MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017817	AATT	2	8	139	146	50 %	50 %	0 %	0 %	386858973
2	NC_017817	ATTC	2	8	381	388	25 %	50 %	0 %	25 %	386858973
3	NC_017817	ATAA	2	8	702	709	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017817	CACT	2	8	936	943	25 %	25 %	0 %	50 %	386858974
5	NC_017817	TTTA	2	8	1573	1580	25 %	75 %	0 %	0 %	386858974
6	NC_017817	TTCC	2	8	1703	1710	0 %	50 %	0 %	50 %	386858975
7	NC_017817	CAAA	3	12	1898	1909	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017817	AAAT	2	8	1910	1917	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017817	GAAT	2	8	1930	1937	50 %	25 %	25 %	0 %	386858976
10	NC_017817	CTTT	2	8	2499	2506	0 %	75 %	0 %	25 %	386858977
11	NC_017817	TTAC	2	8	3283	3290	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017817	TCCT	2	8	3321	3328	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017817	CTTT	2	8	3467	3474	0 %	75 %	0 %	25 %	386858978
14	NC_017817	AAAT	2	8	3513	3520	75 %	25 %	0 %	0 %	386858978
15	NC_017817	TTAT	2	8	3688	3695	25 %	75 %	0 %	0 %	386858979
16	NC_017817	ATTT	2	8	4388	4395	25 %	75 %	0 %	0 %	386858979
17	NC_017817	CAAA	2	8	4724	4731	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017817	ACTT	2	8	5008	5015	25 %	50 %	0 %	25 %	386858980
19	NC_017817	TAAT	2	8	5020	5027	50 %	50 %	0 %	0 %	386858980
20	NC_017817	TATT	2	8	5205	5212	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017817	TTTA	2	8	5214	5221	25 %	75 %	0 %	0 %	386858981
22	NC_017817	ATCA	2	8	5593	5600	50 %	25 %	0 %	25 %	386858981
23	NC_017817	AGCA	2	8	5674	5681	50 %	0 %	25 %	25 %	386858981
24	NC_017817	AATT	2	8	5899	5906	50 %	50 %	0 %	0 %	386858981
25	NC_017817	ATTA	2	8	6569	6576	50 %	50 %	0 %	0 %	386858982
26	NC_017817	TTAT	2	8	6622	6629	25 %	75 %	0 %	0 %	386858982
27	NC_017817	CCTT	2	8	6763	6770	0 %	50 %	0 %	50 %	386858982
28	NC_017817	TCTT	2	8	6811	6818	0 %	75 %	0 %	25 %	386858982
29	NC_017817	TTTC	2	8	6836	6843	0 %	75 %	0 %	25 %	386858982
30	NC_017817	CTTA	2	8	7260	7267	25 %	50 %	0 %	25 %	386858982
31	NC_017817	TTTC	2	8	7667	7674	0 %	75 %	0 %	25 %	386858982
32	NC_017817	CAAA	2	8	7720	7727	75 %	0 %	0 %	25 %	386858982
33	NC_017817	ACTT	2	8	7885	7892	25 %	50 %	0 %	25 %	386858983
34	NC_017817	CAAT	2	8	9034	9041	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017817	ATTT	2	8	9139	9146	25 %	75 %	0 %	0 %	386858984
36	NC_017817	ATCA	2	8	9522	9529	50 %	25 %	0 %	25 %	386858984
37	NC_017817	TATT	2	8	10307	10314	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017817	CTGC	2	8	11246	11253	0 %	25 %	25 %	50 %	386858985
39	NC_017817	CTTC	2	8	12273	12280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017817	TACT	2	8	12348	12355	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017817	CTTG	2	8	12531	12538	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017817	TTCC	2	8	12756	12763	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017817	ATTT	2	8	12829	12836	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017817	ATTT	2	8	12947	12954	25 %	75 %	0 %	0 %	386858987
45	NC_017817	ATCA	2	8	13318	13325	50 %	25 %	0 %	25 %	386858987
46	NC_017817	AATA	2	8	15673	15680	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017817	AATT	2	8	16316	16323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017817	TTAA	2	8	16417	16424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017817	TAAT	2	8	16801	16808	50 %	50 %	0 %	0 %	386858989
