MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans D7S-1 chromosome

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017846	AAAAAT	2	12	22297	22308	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017846	TATTTA	2	12	111512	111523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017846	AATAAA	2	12	126834	126845	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017846	TTATCA	2	12	170419	170430	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017846	ATTTTT	2	12	242760	242771	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017846	TAAAAA	2	12	247558	247569	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017846	ATTAAT	2	12	258053	258064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017846	TATAAT	2	12	259073	259084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017846	CAAAAA	2	12	261243	261254	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017846	ATTTGC	2	12	275761	275772	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017846	AGGTAA	2	12	277866	277877	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017846	AGGTAA	2	12	277985	277996	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017846	AATTTA	2	12	289227	289238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017846	AAAGTG	2	12	331738	331749	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017846	CGCTTT	2	12	364159	364170	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017846	CGTCTT	2	12	364470	364481	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017846	ATTTCA	2	12	365275	365286	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017846	CTCTGT	2	12	367126	367137	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017846	CTTTCG	2	12	367156	367167	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017846	GCCTTC	2	12	368793	368804	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017846	AGAATT	2	12	369698	369709	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017846	ACAAGC	2	12	388636	388647	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017846	AATAAA	2	12	436849	436860	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017846	TCGAAA	2	12	445784	445795	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017846	AATTGT	2	12	451224	451235	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017846	TGATCA	2	12	458105	458116	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017846	AATTAA	2	12	483022	483033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017846	ATTAAC	2	12	496087	496098	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017846	AACCAA	2	12	508541	508552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017846	AAATAT	2	12	517922	517933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017846	ATTATA	2	12	523157	523168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017846	TTAAAA	2	12	585687	585698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017846	AAAAAG	2	12	602248	602259	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017846	TTAACT	2	12	617887	617898	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017846	GAAAAA	2	12	618088	618099	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017846	GATAAA	2	12	739628	739639	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017846	CGCTTT	2	12	741729	741740	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017846	CGTCTT	2	12	742040	742051	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017846	ATTTCA	2	12	742845	742856	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017846	CTCTGT	2	12	744696	744707	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017846	CTTTCG	2	12	744726	744737	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017846	GCCTTC	2	12	746175	746186	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017846	AAGACC	2	12	759021	759032	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017846	ACAGTC	2	12	784931	784942	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017846	TTTTTA	2	12	827969	827980	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017846	AAGCAA	2	12	856937	856948	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017846	TATCAT	2	12	869524	869535	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017846	TAAAAC	2	12	869552	869563	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017846	TGAAGA	2	12	869607	869618	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017846	ACCTCA	2	12	869652	869663	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017846	GAAATT	2	12	869689	869700	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017846	TTTATT	2	12	898651	898662	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017846	TTCAAA	2	12	907266	907277	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017846	GGACAC	2	12	920167	920178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017846	TAAAAA	2	12	1022659	1022670	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017846	CAAAAG	2	12	1042911	1042922	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017846	GGACAC	2	12	1059597	1059608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017846	AGCAAA	2	12	1103599	1103610	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017846	AATAAA	2	12	1147134	1147145	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017846	TAAATT	2	12	1156427	1156438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017846	ATTGCA	2	12	1170536	1170547	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017846	TTGCGA	2	12	1197826	1197837	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017846	AAAAAT	2	12	1198832	1198843	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017846	ATAGTG	2	12	1227484	1227495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017846	AACGTA	2	12	1300203	1300214	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017846	CGGGCG	2	12	1300253	1300264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017846	AGCAAA	2	12	1320204	1320215	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017846	CGAAGG	2	12	1343305	1343316	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017846	AGCGAA	2	12	1344941	1344952	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017846	GACAGA	2	12	1344972	1344983	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017846	TGAAAT	2	12	1346824	1346835	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017846	AAGACG	2	12	1347629	1347640	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017846	GAAAGC	2	12	1347939	1347950	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017846	TTTCCT	2	12	1351115	1351126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017846	TATGTA	2	12	1363100	1363111	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017846	GGTAAA	2	12	1401859	1401870	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017846	TGTTTT	2	12	1464645	1464656	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017846	ACTGTC	2	12	1477837	1477848	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017846	TGAACC	2	12	1504517	1504528	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017846	CTTTAT	2	12	1519056	1519067	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017846	TAAAAA	2	12	1527113	1527124	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017846	CGAAGG	2	12	1538308	1538319	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017846	AGCGAA	2	12	1539756	1539767	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017846	GACAGA	2	12	1539787	1539798	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017846	TGAAAT	2	12	1541639	1541650	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017846	AAGACG	2	12	1542444	1542455	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017846	GAAAGC	2	12	1542754	1542765	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017846	GACTTT	2	12	1632018	1632029	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017846	GGACGG	2	12	1651375	1651386	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017846	GCTGGT	2	12	1656145	1656156	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017846	CGAAGG	2	12	1670642	1670653	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017846	AGCGAA	2	12	1672090	1672101	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_017846	GACAGA	2	12	1672121	1672132	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017846	TGAAAT	2	12	1673973	1673984	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017846	AAGACG	2	12	1674778	1674789	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017846	GAAAGC	2	12	1675088	1675099	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017846	ATTCAC	2	12	1720569	1720580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017846	TAAATT	2	12	1729660	1729671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017846	AATTTA	2	12	1745739	1745750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017846	AAATAA	2	12	1817789	1817800	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017846	CTTATT	2	12	1866721	1866732	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017846	GTGATC	2	12	1890966	1890977	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017846	ATCCCC	2	12	1919784	1919795	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_017846	CGTGGT	2	12	1942452	1942463	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_017846	TGTATC	2	12	1942605	1942616	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017846	AACTTT	2	12	1942808	1942819	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_017846	AGGGGG	2	12	1948801	1948812	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017846	TTTTTG	2	12	1973458	1973469	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017846	TTAAGA	2	12	1993251	1993262	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017846	TGATTT	2	12	2006098	2006109	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017846	CACGTG	2	12	2066711	2066722	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017846	ATTGAA	2	12	2084503	2084514	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017846	GTGTCC	2	12	2131062	2131073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017846	CGAAGG	2	12	2136632	2136643	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_017846	AGCGAA	2	12	2138080	2138091	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_017846	GACAGA	2	12	2138111	2138122	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_017846	TGAAAT	2	12	2139963	2139974	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017846	AAGACG	2	12	2140768	2140779	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017846	GAAAGC	2	12	2141078	2141089	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017846	AAACGT	2	12	2203870	2203881	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_017846	TTAGTA	2	12	2203918	2203929	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.