MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 350

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017817	GCA	3	9	59	67	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858973
2	NC_017817	TAA	2	6	171	176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858973
3	NC_017817	GTA	2	6	191	196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858973
4	NC_017817	ATC	2	6	307	312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858973
5	NC_017817	TCC	2	6	340	345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858973
6	NC_017817	AAG	2	6	360	365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858973
7	NC_017817	AAT	2	6	397	402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858973
8	NC_017817	CAT	2	6	484	489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858973
9	NC_017817	CTT	2	6	759	764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858974
10	NC_017817	TCT	2	6	795	800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858974
11	NC_017817	TCT	2	6	809	814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858974
12	NC_017817	AAC	2	6	824	829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858974
13	NC_017817	CTG	2	6	849	854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858974
14	NC_017817	ATT	2	6	883	888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858974
15	NC_017817	GCT	2	6	890	895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858974
16	NC_017817	CTT	2	6	903	908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858974
17	NC_017817	AAC	2	6	911	916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858974
18	NC_017817	TCC	2	6	985	990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858974
19	NC_017817	TCT	2	6	1052	1057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858974
20	NC_017817	TGC	2	6	1114	1119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858974
21	NC_017817	CTG	2	6	1131	1136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858974
22	NC_017817	CTT	2	6	1455	1460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858974
23	NC_017817	CTG	2	6	1470	1475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858974
24	NC_017817	TCT	2	6	1556	1561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858974
25	NC_017817	CTT	2	6	1642	1647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858975
26	NC_017817	CAG	2	6	1656	1661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858975
27	NC_017817	CTC	2	6	1682	1687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858975
28	NC_017817	CTC	2	6	1694	1699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858975
29	NC_017817	CAC	2	6	1740	1745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858975
30	NC_017817	ATT	2	6	1762	1767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858975
31	NC_017817	TCT	2	6	1827	1832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858975
32	NC_017817	TCT	2	6	1843	1848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858975
33	NC_017817	CCT	2	6	1865	1870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858975
34	NC_017817	TAA	2	6	1993	1998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858976
35	NC_017817	ATT	2	6	2103	2108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858977
36	NC_017817	ACT	2	6	2116	2121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858977
37	NC_017817	CTT	2	6	2175	2180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858977
38	NC_017817	CTT	2	6	2210	2215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858977
39	NC_017817	TTG	2	6	2256	2261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858977
40	NC_017817	AGC	2	6	2296	2301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858977
41	NC_017817	ACC	2	6	2317	2322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858977
42	NC_017817	CAT	2	6	2391	2396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858977
43	NC_017817	CTC	2	6	2457	2462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858977
44	NC_017817	CTC	2	6	2466	2471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858977
45	NC_017817	TGC	2	6	2482	2487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858977
46	NC_017817	TAG	2	6	2511	2516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858977
47	NC_017817	CAT	2	6	2517	2522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858977
48	NC_017817	CAG	2	6	2526	2531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858977
49	NC_017817	TAA	2	6	2544	2549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858977
50	NC_017817	CAG	2	6	2580	2585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858977
51	NC_017817	GCA	2	6	2591	2596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858977
52	NC_017817	TTA	2	6	2609	2614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858977
53	NC_017817	TAC	2	6	2650	2655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858977
54	NC_017817	CTA	2	6	2658	2663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858977
55	NC_017817	CAT	2	6	3366	3371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858978
56	NC_017817	CAT	2	6	3378	3383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858978
57	NC_017817	ATT	3	9	3388	3396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858978
58	NC_017817	ACT	2	6	3397	3402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858978
59	NC_017817	CTT	2	6	3425	3430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858978
60	NC_017817	CCT	2	6	3452	3457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858978
61	NC_017817	TGC	2	6	3792	3797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858979
62	NC_017817	AGC	2	6	3813	3818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858979
63	NC_017817	ACC	2	6	3825	3830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858979
64	NC_017817	GCT	2	6	3859	3864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858979
65	NC_017817	ATA	2	6	3865	3870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858979
