MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017818	AAAT	2	8	6	13	75 %	25 %	0 %	0 %	386860096
2	NC_017818	TTAA	2	8	304	311	50 %	50 %	0 %	0 %	386860097
3	NC_017818	TCCT	2	8	576	583	0 %	50 %	0 %	50 %	386860097
4	NC_017818	ACCT	2	8	636	643	25 %	25 %	0 %	50 %	386860097
5	NC_017818	CTTT	2	8	683	690	0 %	75 %	0 %	25 %	386860097
6	NC_017818	CTTA	2	8	840	847	25 %	50 %	0 %	25 %	386860097
7	NC_017818	CTCA	2	8	1062	1069	25 %	25 %	0 %	50 %	386860097
8	NC_017818	ATTT	2	8	1298	1305	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017818	TAAT	2	8	1374	1381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017818	TTAA	2	8	1448	1455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017818	TTTG	2	8	1537	1544	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017818	TTTA	2	8	1695	1702	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017818	CTTT	2	8	1908	1915	0 %	75 %	0 %	25 %	386860098
14	NC_017818	TTAC	2	8	2666	2673	25 %	50 %	0 %	25 %	386860098
15	NC_017818	ATTC	2	8	2905	2912	25 %	50 %	0 %	25 %	386860098
16	NC_017818	TTTC	2	8	2934	2941	0 %	75 %	0 %	25 %	386860098
17	NC_017818	ATTA	2	8	3358	3365	50 %	50 %	0 %	0 %	386860099
18	NC_017818	TCTT	2	8	3606	3613	0 %	75 %	0 %	25 %	386860099
19	NC_017818	AGCA	2	8	3809	3816	50 %	0 %	25 %	25 %	386860099
20	NC_017818	ATTT	2	8	4117	4124	25 %	75 %	0 %	0 %	386860100
21	NC_017818	ATCT	2	8	4245	4252	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017818	ATTA	2	8	4633	4640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017818	AATT	2	8	4726	4733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017818	ATCA	2	8	5043	5050	50 %	25 %	0 %	25 %	386860101
25	NC_017818	ATAA	2	8	5466	5473	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017818	TAAT	2	8	5677	5684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017818	ATTT	2	8	5973	5980	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017818	TAGA	3	12	5994	6005	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017818	TTTG	2	8	6047	6054	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017818	AATA	2	8	6156	6163	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017818	AATT	2	8	6215	6222	50 %	50 %	0 %	0 %	386860102
32	NC_017818	AATA	2	8	6481	6488	75 %	25 %	0 %	0 %	386860102
33	NC_017818	AGGA	2	8	6863	6870	50 %	0 %	50 %	0 %	386860102
34	NC_017818	TAAA	2	8	7130	7137	75 %	25 %	0 %	0 %	386860102
35	NC_017818	AATG	2	8	7383	7390	50 %	25 %	25 %	0 %	386860103
36	NC_017818	GATA	2	8	7916	7923	50 %	25 %	25 %	0 %	386860104
37	NC_017818	GATA	2	8	8183	8190	50 %	25 %	25 %	0 %	386860104
38	NC_017818	ATTT	2	8	8290	8297	25 %	75 %	0 %	0 %	386860104
39	NC_017818	TAAA	2	8	8443	8450	75 %	25 %	0 %	0 %	386860104
40	NC_017818	TACA	2	8	8490	8497	50 %	25 %	0 %	25 %	386860104
41	NC_017818	AAGA	2	8	9088	9095	75 %	0 %	25 %	0 %	386860105
42	NC_017818	ATTA	2	8	9143	9150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017818	ATTT	2	8	9593	9600	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017818	ATTT	2	8	9968	9975	25 %	75 %	0 %	0 %	386860106
45	NC_017818	GAAG	2	8	10096	10103	50 %	0 %	50 %	0 %	386860106
46	NC_017818	ATTT	2	8	10549	10556	25 %	75 %	0 %	0 %	386860106
