MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Burkholderia pseudomallei 1026b chromosome 2

Total Repeats: 4003

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017832	TGCGC	2	10	45	54	0 %	20 %	40 %	40 %	386863736
2	NC_017832	TGGCT	2	10	1289	1298	0 %	40 %	40 %	20 %	386863737
3	NC_017832	GTGCG	2	10	1500	1509	0 %	20 %	60 %	20 %	386863737
4	NC_017832	GCGCC	2	10	1839	1848	0 %	0 %	40 %	60 %	386863737
5	NC_017832	CGGCA	2	10	2527	2536	20 %	0 %	40 %	40 %	386863738
6	NC_017832	CGGGC	2	10	4962	4971	0 %	0 %	60 %	40 %	386863741
7	NC_017832	CGCAT	2	10	6054	6063	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_017832	TCGAA	2	10	7209	7218	40 %	20 %	20 %	20 %	386863743
9	NC_017832	ACGCG	2	10	7606	7615	20 %	0 %	40 %	40 %	386863743
10	NC_017832	CGACG	2	10	10147	10156	20 %	0 %	40 %	40 %	386863746
11	NC_017832	GTGCC	2	10	10373	10382	0 %	20 %	40 %	40 %	386863746
12	NC_017832	GCACG	2	10	10522	10531	20 %	0 %	40 %	40 %	386863746
13	NC_017832	CCGCG	2	10	13261	13270	0 %	0 %	40 %	60 %	386863749
14	NC_017832	CAGCG	2	10	14418	14427	20 %	0 %	40 %	40 %	386863751
15	NC_017832	CGGCG	2	10	14461	14470	0 %	0 %	60 %	40 %	386863751
16	NC_017832	CGCGG	2	10	15368	15377	0 %	0 %	60 %	40 %	386863752
17	NC_017832	TGCGA	2	10	19396	19405	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017832	GCGCG	2	10	19413	19422	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017832	CGATG	2	10	19541	19550	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017832	CGCGC	2	10	20007	20016	0 %	0 %	40 %	60 %	386863757
21	NC_017832	GCGCG	2	10	21352	21361	0 %	0 %	60 %	40 %	386863758
22	NC_017832	CGATT	2	10	23018	23027	20 %	40 %	20 %	20 %	386863759
23	NC_017832	GCGTC	2	10	23314	23323	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_017832	GCCGC	2	10	23622	23631	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
25	NC_017832	CGCGG	2	10	24659	24668	0 %	0 %	60 %	40 %	386863762
26	NC_017832	CGCAA	2	10	24918	24927	40 %	0 %	20 %	40 %	386863762
27	NC_017832	GCCGC	2	10	27236	27245	0 %	0 %	40 %	60 %	386863763
28	NC_017832	CGCGC	2	10	28679	28688	0 %	0 %	40 %	60 %	386863765
29	NC_017832	GCCGA	2	10	29695	29704	20 %	0 %	40 %	40 %	386863766
30	NC_017832	CGAGC	2	10	30445	30454	20 %	0 %	40 %	40 %	386863767
31	NC_017832	TCGCC	2	10	31310	31319	0 %	20 %	20 %	60 %	386863768
32	NC_017832	GCGTG	2	10	31525	31534	0 %	20 %	60 %	20 %	386863768
33	NC_017832	AGGCG	2	10	32230	32239	20 %	0 %	60 %	20 %	386863769
34	NC_017832	GCGCC	2	10	34202	34211	0 %	0 %	40 %	60 %	386863770
35	NC_017832	GCGAC	2	10	35430	35439	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_017832	ACGTC	2	10	36056	36065	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_017832	CACGG	2	10	37766	37775	20 %	0 %	40 %	40 %	386863774
38	NC_017832	GCCGC	2	10	40451	40460	0 %	0 %	40 %	60 %	386863777
39	NC_017832	GTGCG	2	10	40724	40733	0 %	20 %	60 %	20 %	386863777
40	NC_017832	ATTGC	2	10	41025	41034	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017832	CGGAT	2	10	41540	41549	20 %	20 %	40 %	20 %	386863778
42	NC_017832	AGGCG	2	10	42728	42737	20 %	0 %	60 %	20 %	386863779
43	NC_017832	CGACG	2	10	43890	43899	20 %	0 %	40 %	40 %	386863780
44	NC_017832	CGCAC	2	10	44486	44495	20 %	0 %	20 %	60 %	386863781
45	NC_017832	CGACG	2	10	45138	45147	20 %	0 %	40 %	40 %	386863781