66	NC_017817	TAT	2	6	3902	3907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858979
67	NC_017817	CTT	2	6	3908	3913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858979
68	NC_017817	CTG	2	6	3932	3937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858979
69	NC_017817	TGC	2	6	3945	3950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858979
70	NC_017817	TAG	2	6	3956	3961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858979
71	NC_017817	TTG	2	6	4028	4033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858979
72	NC_017817	TGC	3	9	4038	4046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858979
73	NC_017817	TTG	2	6	4047	4052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858979
74	NC_017817	CCA	2	6	4060	4065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858979
75	NC_017817	TAG	2	6	4121	4126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858979
76	NC_017817	CTA	2	6	4163	4168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858979
77	NC_017817	CAT	2	6	4214	4219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858979
78	NC_017817	CAC	2	6	4244	4249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858979
79	NC_017817	ATC	2	6	4257	4262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858979
80	NC_017817	CTT	2	6	4283	4288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858979
81	NC_017817	TAA	2	6	4322	4327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858979
82	NC_017817	TCA	2	6	4330	4335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858979
83	NC_017817	TTC	2	6	4366	4371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858979
84	NC_017817	TTG	3	9	4409	4417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858979
85	NC_017817	AAG	2	6	5171	5176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858980
86	NC_017817	AAC	2	6	5224	5229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858981
87	NC_017817	CCA	2	6	5264	5269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858981
88	NC_017817	ATT	2	6	5339	5344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858981
89	NC_017817	CAG	2	6	5382	5387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858981
90	NC_017817	CTT	2	6	5403	5408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858981
91	NC_017817	AGC	2	6	5413	5418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858981
92	NC_017817	ACC	2	6	5434	5439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858981
93	NC_017817	TAG	2	6	5484	5489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858981
94	NC_017817	CAG	2	6	5490	5495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858981
95	NC_017817	AGC	2	6	5503	5508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858981
96	NC_017817	CAT	2	6	5535	5540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858981
97	NC_017817	AAT	2	6	5782	5787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858981
98	NC_017817	CAG	3	9	5817	5825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858981
99	NC_017817	CTT	2	6	5862	5867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858981
100	NC_017817	TGC	2	6	6819	6824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858982
101	NC_017817	CAC	2	6	6962	6967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858982
102	NC_017817	AAC	2	6	7036	7041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858982
103	NC_017817	CTT	2	6	7053	7058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858982
104	NC_017817	ATC	2	6	7059	7064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858982
105	NC_017817	CAA	2	6	7118	7123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858982
106	NC_017817	CAC	2	6	7199	7204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858982
107	NC_017817	TCT	2	6	7213	7218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858982
108	NC_017817	GCT	2	6	7234	7239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858982
109	NC_017817	CTT	2	6	7250	7255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858982
110	NC_017817	CTA	2	6	7375	7380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858982
111	NC_017817	CTT	2	6	7401	7406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858982
112	NC_017817	CTC	2	6	7526	7531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858982
113	NC_017817	CAT	2	6	7551	7556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858982
114	NC_017817	CAC	2	6	7557	7562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858982
115	NC_017817	TTC	2	6	7571	7576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858982
116	NC_017817	TTC	2	6	7617	7622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858982
117	NC_017817	CCT	2	6	7676	7681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858982
118	NC_017817	CAA	2	6	7733	7738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858982
119	NC_017817	ATG	2	6	7739	7744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858982
120	NC_017817	ATT	2	6	7758	7763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858982
121	NC_017817	AGC	2	6	8073	8078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858983
122	NC_017817	CTG	2	6	8117	8122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858983
123	NC_017817	CTT	2	6	8136	8141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858983
124	NC_017817	CTT	2	6	8159	8164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858983
125	NC_017817	CTG	2	6	8198	8203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858983
126	NC_017817	TCA	2	6	8224	8229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858983
127	NC_017817	CAC	2	6	8276	8281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858983
128	NC_017817	ATC	2	6	8334	8339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858983
129	NC_017817	TCT	2	6	8369	8374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858983
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131	NC_017817	CCG	2	6	8483	8488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386858983
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.