47	NC_017818	ATGT	2	8	11024	11031	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017818	AGTT	2	8	11260	11267	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017818	AAAT	2	8	11460	11467	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017818	AAAT	2	8	11882	11889	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017818	AAAT	2	8	12553	12560	75 %	25 %	0 %	0 %	386860107
52	NC_017818	TAAT	2	8	12781	12788	50 %	50 %	0 %	0 %	386860107
53	NC_017818	TAAG	2	8	13540	13547	50 %	25 %	25 %	0 %	386860108
54	NC_017818	AGAT	2	8	13569	13576	50 %	25 %	25 %	0 %	386860108
55	NC_017818	AATC	2	8	13954	13961	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017818	CATT	2	8	14000	14007	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017818	GTTT	2	8	14022	14029	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017818	CTTT	2	8	14038	14045	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017818	CTTT	2	8	14770	14777	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017818	AAAT	2	8	15299	15306	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017818	GATA	2	8	16262	16269	50 %	25 %	25 %	0 %	386860111
62	NC_017818	ACAA	2	8	16485	16492	75 %	0 %	0 %	25 %	386860111
63	NC_017818	AGTA	2	8	16529	16536	50 %	25 %	25 %	0 %	386860111
64	NC_017818	TAAA	2	8	16637	16644	75 %	25 %	0 %	0 %	386860111
65	NC_017818	TTTG	2	8	16725	16732	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017818	AATA	2	8	16863	16870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017818	AAGT	2	8	16936	16943	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017818	GAAG	2	8	17110	17117	50 %	0 %	50 %	0 %	386860112
69	NC_017818	TGAG	2	8	17120	17127	25 %	25 %	50 %	0 %	386860112
70	NC_017818	GTAG	2	8	17587	17594	25 %	25 %	50 %	0 %	386860112
71	NC_017818	AGGA	2	8	17606	17613	50 %	0 %	50 %	0 %	386860112
72	NC_017818	AAAT	2	8	17952	17959	75 %	25 %	0 %	0 %	386860112
73	NC_017818	AGAT	2	8	18069	18076	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017818	AAGG	2	8	18102	18109	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017818	CATT	2	8	18462	18469	25 %	50 %	0 %	25 %	386860113
76	NC_017818	ACAA	2	8	18519	18526	75 %	0 %	0 %	25 %	386860113
77	NC_017818	ATTT	2	8	18606	18613	25 %	75 %	0 %	0 %	386860113
78	NC_017818	TAAT	2	8	18835	18842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017818	AATT	2	8	19480	19487	50 %	50 %	0 %	0 %	386860114
80	NC_017818	GAAG	2	8	20030	20037	50 %	0 %	50 %	0 %	386860114
81	NC_017818	CATT	2	8	20556	20563	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017818	AAAG	2	8	21153	21160	75 %	0 %	25 %	0 %	386860115
83	NC_017818	GTTA	2	8	21537	21544	25 %	50 %	25 %	0 %	386860115
84	NC_017818	TTAG	2	8	21756	21763	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017818	ATTT	2	8	21835	21842	25 %	75 %	0 %	0 %	386860116
86	NC_017818	TGAG	2	8	22047	22054	25 %	25 %	50 %	0 %	386860116
87	NC_017818	AAAG	2	8	22658	22665	75 %	0 %	25 %	0 %	386860116
88	NC_017818	CGTT	2	8	22799	22806	0 %	50 %	25 %	25 %	386860116
89	NC_017818	AGGT	2	8	23441	23448	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017818	AGTG	2	8	24781	24788	25 %	25 %	50 %	0 %	386860117
91	NC_017818	ATTA	2	8	24808	24815	50 %	50 %	0 %	0 %	386860117
92	NC_017818	TAGA	2	8	25046	25053	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017818	ATTT	2	8	25124	25131	25 %	75 %	0 %	0 %	386860118

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.