MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. animalis ATCC 25527 chromosome

Total Repeats: 4396

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017834	GGCT	2	8	236	243	0 %	25 %	50 %	25 %	386866199
2	NC_017834	GTTC	2	8	789	796	0 %	50 %	25 %	25 %	386866199
3	NC_017834	CGAG	2	8	1053	1060	25 %	0 %	50 %	25 %	386866199
4	NC_017834	ACGA	2	8	1067	1074	50 %	0 %	25 %	25 %	386866199
5	NC_017834	ACGC	2	8	1549	1556	25 %	0 %	25 %	50 %	386866199
6	NC_017834	CATG	2	8	1777	1784	25 %	25 %	25 %	25 %	386866199
7	NC_017834	TTCG	2	8	2509	2516	0 %	50 %	25 %	25 %	386866200
8	NC_017834	ACGC	2	8	2550	2557	25 %	0 %	25 %	50 %	386866200
9	NC_017834	AGGA	2	8	3647	3654	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017834	CGTT	2	8	4096	4103	0 %	50 %	25 %	25 %	386866201
11	NC_017834	CGGG	2	8	4467	4474	0 %	0 %	75 %	25 %	386866201
12	NC_017834	GAAT	2	8	4532	4539	50 %	25 %	25 %	0 %	386866201
13	NC_017834	GCCG	2	8	4908	4915	0 %	0 %	50 %	50 %	386866201
14	NC_017834	CATG	2	8	5080	5087	25 %	25 %	25 %	25 %	386866201
15	NC_017834	GCCG	2	8	5135	5142	0 %	0 %	50 %	50 %	386866202
16	NC_017834	CGCA	2	8	5354	5361	25 %	0 %	25 %	50 %	386866202
17	NC_017834	TGGG	2	8	5367	5374	0 %	25 %	75 %	0 %	386866202
18	NC_017834	GCAA	2	8	5545	5552	50 %	0 %	25 %	25 %	386866202
19	NC_017834	CAAC	2	8	5788	5795	50 %	0 %	0 %	50 %	386866203
20	NC_017834	CGAG	2	8	7217	7224	25 %	0 %	50 %	25 %	386866203
21	NC_017834	CGGC	2	8	7538	7545	0 %	0 %	50 %	50 %	386866203
22	NC_017834	AACC	2	8	7975	7982	50 %	0 %	0 %	50 %	386866204
23	NC_017834	CGAT	2	8	8119	8126	25 %	25 %	25 %	25 %	386866204
24	NC_017834	CCGC	2	8	8569	8576	0 %	0 %	25 %	75 %	386866204
25	NC_017834	TGCG	2	8	8827	8834	0 %	25 %	50 %	25 %	386866204
26	NC_017834	CATT	2	8	9145	9152	25 %	50 %	0 %	25 %	386866204
27	NC_017834	CGCC	2	8	9185	9192	0 %	0 %	25 %	75 %	386866204
28	NC_017834	GCAC	2	8	9751	9758	25 %	0 %	25 %	50 %	386866204
29	NC_017834	GATG	2	8	10223	10230	25 %	25 %	50 %	0 %	386866204
30	NC_017834	ACCG	2	8	10989	10996	25 %	0 %	25 %	50 %	386866205
31	NC_017834	CGCC	2	8	11029	11036	0 %	0 %	25 %	75 %	386866205
32	NC_017834	CGGT	2	8	11160	11167	0 %	25 %	50 %	25 %	386866205
33	NC_017834	CACG	2	8	11483	11490	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017834	TTCA	2	8	11816	11823	25 %	50 %	0 %	25 %	386866206
35	NC_017834	GCTG	2	8	11912	11919	0 %	25 %	50 %	25 %	386866206
36	NC_017834	ATGC	2	8	12072	12079	25 %	25 %	25 %	25 %	386866206
37	NC_017834	CTGA	2	8	13519	13526	25 %	25 %	25 %	25 %	386866207
38	NC_017834	TGCA	2	8	13677	13684	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017834	GCGA	3	12	14629	14640	25 %	0 %	50 %	25 %	386866208
40	NC_017834	CGCC	2	8	14748	14755	0 %	0 %	25 %	75 %	386866208
41	NC_017834	GCCG	2	8	15103	15110	0 %	0 %	50 %	50 %	386866208
42	NC_017834	CCTC	2	8	15277	15284	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
43	NC_017834	GACC	2	8	16114	16121	25 %	0 %	25 %	50 %	386866209
44	NC_017834	TGCG	2	8	16249	16256	0 %	25 %	50 %	25 %	386866209
45	NC_017834	CGGC	2	8	16376	16383	0 %	0 %	50 %	50 %	386866209
46	NC_017834	GCCG	2	8	16562	16569	0 %	0 %	50 %	50 %	386866209
