MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. animalis ATCC 25527 chromosome

Total Repeats: 1174

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017834	ACCAC	2	10	1764	1773	40 %	0 %	0 %	60 %	386866199
2	NC_017834	CCGGC	2	10	2781	2790	0 %	0 %	40 %	60 %	386866200
3	NC_017834	CGATC	2	10	5832	5841	20 %	20 %	20 %	40 %	386866203
4	NC_017834	AAGGC	2	10	7646	7655	40 %	0 %	40 %	20 %	386866203
5	NC_017834	GGCCG	2	10	14143	14152	0 %	0 %	60 %	40 %	386866208
6	NC_017834	GCACG	2	10	14305	14314	20 %	0 %	40 %	40 %	386866208
7	NC_017834	GGTGG	2	10	14950	14959	0 %	20 %	80 %	0 %	386866208
8	NC_017834	GCGAG	2	10	15682	15691	20 %	0 %	60 %	20 %	386866209
9	NC_017834	GATTG	2	10	16603	16612	20 %	40 %	40 %	0 %	386866209
10	NC_017834	GACGG	2	10	20721	20730	20 %	0 %	60 %	20 %	386866214
11	NC_017834	CGCAC	2	10	24064	24073	20 %	0 %	20 %	60 %	386866217
12	NC_017834	AGCGC	2	10	25194	25203	20 %	0 %	40 %	40 %	386866217
13	NC_017834	GGGGA	2	10	26609	26618	20 %	0 %	80 %	0 %	386866218
14	NC_017834	TGCAG	2	10	28980	28989	20 %	20 %	40 %	20 %	386866221
15	NC_017834	AGACA	2	10	33945	33954	60 %	0 %	20 %	20 %	386866228
16	NC_017834	GAGCG	2	10	37410	37419	20 %	0 %	60 %	20 %	386866231
17	NC_017834	TATCG	2	10	41276	41285	20 %	40 %	20 %	20 %	386866236
18	NC_017834	TCGGT	2	10	42760	42769	0 %	40 %	40 %	20 %	386866236
19	NC_017834	TCGCG	2	10	43066	43075	0 %	20 %	40 %	40 %	386866237
20	NC_017834	GTCCA	2	10	43298	43307	20 %	20 %	20 %	40 %	386866237
21	NC_017834	AGGGC	2	10	43861	43870	20 %	0 %	60 %	20 %	386866237
22	NC_017834	GGCGG	2	10	46944	46953	0 %	0 %	80 %	20 %	386866240
23	NC_017834	GGAAG	2	10	47264	47273	40 %	0 %	60 %	0 %	386866240
24	NC_017834	TTTGA	2	10	48108	48117	20 %	60 %	20 %	0 %	386866240
25	NC_017834	GAGTT	2	10	48172	48181	20 %	40 %	40 %	0 %	386866240
26	NC_017834	GCTAT	2	10	48238	48247	20 %	40 %	20 %	20 %	386866240
27	NC_017834	CAAGC	2	10	51359	51368	40 %	0 %	20 %	40 %	386866245
28	NC_017834	GAATG	2	10	55031	55040	40 %	20 %	40 %	0 %	386866249
29	NC_017834	GCCTT	2	10	59228	59237	0 %	40 %	20 %	40 %	386866253
30	NC_017834	TGCCG	2	10	61687	61696	0 %	20 %	40 %	40 %	386866257
31	NC_017834	CGAGG	2	10	61756	61765	20 %	0 %	60 %	20 %	386866257
32	NC_017834	GCCTT	2	10	62911	62920	0 %	40 %	20 %	40 %	386866258
33	NC_017834	GCGAG	2	10	63182	63191	20 %	0 %	60 %	20 %	386866258
34	NC_017834	TTCGA	2	10	64677	64686	20 %	40 %	20 %	20 %	386866259
35	NC_017834	TGTGC	2	10	66034	66043	0 %	40 %	40 %	20 %	386866260
36	NC_017834	ATCGC	2	10	68914	68923	20 %	20 %	20 %	40 %	386866263
37	NC_017834	TGGGG	2	10	69613	69622	0 %	20 %	80 %	0 %	386866264
