017846	TTGAAA	2	12	322665	322676	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387120129
104	NC_017846	TTTGCC	2	12	322686	322697	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387120129
105	NC_017846	GGTGCC	2	12	325713	325724	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	387120133
106	NC_017846	ATCGTG	2	12	327119	327130	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387120134
107	NC_017846	AAAGTG	2	12	331738	331749	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017846	ATCGCC	2	12	339625	339636	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387120144
109	NC_017846	GATTAA	2	12	343395	343406	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387120147
110	NC_017846	CAATTT	2	12	344588	344599	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387120148
111	NC_017846	AAATCC	2	12	344604	344615	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387120148
112	NC_017846	CGGTAT	2	12	348931	348942	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387120153
113	NC_017846	CACTTT	2	12	357491	357502	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387120161
114	NC_017846	TTTGCC	2	12	358793	358804	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387120161
115	NC_017846	GCCTGT	2	12	359196	359207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387120161
116	NC_017846	TTTAAA	2	12	361006	361017	50 %	50 %	0 %	0 %	387120163
117	NC_017846	CGCTTT	2	12	364159	364170	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017846	CGTCTT	2	12	364470	364481	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017846	ATTTCA	2	12	365275	365286	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017846	CTCTGT	2	12	367126	367137	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017846	CTTTCG	2	12	367156	367167	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017846	GCCTTC	2	12	368793	368804	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017846	AGAATT	2	12	369698	369709	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017846	GTTTCC	2	12	373714	373725	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387120171
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233	NC_017846	GAAAAA	2	12	618088	618099	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
234	NC_017846	TTGAAT	2	12	630386	630397	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387120418
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237	NC_017846	CAGCCA	2	12	638530	638541	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	387120423
238	NC_017846	ATTGAT	2	12	639510	639521	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387120425
239	NC_017846	CGATTT	2	12	644264	644275	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387120432
240	NC_017846	TCAAAT	2	12	649876	649887	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387120438
241	NC_017846	TGCGGG	2	12	650295	650306	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	387120439
242	NC_017846	CAGAAG	2	12	651088	651099	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387120441
243	NC_017846	TGCATT	2	12	661146	661157	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387120451
244	NC_017846	CCGCTT	2	12	661629	661640	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	387120452
245	NC_017846	CAGTGA	2	12	662061	662072	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387120452
246	NC_017846	TTACGG	2	12	662684	662695	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387120452
247	NC_017846	GGAAAG	2	12	663250	663261	50 %	0 %	50 %	0 %	387120452
248	NC_017846	AATTTC	2	12	670080	670091	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387120461
249	NC_017846	CTGACG	2	12	672758	672769	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387120462
250	NC_017846	CTTTTG	2	12	676580	676591	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387120466
251	NC_017846	ATGTCC	2	12	680227	680238	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387120471
252	NC_017846	TGCGGT	2	12	681713	681724	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	387120473
253	NC_017846	CGATTT	2	12	683015	683026	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387120475
254	NC_017846	CAAATC	2	12	685781	685792	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387120478
255	NC_017846	GGAACC	2	12	686267	686278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387120478
256	NC_017846	GGAAGA	2	12	690455	690466	50 %	0 %	50 %	0 %	387120480
257	NC_017846	CAGCGG	2	12	700673	700684	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	387120491
258	NC_017846	TCGCCA	2	12	701092	701103	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387120491
259	NC_017846	TCGCCA	2	12	702660	702671	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387120493
260	NC_017846	ACTTCA	2	12	704366	704377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387120495
261	NC_017846	TTCGCC	2	12	708701	708712	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	387120497
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263	NC_017846	CAGGAT	2	12	717102	717113	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387120502
264	NC_017846	ACGGGC	2	12	718334	718345	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	387120503
265	NC_017846	CAGCAA	2	12	724528	724539	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387120505
266	NC_017846	CTTTAG	2	12	725020	725031	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387120505
267	NC_017846	ATGGCA	2	12	727299	727310	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387120505
268	NC_017846	GTGAAA	2	12	727589	727600	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387120505
269	NC_017846	CACCGC	2	12	729800	729811	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	387120506
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271	NC_017846	ACGAAA	2	12	735037	735048	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387120512
272	NC_017846	GATAAA	2	12	739628	739639	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
273	NC_017846	CGCTTT	2	12	741729	741740	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_017846	CGTCTT	2	12	742040	742051	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
275	NC_017846	ATTTCA	2	12	742845	742856	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
276	NC_017846	CTCTGT	2	12	744696	744707	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
277	NC_017846	CTTTCG	2	12	744726	744737	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
278	NC_017846	GCCTTC	2	12	746175	746186	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
279	NC_017846	ATTGAA	2	12	751556	751567	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387120525
280	NC_017846	AAGACC	2	12	759021	759032	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_017846	CCTTTA	2	12	760049	760060	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387120539
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290	NC_017846	GTGATA	2	12	766483	766494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387120551
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293	NC_017846	ACAGTC	2	12	784931	784942	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
294	NC_017846	GAAGAC	2	12	785400	785411	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387120569
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298	NC_017846	CGCAGG	2	12	792633	792644	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	387120578
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314	NC_017846	TTTTTA	2	12	827969	827980	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
315	NC_017846	GAAATC	2	12	829751	829762	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387120619
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337	NC_017846	ACCTCA	2	12	869652	869663	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
338	NC_017846	GAAATT	2	12	869689	869700	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
339	NC_017846	GACAGA	2	12	871032	871043	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387120657
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342	NC_017846	CGGTTG	2	12	881138	881149	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	387120668
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351	NC_017846	TTTATT	2	12	898651	898662	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
352	NC_017846	GTAATC	2	12	899168	899179	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387120682
353	NC_017846	ATCACC	2	12	901652	901663	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	387120686
354	NC_017846	TAGCCG	2	12	902410	902421	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387120687
355	NC_017846	TTTTTC	2	12	903132	903143	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387120687
356	NC_017846	TTCAAA	2	12	907266	907277	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
357	NC_017846	CAATAG	2	12	912579	912590	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387120699
358	NC_017846	GAACTG	2	12	913975	913986	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387120700
359	NC_017846	GGACAC	2	12	920167	920178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
360	NC_017846	TCTTAC	2	12	920201	920212	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387120704
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363	NC_017846	TGGCTA	2	12	937413	937424	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387120722
364	NC_017846	AATATC	2	12	937496	937507	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387120722
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390	NC_017846	CGACAA	2	12	1024723	1024734	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387120809
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454	NC_017846	AAAAAT	2	12	1198832	1198843	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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464	NC_017846	AAAATC	2	12	1223064	1223075	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387121022
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466	NC_017846	TTATGG	2	12	1225442	1225453	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387121024
467	NC_017846	GGAAAT	2	12	1226338	1226349	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387121024
468	NC_017846	ATAGTG	2	12	1227484	1227495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_017846	CGGGCG	2	12	1300253	1300264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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