MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 445

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017818	TAA	2	6	73	78	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860096
2	NC_017818	ATT	2	6	91	96	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860096
3	NC_017818	CAA	2	6	98	103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017818	CTA	2	6	117	122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386860097
5	NC_017818	CTG	2	6	128	133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386860097
6	NC_017818	CTT	2	6	158	163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860097
7	NC_017818	TCT	2	6	208	213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860097
8	NC_017818	TAA	2	6	222	227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860097
9	NC_017818	TTG	2	6	233	238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386860097
10	NC_017818	TGC	2	6	258	263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386860097
11	NC_017818	CTG	2	6	329	334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386860097
12	NC_017818	TGC	3	9	339	347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386860097
13	NC_017818	GTT	2	6	409	414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386860097
14	NC_017818	CTT	2	6	449	454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860097
15	NC_017818	TGC	3	9	507	515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386860097
16	NC_017818	ATC	2	6	525	530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386860097
17	NC_017818	TGA	2	6	534	539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386860097
18	NC_017818	ATA	2	6	563	568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860097
19	NC_017818	TAT	2	6	584	589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860097
20	NC_017818	ATT	2	6	597	602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860097
21	NC_017818	TGT	2	6	606	611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386860097
22	NC_017818	CTT	2	6	650	655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860097
23	NC_017818	CTA	2	6	656	661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386860097
24	NC_017818	CAT	2	6	698	703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386860097
25	NC_017818	AGT	2	6	804	809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386860097
26	NC_017818	AAC	2	6	822	827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386860097
27	NC_017818	TTC	2	6	958	963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860097
28	NC_017818	TCC	2	6	1074	1079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386860097
29	NC_017818	CCT	3	9	1087	1095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386860097
30	NC_017818	GCT	2	6	1096	1101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386860097
31	NC_017818	TCC	2	6	1107	1112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386860097
32	NC_017818	CAT	2	6	1143	1148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386860097
33	NC_017818	CAC	2	6	1149	1154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386860097
34	NC_017818	CAT	3	9	1155	1163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386860097
35	NC_017818	TAC	2	6	1176	1181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386860097
36	NC_017818	CTT	2	6	1233	1238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017818	CCT	2	6	1263	1268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017818	TAA	2	6	1322	1327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017818	TTA	2	6	1471	1476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017818	ACA	2	6	1556	1561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017818	ATT	2	6	1734	1739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860098
42	NC_017818	ACC	2	6	1747	1752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386860098
43	NC_017818	TAG	2	6	1788	1793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386860098
44	NC_017818	CTT	2	6	1806	1811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860098
45	NC_017818	TGC	2	6	1891	1896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386860098
46	NC_017818	CAT	2	6	1917	1922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386860098
47	NC_017818	ACC	2	6	1948	1953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386860098
48	NC_017818	AGT	2	6	2014	2019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386860098
49	NC_017818	TAG	2	6	2037	2042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386860098
50	NC_017818	AGC	2	6	2050	2055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386860098
51	NC_017818	AGC	2	6	2119	2124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386860098
52	NC_017818	CTG	3	9	2127	2135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386860098
53	NC_017818	CTT	2	6	2137	2142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860098
54	NC_017818	CAT	2	6	2205	2210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386860098
55	NC_017818	TAT	2	6	2425	2430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860098
56	NC_017818	TTA	2	6	2522	2527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860098
57	NC_017818	TTC	2	6	2699	2704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860098
58	NC_017818	CAT	2	6	2749	2754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386860098
59	NC_017818	CAC	2	6	2755	2760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386860098
60	NC_017818	CAT	2	6	2761	2766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386860098
61	NC_017818	TTC	2	6	2778	2783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860098
62	NC_017818	TTC	2	6	2824	2829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860098
63	NC_017818	CCT	2	6	2943	2948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017818	TAA	2	6	2973	2978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017818	TAA	2	6	3319	3324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017818	TTA	2	6	3325	3330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017818	TAA	2	6	3410	3415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860099
68	NC_017818	TTA	2	6	3417	3422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860099