38	NC_017834	CAATA	2	10	71807	71816	60 %	20 %	0 %	20 %	386866265
39	NC_017834	GCTCG	2	10	75281	75290	0 %	20 %	40 %	40 %	386866267
40	NC_017834	GCTGA	2	10	77671	77680	20 %	20 %	40 %	20 %	386866269
41	NC_017834	CATCG	2	10	79471	79480	20 %	20 %	20 %	40 %	386866269
42	NC_017834	CGCAT	2	10	80294	80303	20 %	20 %	20 %	40 %	386866270
43	NC_017834	CGGTG	2	10	82060	82069	0 %	20 %	60 %	20 %	386866271
44	NC_017834	TCATT	2	10	82976	82985	20 %	60 %	0 %	20 %	386866271
45	NC_017834	CCAAA	2	10	83459	83468	60 %	0 %	0 %	40 %	386866272
46	NC_017834	CCGGG	2	10	83951	83960	0 %	0 %	60 %	40 %	386866273
47	NC_017834	CGAAC	2	10	90923	90932	40 %	0 %	20 %	40 %	386866278
48	NC_017834	GCTCG	2	10	92275	92284	0 %	20 %	40 %	40 %	386866280
49	NC_017834	GGTGC	2	10	97456	97465	0 %	20 %	60 %	20 %	386866284
50	NC_017834	CCATG	2	10	98992	99001	20 %	20 %	20 %	40 %	386866285
51	NC_017834	GTCTT	2	10	103940	103949	0 %	60 %	20 %	20 %	386866289
52	NC_017834	TGTGC	2	10	106074	106083	0 %	40 %	40 %	20 %	386866290
53	NC_017834	GCGCC	2	10	108127	108136	0 %	0 %	40 %	60 %	386866291
54	NC_017834	GCCGC	2	10	109083	109092	0 %	0 %	40 %	60 %	386866292
55	NC_017834	GGCCG	2	10	112237	112246	0 %	0 %	60 %	40 %	386866295
56	NC_017834	TGCGA	2	10	117086	117095	20 %	20 %	40 %	20 %	386866299
57	NC_017834	TGGCG	2	10	117601	117610	0 %	20 %	60 %	20 %	386866299
58	NC_017834	ACGGC	2	10	117693	117702	20 %	0 %	40 %	40 %	386866299
59	NC_017834	GACGA	2	10	117749	117758	40 %	0 %	40 %	20 %	386866299
60	NC_017834	ACCGA	2	10	117974	117983	40 %	0 %	20 %	40 %	386866299
61	NC_017834	TCGCC	2	10	118218	118227	0 %	20 %	20 %	60 %	386866299
62	NC_017834	GCCCG	2	10	120127	120136	0 %	0 %	40 %	60 %	386866300
63	NC_017834	AGTCG	2	10	120475	120484	20 %	20 %	40 %	20 %	386866300
64	NC_017834	CGCGT	2	10	120923	120932	0 %	20 %	40 %	40 %	386866301
65	NC_017834	TGGTG	2	10	122723	122732	0 %	40 %	60 %	0 %	386866302
66	NC_017834	GTTCG	2	10	124905	124914	0 %	40 %	40 %	20 %	386866304
67	NC_017834	TCGAA	2	10	126521	126530	40 %	20 %	20 %	20 %	386866305
68	NC_017834	GCGGT	2	10	127854	127863	0 %	20 %	60 %	20 %	386866306
69	NC_017834	TCATG	2	10	128176	128185	20 %	40 %	20 %	20 %	386866307
70	NC_017834	GCGAG	2	10	128293	128302	20 %	0 %	60 %	20 %	386866307
71	NC_017834	GCCGA	2	10	129419	129428	20 %	0 %	40 %	40 %	386866310
72	NC_017834	TCGCG	2	10	130319	130328	0 %	20 %	40 %	40 %	386866311
73	NC_017834	CGCAT	2	10	135324	135333	20 %	20 %	20 %	40 %	386866317
74	NC_017834	TGCTC	2	10	139282	139291	0 %	40 %	20 %	40 %	386866322
75	NC_017834	CGGCT	2	10	141128	141137	0 %	20 %	40 %	40 %	386866324
