MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017817	TCTCC	2	10	1083	1092	0 %	40 %	0 %	60 %	386858974
2	NC_017817	TTATT	2	10	2075	2084	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017817	TTCTT	2	10	3109	3118	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017817	TTCAT	2	10	3121	3130	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017817	TTTCT	2	10	4098	4107	0 %	80 %	0 %	20 %	386858979
6	NC_017817	AAATC	2	10	4735	4744	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017817	CACTT	2	10	6052	6061	20 %	40 %	0 %	40 %	386858981
8	NC_017817	TATCT	2	10	8574	8583	20 %	60 %	0 %	20 %	386858983
9	NC_017817	TCTCC	2	10	12126	12135	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
10	NC_017817	TCTTA	2	10	13021	13030	20 %	60 %	0 %	20 %	386858987
11	NC_017817	TACTC	2	10	16258	16267	20 %	40 %	0 %	40 %	386858988
12	NC_017817	TAAAA	2	10	16395	16404	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017817	AAATA	2	10	17401	17410	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017817	TCAAA	2	10	17479	17488	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017817	AATTA	2	10	19302	19311	60 %	40 %	0 %	0 %	386858991
16	NC_017817	ATTTT	2	10	19335	19344	20 %	80 %	0 %	0 %	386858991
17	NC_017817	TAAAA	2	10	20404	20413	80 %	20 %	0 %	0 %	386858992
18	NC_017817	TAAAA	2	10	20415	20424	80 %	20 %	0 %	0 %	386858992
19	NC_017817	AATTG	2	10	21735	21744	40 %	40 %	20 %	0 %	386858994
20	NC_017817	TATTT	2	10	23766	23775	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017817	TAAAA	2	10	26649	26658	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017817	ATGTT	2	10	26714	26723	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017817	ATTTT	2	10	27666	27675	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017817	ATTTT	2	10	28394	28403	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017817	TTTTA	2	10	28751	28760	20 %	80 %	0 %	0 %	386859002
26	NC_017817	TTTTA	2	10	29918	29927	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017817	GTTAA	2	10	29977	29986	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017817	TAAAG	2	10	30026	30035	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017817	TTAAA	2	10	30774	30783	60 %	40 %	0 %	0 %	386859004
30	NC_017817	GAGAG	2	10	33944	33953	40 %	0 %	60 %	0 %	386859008
31	NC_017817	AGATA	2	10	35071	35080	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017817	AAAAG	2	10	35466	35475	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017817	GAGAG	2	10	35548	35557	40 %	0 %	60 %	0 %	386859009
34	NC_017817	AGGTA	2	10	35867	35876	40 %	20 %	40 %	0 %	386859009

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.