50	NC_017817	CATT	2	8	17121	17128	25 %	50 %	0 %	25 %	386858989
51	NC_017817	TTAT	2	8	19133	19140	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017817	TTGC	2	8	19608	19615	0 %	50 %	25 %	25 %	386858991
53	NC_017817	TTAA	2	8	20298	20305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017817	TTAA	2	8	20324	20331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017817	TCTT	2	8	20654	20661	0 %	75 %	0 %	25 %	386858993
56	NC_017817	TTTC	2	8	21057	21064	0 %	75 %	0 %	25 %	386858993
57	NC_017817	AATG	2	8	21184	21191	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017817	AATA	2	8	21391	21398	75 %	25 %	0 %	0 %	386858994
59	NC_017817	ATTA	2	8	21429	21436	50 %	50 %	0 %	0 %	386858994
60	NC_017817	CAAA	2	8	22288	22295	75 %	0 %	0 %	25 %	386858995
61	NC_017817	TCTT	2	8	22487	22494	0 %	75 %	0 %	25 %	386858995
62	NC_017817	TGTT	2	8	23502	23509	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017817	TTAT	2	8	26547	26554	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017817	AATA	2	8	26924	26931	75 %	25 %	0 %	0 %	386859000
65	NC_017817	TTTA	2	8	27008	27015	25 %	75 %	0 %	0 %	386859000
66	NC_017817	ATTT	2	8	27037	27044	25 %	75 %	0 %	0 %	386859000
67	NC_017817	TTCA	2	8	27380	27387	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017817	TTAA	2	8	27476	27483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017817	AATA	2	8	27598	27605	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017817	AATA	2	8	28326	28333	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017817	CTTT	2	8	28551	28558	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017817	ATTA	2	8	28594	28601	50 %	50 %	0 %	0 %	386859001
73	NC_017817	TTTA	2	8	29130	29137	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017817	ATTT	2	8	29151	29158	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017817	ATAA	2	8	29392	29399	75 %	25 %	0 %	0 %	386859003
76	NC_017817	CTTA	2	8	29498	29505	25 %	50 %	0 %	25 %	386859003
77	NC_017817	ATGT	2	8	30124	30131	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017817	TAAA	2	8	30934	30941	75 %	25 %	0 %	0 %	386859005
79	NC_017817	TTAT	2	8	31036	31043	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017817	AATT	2	8	31216	31223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017817	AGAT	2	8	32950	32957	50 %	25 %	25 %	0 %	386859006
82	NC_017817	AGAT	2	8	33136	33143	50 %	25 %	25 %	0 %	386859006
83	NC_017817	AGAT	2	8	33190	33197	50 %	25 %	25 %	0 %	386859006
84	NC_017817	AGAT	2	8	33223	33230	50 %	25 %	25 %	0 %	386859006
85	NC_017817	ATAA	2	8	33414	33421	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017817	ATAA	2	8	33628	33635	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017817	AAGG	2	8	33652	33659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017817	TAAT	2	8	33681	33688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017817	TAAA	2	8	34295	34302	75 %	25 %	0 %	0 %	386859008
90	NC_017817	TATT	2	8	35211	35218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017817	TTAA	2	8	35326	35333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017817	TGAG	2	8	35662	35669	25 %	25 %	50 %	0 %	386859009
93	NC_017817	TAAG	2	8	35896	35903	50 %	25 %	25 %	0 %	386859009
94	NC_017817	AAAG	2	8	36056	36063	75 %	0 %	25 %	0 %	386859009
95	NC_017817	AAGA	2	8	36321	36328	75 %	0 %	25 %	0 %	386859009
96	NC_017817	AAAG	2	8	36347	36354	75 %	0 %	25 %	0 %	386859009

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.