76	NC_017834	TCCAG	2	10	141342	141351	20 %	20 %	20 %	40 %	386866324
77	NC_017834	GTGCG	2	10	141736	141745	0 %	20 %	60 %	20 %	386866324
78	NC_017834	CGGCC	2	10	144641	144650	0 %	0 %	40 %	60 %	386866326
79	NC_017834	GGCCA	2	10	144909	144918	20 %	0 %	40 %	40 %	386866326
80	NC_017834	CAAGA	2	10	147928	147937	60 %	0 %	20 %	20 %	386866329
81	NC_017834	GACAA	2	10	150152	150161	60 %	0 %	20 %	20 %	386866331
82	NC_017834	CCCGA	2	10	150329	150338	20 %	0 %	20 %	60 %	386866331
83	NC_017834	AAATA	2	10	151964	151973	80 %	20 %	0 %	0 %	386866332
84	NC_017834	CGACG	2	10	152816	152825	20 %	0 %	40 %	40 %	386866333
85	NC_017834	GCACC	2	10	156952	156961	20 %	0 %	20 %	60 %	386866335
86	NC_017834	GCTCG	2	10	157857	157866	0 %	20 %	40 %	40 %	386866336
87	NC_017834	GTATC	2	10	159043	159052	20 %	40 %	20 %	20 %	386866337
88	NC_017834	CGCAT	2	10	159524	159533	20 %	20 %	20 %	40 %	386866337
89	NC_017834	GGGAT	2	10	160321	160330	20 %	20 %	60 %	0 %	386866337
90	NC_017834	TGCCG	2	10	160843	160852	0 %	20 %	40 %	40 %	386866338
91	NC_017834	CGATG	2	10	162495	162504	20 %	20 %	40 %	20 %	386866338
92	NC_017834	CGACC	2	10	163716	163725	20 %	0 %	20 %	60 %	386866340
93	NC_017834	GCTCG	2	10	163940	163949	0 %	20 %	40 %	40 %	386866341
94	NC_017834	GCGTC	2	10	165029	165038	0 %	20 %	40 %	40 %	386866341
95	NC_017834	CACCG	2	10	166243	166252	20 %	0 %	20 %	60 %	386866342
96	NC_017834	GCGCC	2	10	168109	168118	0 %	0 %	40 %	60 %	386866343
97	NC_017834	CCGCG	2	10	168793	168802	0 %	0 %	40 %	60 %	386866343
98	NC_017834	GCTCG	2	10	172534	172543	0 %	20 %	40 %	40 %	386866345
99	NC_017834	TGACT	2	10	173413	173422	20 %	40 %	20 %	20 %	386866346
100	NC_017834	GCATC	2	10	174254	174263	20 %	20 %	20 %	40 %	386866346
101	NC_017834	TCGCG	2	10	174389	174398	0 %	20 %	40 %	40 %	386866346
102	NC_017834	GCCTG	2	10	177689	177698	0 %	20 %	40 %	40 %	386866348
103	NC_017834	CACCG	2	10	178079	178088	20 %	0 %	20 %	60 %	386866348
104	NC_017834	TGCCG	2	10	179123	179132	0 %	20 %	40 %	40 %	386866349
105	NC_017834	TGCGC	2	10	182146	182155	0 %	20 %	40 %	40 %	386866352
106	NC_017834	CCACG	2	10	183774	183783	20 %	0 %	20 %	60 %	386866353
107	NC_017834	TCGAT	2	10	185076	185085	20 %	40 %	20 %	20 %	386866354
108	NC_017834	AGGTG	2	10	187397	187406	20 %	20 %	60 %	0 %	386866357
109	NC_017834	CGCGA	2	10	188127	188136	20 %	0 %	40 %	40 %	386866357
110	NC_017834	CTCGC	2	10	188758	188767	0 %	20 %	20 %	60 %	386866358
111	NC_017834	CGATG	2	10	189266	189275	20 %	20 %	40 %	20 %	386866359
112	NC_017834	CGCCA	2	10	190364	190373	20 %	0 %	20 %	60 %	386866359
113	NC_017834	CGTGG	2	10	191055	191064	0 %	20 %	60 %	20 %	386866359
