MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 119

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017817	T	7	7	562	568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017817	T	7	7	574	580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017817	A	6	6	603	608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017817	T	6	6	1521	1526	0 %	100 %	0 %	0 %	386858974
5	NC_017817	C	6	6	1632	1637	0 %	0 %	0 %	100 %	386858975
6	NC_017817	T	7	7	1879	1885	0 %	100 %	0 %	0 %	386858975
7	NC_017817	N	248	248	2812	3059	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017817	T	7	7	3460	3466	0 %	100 %	0 %	0 %	386858978
9	NC_017817	T	6	6	3480	3485	0 %	100 %	0 %	0 %	386858978
10	NC_017817	A	6	6	3506	3511	100 %	0 %	0 %	0 %	386858978
11	NC_017817	A	6	6	3554	3559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017817	T	7	7	3876	3882	0 %	100 %	0 %	0 %	386858979
13	NC_017817	T	7	7	4448	4454	0 %	100 %	0 %	0 %	386858979
14	NC_017817	C	6	6	4588	4593	0 %	0 %	0 %	100 %	386858979
15	NC_017817	T	7	7	4676	4682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017817	A	6	6	4717	4722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017817	A	6	6	5084	5089	100 %	0 %	0 %	0 %	386858980
18	NC_017817	A	6	6	6170	6175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017817	N	322	322	6178	6499	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017817	A	6	6	6530	6535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017817	C	6	6	6792	6797	0 %	0 %	0 %	100 %	386858982
22	NC_017817	T	6	6	7684	7689	0 %	100 %	0 %	0 %	386858982
23	NC_017817	T	6	6	7695	7700	0 %	100 %	0 %	0 %	386858982
24	NC_017817	A	6	6	7725	7730	100 %	0 %	0 %	0 %	386858982
25	NC_017817	A	7	7	7791	7797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017817	T	6	6	8163	8168	0 %	100 %	0 %	0 %	386858983
27	NC_017817	T	6	6	8206	8211	0 %	100 %	0 %	0 %	386858983
28	NC_017817	T	6	6	8924	8929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017817	A	7	7	8985	8991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017817	A	6	6	9028	9033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017817	A	6	6	9066	9071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017817	T	6	6	9511	9516	0 %	100 %	0 %	0 %	386858984
33	NC_017817	A	6	6	10099	10104	100 %	0 %	0 %	0 %	386858984
34	NC_017817	T	6	6	10199	10204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017817	T	6	6	10273	10278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017817	T	6	6	10467	10472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017817	T	6	6	10573	10578	0 %	100 %	0 %	0 %	386858985
38	NC_017817	T	6	6	11279	11284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017817	N	749	749	11327	12075	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017817	T	6	6	12218	12223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017817	A	6	6	12864	12869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017817	T	6	6	13706	13711	0 %	100 %	0 %	0 %	386858987
43	NC_017817	N	1661	1661	13900	15560	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017817	T	6	6	15774	15779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017817	T	7	7	16002	16008	0 %	100 %	0 %	0 %	386858988
46	NC_017817	A	6	6	16401	16406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017817	A	6	6	16725	16730	100 %	0 %	0 %	0 %	386858989
48	NC_017817	A	6	6	17074	17079	100 %	0 %	0 %	0 %	386858989
49	NC_017817	A	6	6	17081	17086	100 %	0 %	0 %	0 %	386858989
50	NC_017817	A	6	6	17436	17441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017817	T	6	6	17497	17502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017817	N	1444	1444	17538	18981	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017817	T	6	6	19455	19460	0 %	100 %	0 %	0 %	386858991
54	NC_017817	A	7	7	20254	20260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017817	T	8	8	20705	20712	0 %	100 %	0 %	0 %	386858993
56	NC_017817	T	6	6	20779	20784	0 %	100 %	0 %	0 %	386858993
57	NC_017817	A	6	6	20810	20815	100 %	0 %	0 %	0 %	386858993
58	NC_017817	T	6	6	20837	20842	0 %	100 %	0 %	0 %	386858993
59	NC_017817	T	6	6	21034	21039	0 %	100 %	0 %	0 %	386858993
60	NC_017817	T	6	6	21084	21089	0 %	100 %	0 %	0 %	386858993
