MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017817	AATT	2	8	139	146	50 %	50 %	0 %	0 %	386858973
2	NC_017817	ATTC	2	8	381	388	25 %	50 %	0 %	25 %	386858973
3	NC_017817	CACT	2	8	936	943	25 %	25 %	0 %	50 %	386858974
4	NC_017817	TTTA	2	8	1573	1580	25 %	75 %	0 %	0 %	386858974
5	NC_017817	TTCC	2	8	1703	1710	0 %	50 %	0 %	50 %	386858975
6	NC_017817	GAAT	2	8	1930	1937	50 %	25 %	25 %	0 %	386858976
7	NC_017817	CTTT	2	8	2499	2506	0 %	75 %	0 %	25 %	386858977
8	NC_017817	CTTT	2	8	3467	3474	0 %	75 %	0 %	25 %	386858978
9	NC_017817	AAAT	2	8	3513	3520	75 %	25 %	0 %	0 %	386858978
10	NC_017817	TTAT	2	8	3688	3695	25 %	75 %	0 %	0 %	386858979
11	NC_017817	ATTT	2	8	4388	4395	25 %	75 %	0 %	0 %	386858979
12	NC_017817	ACTT	2	8	5008	5015	25 %	50 %	0 %	25 %	386858980
13	NC_017817	TAAT	2	8	5020	5027	50 %	50 %	0 %	0 %	386858980
14	NC_017817	TTTA	2	8	5214	5221	25 %	75 %	0 %	0 %	386858981
15	NC_017817	ATCA	2	8	5593	5600	50 %	25 %	0 %	25 %	386858981
16	NC_017817	AGCA	2	8	5674	5681	50 %	0 %	25 %	25 %	386858981
17	NC_017817	AATT	2	8	5899	5906	50 %	50 %	0 %	0 %	386858981
18	NC_017817	ATTA	2	8	6569	6576	50 %	50 %	0 %	0 %	386858982
19	NC_017817	TTAT	2	8	6622	6629	25 %	75 %	0 %	0 %	386858982
20	NC_017817	CCTT	2	8	6763	6770	0 %	50 %	0 %	50 %	386858982
21	NC_017817	TCTT	2	8	6811	6818	0 %	75 %	0 %	25 %	386858982
22	NC_017817	TTTC	2	8	6836	6843	0 %	75 %	0 %	25 %	386858982
23	NC_017817	CTTA	2	8	7260	7267	25 %	50 %	0 %	25 %	386858982
24	NC_017817	TTTC	2	8	7667	7674	0 %	75 %	0 %	25 %	386858982
25	NC_017817	CAAA	2	8	7720	7727	75 %	0 %	0 %	25 %	386858982
26	NC_017817	ACTT	2	8	7885	7892	25 %	50 %	0 %	25 %	386858983
27	NC_017817	ATTT	2	8	9139	9146	25 %	75 %	0 %	0 %	386858984
28	NC_017817	ATCA	2	8	9522	9529	50 %	25 %	0 %	25 %	386858984
29	NC_017817	CTGC	2	8	11246	11253	0 %	25 %	25 %	50 %	386858985
30	NC_017817	ATTT	2	8	12947	12954	25 %	75 %	0 %	0 %	386858987
31	NC_017817	ATCA	2	8	13318	13325	50 %	25 %	0 %	25 %	386858987
32	NC_017817	TAAT	2	8	16801	16808	50 %	50 %	0 %	0 %	386858989
33	NC_017817	CATT	2	8	17121	17128	25 %	50 %	0 %	25 %	386858989
34	NC_017817	TTGC	2	8	19608	19615	0 %	50 %	25 %	25 %	386858991
35	NC_017817	TCTT	2	8	20654	20661	0 %	75 %	0 %	25 %	386858993
36	NC_017817	TTTC	2	8	21057	21064	0 %	75 %	0 %	25 %	386858993
37	NC_017817	AATA	2	8	21391	21398	75 %	25 %	0 %	0 %	386858994
38	NC_017817	ATTA	2	8	21429	21436	50 %	50 %	0 %	0 %	386858994
39	NC_017817	CAAA	2	8	22288	22295	75 %	0 %	0 %	25 %	386858995
40	NC_017817	TCTT	2	8	22487	22494	0 %	75 %	0 %	25 %	386858995
41	NC_017817	AATA	2	8	26924	26931	75 %	25 %	0 %	0 %	386859000
42	NC_017817	TTTA	2	8	27008	27015	25 %	75 %	0 %	0 %	386859000
43	NC_017817	ATTT	2	8	27037	27044	25 %	75 %	0 %	0 %	386859000
44	NC_017817	ATTA	2	8	28594	28601	50 %	50 %	0 %	0 %	386859001
45	NC_017817	ATAA	2	8	29392	29399	75 %	25 %	0 %	0 %	386859003
46	NC_017817	CTTA	2	8	29498	29505	25 %	50 %	0 %	25 %	386859003
47	NC_017817	TAAA	2	8	30934	30941	75 %	25 %	0 %	0 %	386859005
48	NC_017817	AGAT	2	8	32950	32957	50 %	25 %	25 %	0 %	386859006
49	NC_017817	AGAT	2	8	33136	33143	50 %	25 %	25 %	0 %	386859006
50	NC_017817	AGAT	2	8	33190	33197	50 %	25 %	25 %	0 %	386859006
51	NC_017817	AGAT	2	8	33223	33230	50 %	25 %	25 %	0 %	386859006
52	NC_017817	TAAA	2	8	34295	34302	75 %	25 %	0 %	0 %	386859008
53	NC_017817	TGAG	2	8	35662	35669	25 %	25 %	50 %	0 %	386859009
54	NC_017817	TAAG	2	8	35896	35903	50 %	25 %	25 %	0 %	386859009
55	NC_017817	AAAG	2	8	36056	36063	75 %	0 %	25 %	0 %	386859009
56	NC_017817	AAGA	2	8	36321	36328	75 %	0 %	25 %	0 %	386859009
57	NC_017817	AAAG	2	8	36347	36354	75 %	0 %	25 %	0 %	386859009

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.