MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017818	TTTCC	2	10	479	488	0 %	60 %	0 %	40 %	386860097
2	NC_017818	ACAAA	2	10	1644	1653	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017818	TCTTA	2	10	1703	1712	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017818	TTCTT	2	10	2492	2501	0 %	80 %	0 %	20 %	386860098
5	NC_017818	ACAAG	2	10	5198	5207	60 %	0 %	20 %	20 %	386860101
6	NC_017818	CAAAA	2	10	5513	5522	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017818	TCTTT	2	10	5694	5703	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017818	TACTC	2	10	5814	5823	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_017818	TCATA	2	10	6532	6541	40 %	40 %	0 %	20 %	386860102
10	NC_017818	TAAAA	2	10	6729	6738	80 %	20 %	0 %	0 %	386860102
11	NC_017818	TATAT	2	10	7610	7619	40 %	60 %	0 %	0 %	386860103
12	NC_017818	TTTGA	2	10	8472	8481	20 %	60 %	20 %	0 %	386860104
13	NC_017818	AAAAG	2	10	8685	8694	80 %	0 %	20 %	0 %	386860105
14	NC_017818	TTAAT	2	10	11617	11626	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017818	TATAT	2	10	11682	11691	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017818	TGAAG	2	10	14124	14133	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017818	GAAGG	2	10	15633	15642	40 %	0 %	60 %	0 %	386860111
18	NC_017818	TAAAT	2	10	15839	15848	60 %	40 %	0 %	0 %	386860111
19	NC_017818	AGATA	2	10	16544	16553	60 %	20 %	20 %	0 %	386860111
20	NC_017818	TCTTT	2	10	16695	16704	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017818	ATTGA	2	10	17488	17497	40 %	40 %	20 %	0 %	386860112
22	NC_017818	AATGA	2	10	19344	19353	60 %	20 %	20 %	0 %	386860114
23	NC_017818	GATAA	2	10	19422	19431	60 %	20 %	20 %	0 %	386860114
24	NC_017818	TAAAG	2	10	20153	20162	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017818	TATAA	2	10	20399	20408	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017818	ATTTT	2	10	20577	20586	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017818	GAGAG	2	10	21354	21363	40 %	0 %	60 %	0 %	386860115
28	NC_017818	GAGAG	2	10	23832	23841	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.