46	NC_017832	GCGCG	2	10	45473	45482	0 %	0 %	60 %	40 %	386863782
47	NC_017832	GCGCA	2	10	46573	46582	20 %	0 %	40 %	40 %	386863783
48	NC_017832	GCATC	2	10	46734	46743	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_017832	CGATC	2	10	48428	48437	20 %	20 %	20 %	40 %	386863785
50	NC_017832	CGGGC	2	10	49105	49114	0 %	0 %	60 %	40 %	386863786
51	NC_017832	GAGCG	2	10	50890	50899	20 %	0 %	60 %	20 %	386863788
52	NC_017832	ATCGT	2	10	52950	52959	20 %	40 %	20 %	20 %	386863790
53	NC_017832	GAGCC	2	10	54255	54264	20 %	0 %	40 %	40 %	386863791
54	NC_017832	GCCGC	2	10	54686	54695	0 %	0 %	40 %	60 %	386863791
55	NC_017832	GCGTC	2	10	56182	56191	0 %	20 %	40 %	40 %	386863793
56	NC_017832	CGGAC	2	10	56751	56760	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_017832	TGCGT	2	10	58192	58201	0 %	40 %	40 %	20 %	386863796
58	NC_017832	CGCGG	2	10	58800	58809	0 %	0 %	60 %	40 %	386863797
59	NC_017832	GGCGC	2	10	59433	59442	0 %	0 %	60 %	40 %	386863798
60	NC_017832	CGTCG	2	10	59445	59454	0 %	20 %	40 %	40 %	386863798
61	NC_017832	TCGAA	2	10	60023	60032	40 %	20 %	20 %	20 %	386863798
62	NC_017832	CCCGG	2	10	60652	60661	0 %	0 %	40 %	60 %	386863798
63	NC_017832	GCGCA	2	10	64396	64405	20 %	0 %	40 %	40 %	386863798
64	NC_017832	CGCGG	2	10	64448	64457	0 %	0 %	60 %	40 %	386863798
65	NC_017832	GGCTT	2	10	65859	65868	0 %	40 %	40 %	20 %	386863800
66	NC_017832	GCGCA	2	10	65975	65984	20 %	0 %	40 %	40 %	386863800
67	NC_017832	CGGCG	2	10	68807	68816	0 %	0 %	60 %	40 %	386863803
68	NC_017832	GGCGT	2	10	70189	70198	0 %	20 %	60 %	20 %	386863804
69	NC_017832	CGGGA	2	10	72016	72025	20 %	0 %	60 %	20 %	386863805
70	NC_017832	GATTC	2	10	72645	72654	20 %	40 %	20 %	20 %	386863805
71	NC_017832	TCGCG	2	10	72657	72666	0 %	20 %	40 %	40 %	386863805
72	NC_017832	GGCAT	2	10	72786	72795	20 %	20 %	40 %	20 %	386863805
73	NC_017832	TCCGC	2	10	73379	73388	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
74	NC_017832	CTTTG	2	10	73552	73561	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017832	CTTTT	2	10	73572	73581	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017832	GCCGA	2	10	74114	74123	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_017832	ACACG	2	10	74839	74848	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_017832	TCGAT	2	10	76982	76991	20 %	40 %	20 %	20 %	386863808
79	NC_017832	GCACG	2	10	77665	77674	20 %	0 %	40 %	40 %	386863809
80	NC_017832	CGGCT	2	10	77765	77774	0 %	20 %	40 %	40 %	386863809
81	NC_017832	CTTCC	2	10	78030	78039	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
82	NC_017832	TGCGC	2	10	79724	79733	0 %	20 %	40 %	40 %	386863810
83	NC_017832	CGATC	2	10	81591	81600	20 %	20 %	20 %	40 %	386863811
84	NC_017832	CGCGC	2	10	81909	81918	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
85	NC_017832	GGCGC	2	10	82176	82185	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
86	NC_017832	TACGC	2	10	88346	88355	20 %	20 %	20 %	40 %	386863816
87	NC_017832	GGGCA	2	10	90606	90615	20 %	0 %	60 %	20 %	386863816
88	NC_017832	GGCCG	2	10	92158	92167	0 %	0 %	60 %	40 %	386863817
89	NC_017832	GCTCG	2	10	92919	92928	0 %	20 %	40 %	40 %	386863817
90	NC_017832	GATCG	2	10	94256	94265	20 %	20 %	40 %	20 %	386863818
91	NC_017832	ACGGC	2	10	94976	94985	20 %	0 %	40 %	40 %	386863818
