MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017818	ATTT	2	8	1298	1305	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017818	TAAT	2	8	1374	1381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017818	TTAA	2	8	1448	1455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017818	TTTG	2	8	1537	1544	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017818	TTTA	2	8	1695	1702	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017818	ATCT	2	8	4245	4252	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017818	ATTA	2	8	4633	4640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017818	AATT	2	8	4726	4733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017818	ATAA	2	8	5466	5473	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017818	TAAT	2	8	5677	5684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017818	ATTT	2	8	5973	5980	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017818	TAGA	3	12	5994	6005	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017818	TTTG	2	8	6047	6054	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017818	AATA	2	8	6156	6163	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017818	ATTA	2	8	9143	9150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017818	ATTT	2	8	9593	9600	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017818	ATGT	2	8	11024	11031	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017818	AGTT	2	8	11260	11267	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017818	AAAT	2	8	11460	11467	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017818	AAAT	2	8	11882	11889	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017818	AATC	2	8	13954	13961	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017818	CATT	2	8	14000	14007	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017818	GTTT	2	8	14022	14029	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017818	CTTT	2	8	14038	14045	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017818	CTTT	2	8	14770	14777	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017818	AAAT	2	8	15299	15306	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017818	TTTG	2	8	16725	16732	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017818	AATA	2	8	16863	16870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017818	AAGT	2	8	16936	16943	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017818	AGAT	2	8	18069	18076	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017818	AAGG	2	8	18102	18109	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017818	TAAT	2	8	18835	18842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017818	CATT	2	8	20556	20563	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017818	TTAG	2	8	21756	21763	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017818	AGGT	2	8	23441	23448	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017818	TAGA	2	8	25046	25053	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.