MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017818	TA	3	6	21	26	50 %	50 %	0 %	0 %	386860096
2	NC_017818	CT	3	6	141	146	0 %	50 %	0 %	50 %	386860097
3	NC_017818	CT	5	10	1208	1217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017818	TC	3	6	1244	1249	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017818	TA	3	6	1687	1692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017818	AT	3	6	2085	2090	50 %	50 %	0 %	0 %	386860098
7	NC_017818	CT	3	6	2797	2802	0 %	50 %	0 %	50 %	386860098
8	NC_017818	TC	3	6	2803	2808	0 %	50 %	0 %	50 %	386860098
9	NC_017818	CT	3	6	2809	2814	0 %	50 %	0 %	50 %	386860098
10	NC_017818	TA	3	6	3000	3005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017818	CT	3	6	3298	3303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017818	TA	4	8	3339	3346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017818	AT	3	6	3733	3738	50 %	50 %	0 %	0 %	386860099
14	NC_017818	TC	3	6	3841	3846	0 %	50 %	0 %	50 %	386860099
15	NC_017818	AT	3	6	4826	4831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017818	AC	3	6	4941	4946	50 %	0 %	0 %	50 %	386860101
17	NC_017818	CA	4	8	5058	5065	50 %	0 %	0 %	50 %	386860101
18	NC_017818	TA	3	6	5478	5483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017818	TC	3	6	5607	5612	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017818	TA	4	8	6585	6592	50 %	50 %	0 %	0 %	386860102
21	NC_017818	TC	3	6	6693	6698	0 %	50 %	0 %	50 %	386860102
22	NC_017818	AG	3	6	6945	6950	50 %	0 %	50 %	0 %	386860102
23	NC_017818	TA	3	6	8175	8180	50 %	50 %	0 %	0 %	386860104
24	NC_017818	AT	3	6	8320	8325	50 %	50 %	0 %	0 %	386860104
25	NC_017818	AC	3	6	8368	8373	50 %	0 %	0 %	50 %	386860104
26	NC_017818	AT	3	6	8531	8536	50 %	50 %	0 %	0 %	386860104
27	NC_017818	AG	3	6	9018	9023	50 %	0 %	50 %	0 %	386860105
28	NC_017818	TG	3	6	9445	9450	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017818	TA	3	6	9629	9634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017818	AG	3	6	9776	9781	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017818	TA	3	6	10141	10146	50 %	50 %	0 %	0 %	386860106
32	NC_017818	TA	3	6	10471	10476	50 %	50 %	0 %	0 %	386860106
33	NC_017818	AT	3	6	10822	10827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017818	TA	4	8	10846	10853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017818	AT	3	6	10855	10860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017818	AC	3	6	11473	11478	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017818	AT	4	8	11723	11730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017818	AT	3	6	11832	11837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017818	AG	4	8	11926	11933	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017818	TA	4	8	12473	12480	50 %	50 %	0 %	0 %	386860107
41	NC_017818	TA	3	6	12612	12617	50 %	50 %	0 %	0 %	386860107
42	NC_017818	TA	3	6	12956	12961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017818	AT	3	6	13000	13005	50 %	50 %	0 %	0 %	386860108
44	NC_017818	AT	3	6	13023	13028	50 %	50 %	0 %	0 %	386860108
45	NC_017818	TG	3	6	13726	13731	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017818	AT	3	6	13828	13833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017818	TG	3	6	14880	14885	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017818	TA	3	6	14995	15000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017818	GA	3	6	15424	15429	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017818	AG	3	6	15538	15543	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017818	GA	3	6	16709	16714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017818	TG	3	6	16757	16762	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017818	TA	3	6	16769	16774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017818	AT	4	8	16777	16784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017818	AG	3	6	18040	18045	50 %	0 %	50 %	0 %	386860112
56	NC_017818	AC	3	6	18271	18276	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017818	AG	3	6	18543	18548	50 %	0 %	50 %	0 %	386860113
58	NC_017818	GA	3	6	18798	18803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017818	CT	3	6	18914	18919	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017818	AT	3	6	20384	20389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017818	TA	3	6	20524	20529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017818	AG	3	6	20623	20628	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017818	GT	3	6	21476	21481	0 %	50 %	50 %	0 %	386860115
64	NC_017818	AG	3	6	21703	21708	50 %	0 %	50 %	0 %	386860115
65	NC_017818	AG	3	6	21776	21781	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017818	CT	3	6	21790	21795	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017818	TA	3	6	21822	21827	50 %	50 %	0 %	0 %	386860116
68	NC_017818	CT	3	6	25079	25084	0 %	50 %	0 %	50 %	386860118

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.