92	NC_017832	CTCGT	2	10	95284	95293	0 %	40 %	20 %	40 %	386863819
93	NC_017832	GTGCG	2	10	97774	97783	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
94	NC_017832	CGTCA	2	10	97848	97857	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_017832	GTCGG	2	10	97927	97936	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017832	ATCGC	2	10	97983	97992	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_017832	CGTGA	2	10	98381	98390	20 %	20 %	40 %	20 %	386863823
98	NC_017832	GCCGC	2	10	99316	99325	0 %	0 %	40 %	60 %	386863824
99	NC_017832	CGATG	2	10	100988	100997	20 %	20 %	40 %	20 %	386863825
100	NC_017832	CCGCG	2	10	101086	101095	0 %	0 %	40 %	60 %	386863825
101	NC_017832	GGGGA	2	10	101285	101294	20 %	0 %	80 %	0 %	386863825
102	NC_017832	GCCGT	2	10	103832	103841	0 %	20 %	40 %	40 %	386863827
103	NC_017832	CGAGG	2	10	104439	104448	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
104	NC_017832	GGGCC	2	10	104583	104592	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
105	NC_017832	CGGCG	2	10	107432	107441	0 %	0 %	60 %	40 %	386863829
106	NC_017832	CGCGC	2	10	108014	108023	0 %	0 %	40 %	60 %	386863829
107	NC_017832	AAAAG	2	10	108804	108813	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017832	CGCAG	2	10	110028	110037	20 %	0 %	40 %	40 %	386863831
109	NC_017832	TCGGC	2	10	111839	111848	0 %	20 %	40 %	40 %	386863833
110	NC_017832	TTGCG	2	10	114108	114117	0 %	40 %	40 %	20 %	386863833
111	NC_017832	GGCGC	2	10	114208	114217	0 %	0 %	60 %	40 %	386863834
112	NC_017832	TCGAG	2	10	114767	114776	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017832	CGAAC	2	10	115927	115936	40 %	0 %	20 %	40 %	386863837
114	NC_017832	CGGAG	2	10	116578	116587	20 %	0 %	60 %	20 %	386863837
115	NC_017832	GGCCG	2	10	121645	121654	0 %	0 %	60 %	40 %	386863842
116	NC_017832	GATCG	2	10	122436	122445	20 %	20 %	40 %	20 %	386863843
117	NC_017832	CGCTG	2	10	122992	123001	0 %	20 %	40 %	40 %	386863843
118	NC_017832	GCGGA	2	10	123004	123013	20 %	0 %	60 %	20 %	386863843
119	NC_017832	CGAGC	2	10	125788	125797	20 %	0 %	40 %	40 %	386863844
120	NC_017832	CGGCG	2	10	126436	126445	0 %	0 %	60 %	40 %	386863844
121	NC_017832	CTGCG	2	10	128730	128739	0 %	20 %	40 %	40 %	386863846
122	NC_017832	CGGCC	2	10	129180	129189	0 %	0 %	40 %	60 %	386863846
123	NC_017832	GCGAC	2	10	129904	129913	20 %	0 %	40 %	40 %	386863846
124	NC_017832	GCGCG	2	10	132213	132222	0 %	0 %	60 %	40 %	386863848
125	NC_017832	CTTGC	2	10	136996	137005	0 %	40 %	20 %	40 %	386863850
126	NC_017832	GCATC	2	10	137983	137992	20 %	20 %	20 %	40 %	386863851
127	NC_017832	AGCGC	2	10	138213	138222	20 %	0 %	40 %	40 %	386863851
128	NC_017832	GGGTG	2	10	138229	138238	0 %	20 %	80 %	0 %	386863851
129	NC_017832	GCGCG	2	10	138381	138390	0 %	0 %	60 %	40 %	386863852
130	NC_017832	GCGAT	2	10	139071	139080	20 %	20 %	40 %	20 %	386863852
131	NC_017832	AGCTG	2	10	139691	139700	20 %	20 %	40 %	20 %	386863853
132	NC_017832	TTCCG	2	10	139935	139944	0 %	40 %	20 %	40 %	386863853
133	NC_017832	TTCGC	2	10	143121	143130	0 %	40 %	20 %	40 %	386863857
134	NC_017832	CGGCA	2	10	146872	146881	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
135	NC_017832	GGGCC	2	10	147347	147356	0 %	0 %	60 %	40 %	386863859
136	NC_017832	GAATG	2	10	148284	148293	40 %	20 %	40 %	0 %	386863859