69	NC_017818	CTT	2	6	3559	3564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860099
70	NC_017818	CCT	2	6	3588	3593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386860099
71	NC_017818	TGC	3	9	3770	3778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386860099
72	NC_017818	TTG	2	6	3782	3787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386860099
73	NC_017818	CAT	2	6	3796	3801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386860099
74	NC_017818	TAG	2	6	3853	3858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386860099
75	NC_017818	CTT	2	6	3878	3883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860099
76	NC_017818	AGC	2	6	3983	3988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386860100
77	NC_017818	TAA	2	6	4051	4056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860100
78	NC_017818	TCA	2	6	4059	4064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386860100
79	NC_017818	CTT	2	6	4178	4183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860100
80	NC_017818	TCT	2	6	4310	4315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017818	ATT	2	6	4318	4323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017818	ATC	2	6	4338	4343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017818	TCA	2	6	4359	4364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017818	ACT	2	6	4472	4477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017818	ATA	2	6	4501	4506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017818	TAA	2	6	4523	4528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017818	TGA	2	6	4542	4547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017818	TAA	2	6	4641	4646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017818	ATA	2	6	4668	4673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017818	ATC	2	6	4677	4682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017818	CTT	2	6	4707	4712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017818	GAG	2	6	4863	4868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017818	TAA	3	9	4948	4956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860101
94	NC_017818	ATG	2	6	5001	5006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386860101
95	NC_017818	AAC	2	6	5007	5012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386860101
96	NC_017818	TTA	2	6	5024	5029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860101
97	NC_017818	CAA	2	6	5214	5219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386860101
98	NC_017818	AAC	2	6	5232	5237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386860101
99	NC_017818	AAT	2	6	5243	5248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860101
100	NC_017818	TCA	2	6	5260	5265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386860101
101	NC_017818	AAT	2	6	5282	5287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860101
102	NC_017818	AAT	2	6	5324	5329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860101
103	NC_017818	ATA	3	9	5349	5357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860101
104	NC_017818	AGA	2	6	5386	5391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386860101
105	NC_017818	ATT	2	6	5446	5451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017818	TAA	2	6	5588	5593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017818	ATA	2	6	5733	5738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017818	ATC	2	6	5829	5834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017818	TTG	2	6	5841	5846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017818	TAA	2	6	6115	6120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017818	TTA	3	9	6129	6137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017818	ATT	2	6	6140	6145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017818	AAT	2	6	6146	6151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017818	TAA	2	6	6297	6302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860102
115	NC_017818	CAA	2	6	6319	6324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386860102
116	NC_017818	ACT	2	6	6395	6400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386860102
117	NC_017818	CAT	2	6	6451	6456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386860102
118	NC_017818	TAA	3	9	6552	6560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860102
119	NC_017818	TAA	3	9	6597	6605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860102
120	NC_017818	GAA	2	6	6606	6611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386860102
121	NC_017818	AGA	3	9	6615	6623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386860102
122	NC_017818	GAT	2	6	6682	6687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386860102
123	NC_017818	CAA	2	6	6716	6721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386860102
124	NC_017818	GAA	2	6	6753	6758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386860102
125	NC_017818	AGA	2	6	6759	6764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386860102
126	NC_017818	TAG	2	6	6803	6808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386860102
127	NC_017818	AAC	2	6	6837	6842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386860102
128	NC_017818	TAT	2	6	6939	6944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860102
129	NC_017818	CAG	2	6	7036	7041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386860102
130	NC_017818	ATA	2	6	7049	7054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860102
131	NC_017818	ATT	2	6	7124	7129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860102
132	NC_017818	TAA	2	6	7167	7172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860102
133	NC_017818	ATT	2	6	7175	7180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860102
134	NC_017818	AAT	2	6	7197	7202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860102
135	NC_017818	TTG	2	6	7244	7249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386860102
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261	NC_017818	TAA	2	6	15351	15356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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263	NC_017818	GGT	2	6	15523	15528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.