MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017818	AAAT	2	8	6	13	75 %	25 %	0 %	0 %	386860096
2	NC_017818	TTAA	2	8	304	311	50 %	50 %	0 %	0 %	386860097
3	NC_017818	TCCT	2	8	576	583	0 %	50 %	0 %	50 %	386860097
4	NC_017818	ACCT	2	8	636	643	25 %	25 %	0 %	50 %	386860097
5	NC_017818	CTTT	2	8	683	690	0 %	75 %	0 %	25 %	386860097
6	NC_017818	CTTA	2	8	840	847	25 %	50 %	0 %	25 %	386860097
7	NC_017818	CTCA	2	8	1062	1069	25 %	25 %	0 %	50 %	386860097
8	NC_017818	CTTT	2	8	1908	1915	0 %	75 %	0 %	25 %	386860098
9	NC_017818	TTAC	2	8	2666	2673	25 %	50 %	0 %	25 %	386860098
10	NC_017818	ATTC	2	8	2905	2912	25 %	50 %	0 %	25 %	386860098
11	NC_017818	TTTC	2	8	2934	2941	0 %	75 %	0 %	25 %	386860098
12	NC_017818	ATTA	2	8	3358	3365	50 %	50 %	0 %	0 %	386860099
13	NC_017818	TCTT	2	8	3606	3613	0 %	75 %	0 %	25 %	386860099
14	NC_017818	AGCA	2	8	3809	3816	50 %	0 %	25 %	25 %	386860099
15	NC_017818	ATTT	2	8	4117	4124	25 %	75 %	0 %	0 %	386860100
16	NC_017818	ATCA	2	8	5043	5050	50 %	25 %	0 %	25 %	386860101
17	NC_017818	AATT	2	8	6215	6222	50 %	50 %	0 %	0 %	386860102
18	NC_017818	AATA	2	8	6481	6488	75 %	25 %	0 %	0 %	386860102
19	NC_017818	AGGA	2	8	6863	6870	50 %	0 %	50 %	0 %	386860102
20	NC_017818	TAAA	2	8	7130	7137	75 %	25 %	0 %	0 %	386860102
21	NC_017818	AATG	2	8	7383	7390	50 %	25 %	25 %	0 %	386860103
22	NC_017818	GATA	2	8	7916	7923	50 %	25 %	25 %	0 %	386860104
23	NC_017818	GATA	2	8	8183	8190	50 %	25 %	25 %	0 %	386860104
24	NC_017818	ATTT	2	8	8290	8297	25 %	75 %	0 %	0 %	386860104
25	NC_017818	TAAA	2	8	8443	8450	75 %	25 %	0 %	0 %	386860104
26	NC_017818	TACA	2	8	8490	8497	50 %	25 %	0 %	25 %	386860104
27	NC_017818	AAGA	2	8	9088	9095	75 %	0 %	25 %	0 %	386860105
28	NC_017818	ATTT	2	8	9968	9975	25 %	75 %	0 %	0 %	386860106
29	NC_017818	GAAG	2	8	10096	10103	50 %	0 %	50 %	0 %	386860106
30	NC_017818	ATTT	2	8	10549	10556	25 %	75 %	0 %	0 %	386860106
31	NC_017818	AAAT	2	8	12553	12560	75 %	25 %	0 %	0 %	386860107
32	NC_017818	TAAT	2	8	12781	12788	50 %	50 %	0 %	0 %	386860107
33	NC_017818	TAAG	2	8	13540	13547	50 %	25 %	25 %	0 %	386860108
34	NC_017818	AGAT	2	8	13569	13576	50 %	25 %	25 %	0 %	386860108
35	NC_017818	GATA	2	8	16262	16269	50 %	25 %	25 %	0 %	386860111
36	NC_017818	ACAA	2	8	16485	16492	75 %	0 %	0 %	25 %	386860111
37	NC_017818	AGTA	2	8	16529	16536	50 %	25 %	25 %	0 %	386860111
38	NC_017818	TAAA	2	8	16637	16644	75 %	25 %	0 %	0 %	386860111
39	NC_017818	GAAG	2	8	17110	17117	50 %	0 %	50 %	0 %	386860112
40	NC_017818	TGAG	2	8	17120	17127	25 %	25 %	50 %	0 %	386860112
41	NC_017818	GTAG	2	8	17587	17594	25 %	25 %	50 %	0 %	386860112
42	NC_017818	AGGA	2	8	17606	17613	50 %	0 %	50 %	0 %	386860112
43	NC_017818	AAAT	2	8	17952	17959	75 %	25 %	0 %	0 %	386860112
44	NC_017818	CATT	2	8	18462	18469	25 %	50 %	0 %	25 %	386860113
45	NC_017818	ACAA	2	8	18519	18526	75 %	0 %	0 %	25 %	386860113
46	NC_017818	ATTT	2	8	18606	18613	25 %	75 %	0 %	0 %	386860113
47	NC_017818	AATT	2	8	19480	19487	50 %	50 %	0 %	0 %	386860114
48	NC_017818	GAAG	2	8	20030	20037	50 %	0 %	50 %	0 %	386860114
49	NC_017818	AAAG	2	8	21153	21160	75 %	0 %	25 %	0 %	386860115
50	NC_017818	GTTA	2	8	21537	21544	25 %	50 %	25 %	0 %	386860115
51	NC_017818	ATTT	2	8	21835	21842	25 %	75 %	0 %	0 %	386860116
52	NC_017818	TGAG	2	8	22047	22054	25 %	25 %	50 %	0 %	386860116
53	NC_017818	AAAG	2	8	22658	22665	75 %	0 %	25 %	0 %	386860116
54	NC_017818	CGTT	2	8	22799	22806	0 %	50 %	25 %	25 %	386860116
55	NC_017818	AGTG	2	8	24781	24788	25 %	25 %	50 %	0 %	386860117
56	NC_017818	ATTA	2	8	24808	24815	50 %	50 %	0 %	0 %	386860117
57	NC_017818	ATTT	2	8	25124	25131	25 %	75 %	0 %	0 %	386860118

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.