47	NC_017834	GCCG	2	8	16976	16983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017834	TGGC	2	8	17227	17234	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017834	GATC	2	8	17428	17435	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017834	TTCC	2	8	17602	17609	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017834	CTGA	2	8	18064	18071	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017834	GCGT	2	8	19196	19203	0 %	25 %	50 %	25 %	386866212
53	NC_017834	ATGT	2	8	19348	19355	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017834	AGAA	2	8	19736	19743	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017834	GGTG	2	8	19803	19810	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017834	ATTC	2	8	19811	19818	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017834	ACTC	2	8	20477	20484	25 %	25 %	0 %	50 %	386866213
58	NC_017834	CGGG	2	8	20504	20511	0 %	0 %	75 %	25 %	386866213
59	NC_017834	GGAA	2	8	20548	20555	50 %	0 %	50 %	0 %	386866213
60	NC_017834	TTCT	2	8	20913	20920	0 %	75 %	0 %	25 %	386866214
61	NC_017834	TGAC	2	8	21587	21594	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017834	CAGT	2	8	21694	21701	25 %	25 %	25 %	25 %	386866215
63	NC_017834	GCAT	2	8	22493	22500	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017834	CCAA	2	8	22713	22720	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017834	CGCA	2	8	23916	23923	25 %	0 %	25 %	50 %	386866217
66	NC_017834	GTGA	2	8	24400	24407	25 %	25 %	50 %	0 %	386866217
67	NC_017834	GCGA	2	8	24448	24455	25 %	0 %	50 %	25 %	386866217
68	NC_017834	GCCT	2	8	24674	24681	0 %	25 %	25 %	50 %	386866217
69	NC_017834	ATCG	2	8	24712	24719	25 %	25 %	25 %	25 %	386866217
70	NC_017834	CTAC	2	8	24773	24780	25 %	25 %	0 %	50 %	386866217
71	NC_017834	GGCG	2	8	24849	24856	0 %	0 %	75 %	25 %	386866217
72	NC_017834	GAGT	2	8	25510	25517	25 %	25 %	50 %	0 %	386866217
73	NC_017834	ACTG	2	8	26959	26966	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017834	GTCG	2	8	27231	27238	0 %	25 %	50 %	25 %	386866219
75	NC_017834	GCTT	2	8	27633	27640	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017834	GCAG	2	8	28022	28029	25 %	0 %	50 %	25 %	386866220
77	NC_017834	AATC	2	8	28156	28163	50 %	25 %	0 %	25 %	386866220
78	NC_017834	GACT	2	8	28533	28540	25 %	25 %	25 %	25 %	386866220
79	NC_017834	GTTT	2	8	28578	28585	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017834	GCCA	2	8	28819	28826	25 %	0 %	25 %	50 %	386866221
81	NC_017834	AATG	2	8	29085	29092	50 %	25 %	25 %	0 %	386866221
82	NC_017834	TGAG	2	8	29245	29252	25 %	25 %	50 %	0 %	386866222
83	NC_017834	TGAG	2	8	30139	30146	25 %	25 %	50 %	0 %	386866223
84	NC_017834	GGTG	2	8	30185	30192	0 %	25 %	75 %	0 %	386866223
85	NC_017834	AGCC	2	8	30252	30259	25 %	0 %	25 %	50 %	386866223
86	NC_017834	TTTC	2	8	30530	30537	0 %	75 %	0 %	25 %	386866224
87	NC_017834	CCTT	2	8	30539	30546	0 %	50 %	0 %	50 %	386866224
88	NC_017834	GCAT	2	8	30732	30739	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017834	AAGG	2	8	30931	30938	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017834	CCTT	2	8	31013	31020	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017834	TTCG	2	8	31194	31201	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017834	ACCG	2	8	31371	31378	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017834	GTGC	2	8	31890	31897	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017834	GACG	2	8	32202	32209	25 %	0 %	50 %	25 %	386866226
95	NC_017834	GCGG	2	8	32545	32552	0 %	0 %	75 %	25 %	386866227
