MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017817	CT	3	6	428	433	0 %	50 %	0 %	50 %	386858973
2	NC_017817	CT	3	6	507	512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017817	TC	3	6	533	538	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017817	AG	3	6	648	653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017817	CT	3	6	662	667	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017817	CT	3	6	742	747	0 %	50 %	0 %	50 %	386858974
7	NC_017817	TA	3	6	1281	1286	50 %	50 %	0 %	0 %	386858974
8	NC_017817	CT	5	10	1802	1811	0 %	50 %	0 %	50 %	386858975
9	NC_017817	CT	4	8	1814	1821	0 %	50 %	0 %	50 %	386858975
10	NC_017817	AT	3	6	2448	2453	50 %	50 %	0 %	0 %	386858977
11	NC_017817	CT	3	6	3085	3090	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017817	TC	3	6	3431	3436	0 %	50 %	0 %	50 %	386858978
13	NC_017817	TA	3	6	3528	3533	50 %	50 %	0 %	0 %	386858978
14	NC_017817	AT	3	6	3616	3621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017817	TC	3	6	3674	3679	0 %	50 %	0 %	50 %	386858979
16	NC_017817	AT	3	6	4001	4006	50 %	50 %	0 %	0 %	386858979
17	NC_017817	TA	3	6	4772	4777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017817	CT	4	8	4821	4828	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017817	TA	4	8	4870	4877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017817	CT	4	8	5147	5154	0 %	50 %	0 %	50 %	386858980
21	NC_017817	TC	3	6	6608	6613	0 %	50 %	0 %	50 %	386858982
22	NC_017817	TC	3	6	7331	7336	0 %	50 %	0 %	50 %	386858982
23	NC_017817	CT	3	6	7590	7595	0 %	50 %	0 %	50 %	386858982
24	NC_017817	TC	3	6	7596	7601	0 %	50 %	0 %	50 %	386858982
25	NC_017817	CT	3	6	7602	7607	0 %	50 %	0 %	50 %	386858982
26	NC_017817	AC	3	6	7770	7775	50 %	0 %	0 %	50 %	386858982
27	NC_017817	CT	3	6	7811	7816	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017817	TC	3	6	7928	7933	0 %	50 %	0 %	50 %	386858983
29	NC_017817	AT	3	6	8267	8272	50 %	50 %	0 %	0 %	386858983
30	NC_017817	TC	3	6	8888	8893	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017817	TC	3	6	10223	10228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017817	TG	3	6	10320	10325	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017817	AT	3	6	10871	10876	50 %	50 %	0 %	0 %	386858985
34	NC_017817	AT	4	8	15906	15913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017817	TA	3	6	15920	15925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017817	AT	3	6	16386	16391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017817	AT	4	8	16409	16416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017817	AT	3	6	16740	16745	50 %	50 %	0 %	0 %	386858989
39	NC_017817	TA	3	6	16822	16827	50 %	50 %	0 %	0 %	386858989
40	NC_017817	AT	3	6	16877	16882	50 %	50 %	0 %	0 %	386858989
41	NC_017817	CA	4	8	16927	16934	50 %	0 %	0 %	50 %	386858989
42	NC_017817	GA	3	6	17022	17027	50 %	0 %	50 %	0 %	386858989
43	NC_017817	AT	3	6	17162	17167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017817	TA	3	6	19081	19086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017817	AT	3	6	19244	19249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017817	AT	3	6	20463	20468	50 %	50 %	0 %	0 %	386858992
47	NC_017817	AT	3	6	20476	20481	50 %	50 %	0 %	0 %	386858992
48	NC_017817	AT	3	6	21279	21284	50 %	50 %	0 %	0 %	386858994
49	NC_017817	AT	3	6	21438	21443	50 %	50 %	0 %	0 %	386858994
50	NC_017817	TA	3	6	21534	21539	50 %	50 %	0 %	0 %	386858994
51	NC_017817	AT	3	6	22025	22030	50 %	50 %	0 %	0 %	386858995
52	NC_017817	AC	3	6	22132	22137	50 %	0 %	0 %	50 %	386858995
53	NC_017817	TC	3	6	23633	23638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017817	TA	4	8	23941	23948	50 %	50 %	0 %	0 %	386858996
55	NC_017817	TA	3	6	24003	24008	50 %	50 %	0 %	0 %	386858996
56	NC_017817	TA	3	6	26527	26532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017817	TA	3	6	26587	26592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017817	TA	3	6	26733	26738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017817	AT	3	6	26865	26870	50 %	50 %	0 %	0 %	386858999
60	NC_017817	AT	3	6	26941	26946	50 %	50 %	0 %	0 %	386859000
61	NC_017817	AT	3	6	27238	27243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017817	GA	3	6	27697	27702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017817	GA	3	6	28425	28430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017817	TC	3	6	28433	28438	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017817	TC	3	6	28857	28862	0 %	50 %	0 %	50 %	386859002
66	NC_017817	AT	3	6	29048	29053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017817	AT	3	6	29093	29098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017817	AT	3	6	29641	29646	50 %	50 %	0 %	0 %	386859003
69	NC_017817	TA	3	6	29821	29826	50 %	50 %	0 %	0 %	386859003
70	NC_017817	AT	3	6	29848	29853	50 %	50 %	0 %	0 %	386859003
71	NC_017817	AG	3	6	30637	30642	50 %	0 %	50 %	0 %	386859004
72	NC_017817	GA	3	6	30658	30663	50 %	0 %	50 %	0 %	386859004
73	NC_017817	AT	4	8	30805	30812	50 %	50 %	0 %	0 %	386859004
74	NC_017817	AT	3	6	31439	31444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017817	AG	3	6	32868	32873	50 %	0 %	50 %	0 %	386859006
76	NC_017817	TA	3	6	33549	33554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017817	GA	3	6	33644	33649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017817	AT	3	6	33699	33704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017817	GA	3	6	33732	33737	50 %	0 %	50 %	0 %	386859007
80	NC_017817	CT	3	6	33765	33770	0 %	50 %	0 %	50 %	386859007
81	NC_017817	TA	3	6	33797	33802	50 %	50 %	0 %	0 %	386859007
82	NC_017817	TA	3	6	33812	33817	50 %	50 %	0 %	0 %	386859007
83	NC_017817	GA	3	6	33929	33934	50 %	0 %	50 %	0 %	386859008
84	NC_017817	AG	3	6	33955	33960	50 %	0 %	50 %	0 %	386859008
85	NC_017817	GA	4	8	33963	33970	50 %	0 %	50 %	0 %	386859008
86	NC_017817	GA	3	6	34052	34057	50 %	0 %	50 %	0 %	386859008
87	NC_017817	AT	3	6	35152	35157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017817	GA	3	6	35533	35538	50 %	0 %	50 %	0 %	386859009
89	NC_017817	AG	3	6	35559	35564	50 %	0 %	50 %	0 %	386859009
90	NC_017817	AG	3	6	35568	35573	50 %	0 %	50 %	0 %	386859009
91	NC_017817	AT	3	6	36208	36213	50 %	50 %	0 %	0 %	386859009

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.