MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017817	CATCAC	2	12	469	480	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386858973
2	NC_017817	CACTTG	2	12	1218	1229	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386858974
3	NC_017817	ATTTTC	2	12	1849	1860	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386858975
4	NC_017817	TCACCA	2	12	2564	2575	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386858977
5	NC_017817	CAGAAA	2	12	3980	3991	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386858979
6	NC_017817	CCAGTA	2	12	5510	5521	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386858981
7	NC_017817	TAACTT	2	12	5766	5777	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386858981
8	NC_017817	AGCAAT	2	12	8184	8195	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386858983
9	NC_017817	TAGCAT	2	12	9473	9484	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386858984
10	NC_017817	GTTTTA	2	12	9496	9507	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386858984
11	NC_017817	ACCAGC	3	18	9573	9590	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386858984
12	NC_017817	ATACTG	2	12	9784	9795	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386858984
13	NC_017817	TAGCAA	2	12	10787	10798	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386858985
14	NC_017817	CACTTG	2	12	12261	12272	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017817	CATTAG	2	12	13230	13241	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386858987
16	NC_017817	TCATTA	2	12	13262	13273	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386858987
17	NC_017817	AATAAA	2	12	16443	16454	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386858989
18	NC_017817	TATTAA	2	12	17340	17351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017817	AAAATT	2	12	19097	19108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017817	TATCTA	2	12	21851	21862	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386858994
21	NC_017817	TTTTTC	2	12	22460	22471	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386858995
22	NC_017817	AGCTTG	2	12	27329	27340	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017817	AAACCA	2	12	30885	30896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386859005
24	NC_017817	ATGTTG	2	12	34856	34867	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386859008

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.