61	NC_017817	T	7	7	21106	21112	0 %	100 %	0 %	0 %	386858993
62	NC_017817	A	6	6	21361	21366	100 %	0 %	0 %	0 %	386858994
63	NC_017817	A	6	6	21622	21627	100 %	0 %	0 %	0 %	386858994
64	NC_017817	A	7	7	21822	21828	100 %	0 %	0 %	0 %	386858994
65	NC_017817	T	6	6	21966	21971	0 %	100 %	0 %	0 %	386858994
66	NC_017817	T	6	6	22309	22314	0 %	100 %	0 %	0 %	386858995
67	NC_017817	A	6	6	22343	22348	100 %	0 %	0 %	0 %	386858995
68	NC_017817	T	7	7	22450	22456	0 %	100 %	0 %	0 %	386858995
69	NC_017817	N	809	809	22598	23406	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017817	T	7	7	23588	23594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017817	T	8	8	23721	23728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017817	T	6	6	23859	23864	0 %	100 %	0 %	0 %	386858996
73	NC_017817	T	6	6	23968	23973	0 %	100 %	0 %	0 %	386858996
74	NC_017817	T	6	6	24041	24046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017817	A	7	7	24106	24112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017817	N	1803	1803	24141	25943	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017817	T	8	8	26535	26542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017817	A	6	6	26655	26660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017817	T	6	6	27049	27054	0 %	100 %	0 %	0 %	386859000
80	NC_017817	T	6	6	27226	27231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017817	T	6	6	27515	27520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017817	N	602	602	27706	28307	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017817	T	8	8	28442	28449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017817	T	7	7	28500	28506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017817	T	9	9	28680	28688	0 %	100 %	0 %	0 %	386859001
86	NC_017817	A	6	6	28818	28823	100 %	0 %	0 %	0 %	386859002
87	NC_017817	T	6	6	28879	28884	0 %	100 %	0 %	0 %	386859002
88	NC_017817	T	7	7	28944	28950	0 %	100 %	0 %	0 %	386859002
89	NC_017817	T	6	6	29232	29237	0 %	100 %	0 %	0 %	386859003
90	NC_017817	T	6	6	29251	29256	0 %	100 %	0 %	0 %	386859003
91	NC_017817	A	6	6	29300	29305	100 %	0 %	0 %	0 %	386859003
92	NC_017817	T	6	6	29633	29638	0 %	100 %	0 %	0 %	386859003
93	NC_017817	T	6	6	29677	29682	0 %	100 %	0 %	0 %	386859003
94	NC_017817	T	8	8	29859	29866	0 %	100 %	0 %	0 %	386859003
95	NC_017817	N	276	276	30189	30464	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017817	A	7	7	30743	30749	100 %	0 %	0 %	0 %	386859004
97	NC_017817	A	6	6	30939	30944	100 %	0 %	0 %	0 %	386859005
98	NC_017817	A	8	8	30982	30989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017817	A	6	6	31151	31156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017817	N	1251	1251	31568	32818	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017817	T	8	8	33370	33377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017817	T	6	6	33382	33387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017817	T	8	8	33399	33406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017817	T	6	6	33436	33441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017817	T	7	7	33770	33776	0 %	100 %	0 %	0 %	386859007
106	NC_017817	T	7	7	33825	33831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017817	A	7	7	33881	33887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017817	A	6	6	33916	33921	100 %	0 %	0 %	0 %	386859008
109	NC_017817	A	6	6	34252	34257	100 %	0 %	0 %	0 %	386859008
110	NC_017817	A	6	6	34522	34527	100 %	0 %	0 %	0 %	386859008
111	NC_017817	T	6	6	35157	35162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017817	T	6	6	35178	35183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017817	A	6	6	35205	35210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017817	A	7	7	35251	35257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017817	A	6	6	35297	35302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017817	T	6	6	35423	35428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017817	T	6	6	35444	35449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017817	A	7	7	35480	35486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017817	A	6	6	35520	35525	100 %	0 %	0 %	0 %	386859009

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.