MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. animalis ATCC 25527 chromosome

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017834	ATGGGC	2	12	18806	18817	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017834	CATGAG	2	12	56939	56950	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017834	CGCACT	2	12	155153	155164	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017834	GCATGG	2	12	169825	169836	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017834	CTGCTT	2	12	180759	180770	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017834	GATCTT	2	12	181621	181632	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017834	GGAGAT	2	12	206465	206476	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017834	GCATAT	2	12	231009	231020	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017834	CGATTT	2	12	250732	250743	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017834	ACGGGT	2	12	269259	269270	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017834	GCTGAG	2	12	289173	289184	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017834	AACGAA	2	12	296750	296761	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017834	GAGACG	2	12	301046	301057	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017834	CTGCGG	2	12	408137	408148	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017834	GCTGAA	2	12	501389	501400	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017834	GCAGCC	2	12	518099	518110	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017834	TCGAGT	2	12	521039	521050	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017834	CAATCT	2	12	521104	521115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017834	TGAGAT	2	12	521359	521370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017834	AGTAAA	2	12	521880	521891	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017834	CATGCA	2	12	556094	556105	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017834	TGCGCA	2	12	595281	595292	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017834	GGAATC	2	12	637578	637589	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017834	TCGCTC	2	12	672203	672214	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017834	GATTGC	2	12	674142	674153	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017834	TCGCTC	2	12	674199	674210	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017834	GACGGC	2	12	693867	693878	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017834	ATGCGT	2	12	717451	717462	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017834	ATGCCC	2	12	768520	768531	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017834	CTGCGG	2	12	849021	849032	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017834	TTAGAC	2	12	867125	867136	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017834	AAAAGG	2	12	921374	921385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017834	AACCGG	2	12	1045319	1045330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017834	GCCATC	2	12	1050199	1050210	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017834	TCGCTT	2	12	1112284	1112295	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017834	ACATGA	2	12	1115513	1115524	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017834	ACTCAT	2	12	1134820	1134831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017834	CCATAT	2	12	1150518	1150529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017834	TTCCCT	2	12	1252584	1252595	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017834	CGTAAG	2	12	1367262	1367273	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017834	CAACCA	2	12	1367411	1367422	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017834	TGGCTG	2	12	1476832	1476843	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017834	GTTCAT	2	12	1495291	1495302	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017834	ATATCT	2	12	1503371	1503382	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017834	CGCTTG	2	12	1593114	1593125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017834	TCGTTC	2	12	1640150	1640161	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017834	GAGAAA	2	12	1654345	1654356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017834	TGCCCT	2	12	1696231	1696242	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017834	GAACGC	2	12	1697855	1697866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017834	CGCCGT	2	12	1714016	1714027	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017834	CAAAAA	2	12	1753781	1753792	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017834	AGCATC	2	12	1775501	1775512	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017834	CTTTTA	2	12	1787691	1787702	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017834	GCCATG	2	12	1807893	1807904	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017834	AGGAAC	2	12	1808088	1808099	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017834	TGCAAT	2	12	1815956	1815967	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017834	CCTTTG	2	12	1878454	1878465	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017834	ATGCAG	2	12	1882877	1882888	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017834	CACGCG	2	12	1894148	1894159	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.