96	NC_017834	AGGT	2	8	32717	32724	25 %	25 %	50 %	0 %	386866227
97	NC_017834	CTTA	2	8	33268	33275	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017834	ACGT	2	8	33781	33788	25 %	25 %	25 %	25 %	386866228
99	NC_017834	GCGG	2	8	34709	34716	0 %	0 %	75 %	25 %	386866228
100	NC_017834	GTTC	2	8	35316	35323	0 %	50 %	25 %	25 %	386866228
101	NC_017834	GGCA	2	8	35543	35550	25 %	0 %	50 %	25 %	386866228
102	NC_017834	CTGC	2	8	35956	35963	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017834	TAGA	2	8	36105	36112	50 %	25 %	25 %	0 %	386866229
104	NC_017834	AGGA	2	8	36365	36372	50 %	0 %	50 %	0 %	386866230
105	NC_017834	TCGC	2	8	36760	36767	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017834	GCAT	2	8	36895	36902	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017834	TTGT	2	8	38621	38628	0 %	75 %	25 %	0 %	386866232
108	NC_017834	CATG	2	8	39278	39285	25 %	25 %	25 %	25 %	386866233
109	NC_017834	GCCT	2	8	39721	39728	0 %	25 %	25 %	50 %	386866234
110	NC_017834	CAAG	2	8	39794	39801	50 %	0 %	25 %	25 %	386866234
111	NC_017834	CGTT	2	8	39868	39875	0 %	50 %	25 %	25 %	386866234
112	NC_017834	TTGC	2	8	39962	39969	0 %	50 %	25 %	25 %	386866234
113	NC_017834	CATA	2	8	40189	40196	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017834	AGTG	2	8	40383	40390	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017834	CAAA	4	16	40472	40487	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017834	GTTT	2	8	40777	40784	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017834	GTGC	2	8	41393	41400	0 %	25 %	50 %	25 %	386866236
118	NC_017834	CGTG	2	8	41526	41533	0 %	25 %	50 %	25 %	386866236
119	NC_017834	TCCA	2	8	41599	41606	25 %	25 %	0 %	50 %	386866236
120	NC_017834	CCGT	2	8	42324	42331	0 %	25 %	25 %	50 %	386866236
121	NC_017834	GAGT	2	8	42421	42428	25 %	25 %	50 %	0 %	386866236
122	NC_017834	TCCG	2	8	42741	42748	0 %	25 %	25 %	50 %	386866236
123	NC_017834	TCCG	2	8	42844	42851	0 %	25 %	25 %	50 %	386866236
124	NC_017834	GGTC	2	8	43156	43163	0 %	25 %	50 %	25 %	386866237
125	NC_017834	TCAC	2	8	43554	43561	25 %	25 %	0 %	50 %	386866237
126	NC_017834	GCTT	2	8	43565	43572	0 %	50 %	25 %	25 %	386866237
127	NC_017834	GATT	2	8	45717	45724	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017834	GCTT	2	8	45879	45886	0 %	50 %	25 %	25 %	386866239
129	NC_017834	AATA	2	8	46661	46668	75 %	25 %	0 %	0 %	386866240
130	NC_017834	TTGC	2	8	46875	46882	0 %	50 %	25 %	25 %	386866240
131	NC_017834	ATCC	2	8	47467	47474	25 %	25 %	0 %	50 %	386866240
132	NC_017834	AAGC	2	8	48190	48197	50 %	0 %	25 %	25 %	386866240
133	NC_017834	GCCT	2	8	49885	49892	0 %	25 %	25 %	50 %	386866242
134	NC_017834	TTTC	2	8	50074	50081	0 %	75 %	0 %	25 %	386866242
135	NC_017834	CGCT	2	8	50345	50352	0 %	25 %	25 %	50 %	386866243
136	NC_017834	ATCA	2	8	50396	50403	50 %	25 %	0 %	25 %	386866243
137	NC_017834	GGTC	2	8	51369	51376	0 %	25 %	50 %	25 %	386866245
138	NC_017834	TGAT	2	8	51918	51925	25 %	50 %	25 %	0 %	386866246
139	NC_017834	TCGT	2	8	52200	52207	0 %	50 %	25 %	25 %	386866246
140	NC_017834	AGTG	2	8	52341	52348	25 %	25 %	50 %	0 %	386866246
141	NC_017834	CAAT	2	8	52411	52418	50 %	25 %	0 %	25 %	386866246
142	NC_017834	GAGG	2	8	53248	53255	25 %	0 %	75 %	0 %	386866247
143	NC_017834	ATCC	2	8	53581	53588	25 %	25 %	0 %	50 %	386866247
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