MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017819	TGA	2	6	18	23	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859011
2	NC_017819	ATT	2	6	41	46	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859011
3	NC_017819	TTA	2	6	54	59	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859011
4	NC_017819	ATT	2	6	120	125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017819	TCA	2	6	162	167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017819	CTA	2	6	328	333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017819	ACT	2	6	359	364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017819	TAT	2	6	400	405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017819	TAA	2	6	429	434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017819	AAT	2	6	471	476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859012
11	NC_017819	TAT	2	6	498	503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859012
12	NC_017819	TAT	2	6	513	518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859012
13	NC_017819	TAA	2	6	543	548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859012
14	NC_017819	TTA	2	6	556	561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859012
15	NC_017819	TAT	2	6	701	706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859012
16	NC_017819	CTG	2	6	842	847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859012
17	NC_017819	ATT	2	6	915	920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859012
18	NC_017819	TAA	2	6	1015	1020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859013
19	NC_017819	CTC	2	6	1189	1194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386859013
20	NC_017819	CTT	2	6	1203	1208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859013
21	NC_017819	ATA	2	6	1306	1311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859013
22	NC_017819	TTA	2	6	1313	1318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859013
23	NC_017819	ATT	2	6	1378	1383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859013
24	NC_017819	TAT	2	6	1404	1409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859013
25	NC_017819	TCC	2	6	1490	1495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_017819	GTT	2	6	1527	1532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017819	ATA	2	6	1540	1545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017819	TTA	2	6	1577	1582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859014
29	NC_017819	GAA	2	6	1619	1624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386859014
30	NC_017819	TCT	2	6	1658	1663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859014
31	NC_017819	ATA	2	6	1673	1678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859014
32	NC_017819	TTA	2	6	1701	1706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859014
33	NC_017819	TAT	3	9	1728	1736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859014
34	NC_017819	TAG	2	6	1746	1751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859014
35	NC_017819	TAA	2	6	1796	1801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859014
36	NC_017819	ACT	3	9	1858	1866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859014
37	NC_017819	TAA	2	6	1867	1872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859014
38	NC_017819	CAT	2	6	1989	1994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859014
39	NC_017819	ATT	2	6	2074	2079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859014

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.