137	NC_017832	GCATT	2	10	148793	148802	20 %	40 %	20 %	20 %	386863859
138	NC_017832	AGCGC	2	10	149009	149018	20 %	0 %	40 %	40 %	386863859
139	NC_017832	CGTCG	2	10	149331	149340	0 %	20 %	40 %	40 %	386863859
140	NC_017832	GCCCG	2	10	150793	150802	0 %	0 %	40 %	60 %	386863861
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146	NC_017832	ATATT	2	10	156432	156441	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_017832	CGATT	2	10	176603	176612	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
166	NC_017832	TTGGA	2	10	177119	177128	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_017832	TGCGC	2	10	193763	193772	0 %	20 %	40 %	40 %	386863900
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187	NC_017832	GGCCG	2	10	196727	196736	0 %	0 %	60 %	40 %	386863902
188	NC_017832	GCGCC	2	10	196937	196946	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
189	NC_017832	GGCGA	2	10	198355	198364	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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223	NC_017832	CCGAG	2	10	218923	218932	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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251	NC_017832	GCCGA	2	10	240836	240845	20 %	0 %	40 %	40 %	386863933
252	NC_017832	CGAGC	2	10	241042	241051	20 %	0 %	40 %	40 %	386863933
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257	NC_017832	ACGCG	2	10	244987	244996	20 %	0 %	40 %	40 %	386863935
258	NC_017832	CCGGC	2	10	245048	245057	0 %	0 %	40 %	60 %	386863935
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261	NC_017832	GCGCG	2	10	245926	245935	0 %	0 %	60 %	40 %	386863935
262	NC_017832	GCGGT	2	10	246041	246050	0 %	20 %	60 %	20 %	386863935
263	NC_017832	GGCGC	2	10	247134	247143	0 %	0 %	60 %	40 %	386863936
264	NC_017832	CGAAG	2	10	247348	247357	40 %	0 %	40 %	20 %	386863937
265	NC_017832	GCACG	2	10	248933	248942	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
266	NC_017832	CGGCG	2	10	249116	249125	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
267	NC_017832	CGGCG	2	10	250017	250026	0 %	0 %	60 %	40 %	386863939
268	NC_017832	CGAAT	2	10	250422	250431	40 %	20 %	20 %	20 %	386863939
269	NC_017832	TTCGT	2	10	251030	251039	0 %	60 %	20 %	20 %	386863939
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271	NC_017832	GAGGC	2	10	253654	253663	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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399	NC_017832	CGAGC	2	10	354768	354777	20 %	0 %	40 %	40 %	386864022
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402	NC_017832	GCGGG	2	10	357614	357623	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
403	NC_017832	GAAGC	2	10	357673	357682	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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406	NC_017832	CGGCG	2	10	361694	361703	0 %	0 %	60 %	40 %	386864027
407	NC_017832	GCGTC	2	10	362125	362134	0 %	20 %	40 %	40 %	386864027
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435	NC_017832	GAATT	2	10	387743	387752	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_017832	GCGCG	2	10	401586	401595	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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