114	NC_017834	TCGCC	2	10	193096	193105	0 %	20 %	20 %	60 %	386866360
115	NC_017834	ACAGC	2	10	197428	197437	40 %	0 %	20 %	40 %	386866363
116	NC_017834	GCTCG	2	10	197988	197997	0 %	20 %	40 %	40 %	386866364
117	NC_017834	TCGAA	2	10	199148	199157	40 %	20 %	20 %	20 %	386866364
118	NC_017834	GCGAG	2	10	199301	199310	20 %	0 %	60 %	20 %	386866364
119	NC_017834	CGGCG	2	10	200651	200660	0 %	0 %	60 %	40 %	386866365
120	NC_017834	TGCCG	2	10	201228	201237	0 %	20 %	40 %	40 %	386866365
121	NC_017834	TGTGT	2	10	203081	203090	0 %	60 %	40 %	0 %	386866366
122	NC_017834	TGCCC	2	10	203126	203135	0 %	20 %	20 %	60 %	386866366
123	NC_017834	GCGTG	2	10	208974	208983	0 %	20 %	60 %	20 %	386866372
124	NC_017834	TCGAC	2	10	209687	209696	20 %	20 %	20 %	40 %	386866373
125	NC_017834	GCCGG	2	10	212636	212645	0 %	0 %	60 %	40 %	386866374
126	NC_017834	ATTGC	2	10	212784	212793	20 %	40 %	20 %	20 %	386866374
127	NC_017834	CACGC	2	10	215823	215832	20 %	0 %	20 %	60 %	386866377
128	NC_017834	CCAGC	2	10	215973	215982	20 %	0 %	20 %	60 %	386866377
129	NC_017834	CCGTG	2	10	216461	216470	0 %	20 %	40 %	40 %	386866377
130	NC_017834	CCTTG	2	10	217319	217328	0 %	40 %	20 %	40 %	386866378
131	NC_017834	TCAGC	2	10	220545	220554	20 %	20 %	20 %	40 %	386866382
132	NC_017834	TCGGC	2	10	221339	221348	0 %	20 %	40 %	40 %	386866383
133	NC_017834	CGACC	2	10	221492	221501	20 %	0 %	20 %	60 %	386866383
134	NC_017834	GCGAC	2	10	222943	222952	20 %	0 %	40 %	40 %	386866385
135	NC_017834	GCGGA	2	10	224028	224037	20 %	0 %	60 %	20 %	386866388
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141	NC_017834	GGTGA	2	10	239292	239301	20 %	20 %	60 %	0 %	386866399
142	NC_017834	CGGCC	2	10	241297	241306	0 %	0 %	40 %	60 %	386866402
143	NC_017834	CGGCA	2	10	242717	242726	20 %	0 %	40 %	40 %	386866402
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177	NC_017834	GACGA	2	10	302539	302548	40 %	0 %	40 %	20 %	386866445
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254	NC_017834	TGGTG	2	10	412999	413008	0 %	40 %	60 %	0 %	386866528
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256	NC_017834	GCAGG	2	10	414263	414272	20 %	0 %	60 %	20 %	386866528
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258	NC_017834	CGTGG	2	10	416083	416092	0 %	20 %	60 %	20 %	386866530
259	NC_017834	ACCGT	2	10	416440	416449	20 %	20 %	20 %	40 %	386866530
260	NC_017834	ACCGG	2	10	416594	416603	20 %	0 %	40 %	40 %	386866530
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262	NC_017834	CCGCC	2	10	419652	419661	0 %	0 %	20 %	80 %	386866533
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