MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017815	ATT	2	6	6	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017815	ATT	2	6	120	125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017815	ATA	2	6	133	138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017815	ATA	2	6	161	166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017815	ATA	2	6	228	233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017815	TAA	2	6	278	283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017815	ATT	2	6	335	340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017815	AAT	2	6	345	350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017815	CAA	2	6	352	357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017815	ATT	2	6	359	364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017815	CAT	2	6	431	436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017815	CTT	2	6	456	461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017815	ACG	2	6	546	551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386860092
14	NC_017815	ATT	2	6	655	660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860092
15	NC_017815	TAT	2	6	879	884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860092
16	NC_017815	TCT	2	6	1227	1232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860093
17	NC_017815	TGT	2	6	1266	1271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386860093
18	NC_017815	TAA	2	6	1280	1285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860093
19	NC_017815	AAT	2	6	1371	1376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860093
20	NC_017815	CTG	2	6	1402	1407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386860093
21	NC_017815	TAA	2	6	1432	1437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860093
22	NC_017815	TTC	2	6	1556	1561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860093
23	NC_017815	TAA	2	6	1592	1597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860093
24	NC_017815	CAT	2	6	1627	1632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386860093
25	NC_017815	TTA	2	6	1633	1638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860093
26	NC_017815	TCT	2	6	1692	1697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860093
27	NC_017815	ATA	2	6	1774	1779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860093
28	NC_017815	TAT	2	6	1790	1795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860093
29	NC_017815	TTA	2	6	1840	1845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860093
30	NC_017815	TAC	2	6	2022	2027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386860094
31	NC_017815	TTC	2	6	2092	2097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860094
32	NC_017815	ATA	2	6	2137	2142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860094
33	NC_017815	CTT	2	6	2163	2168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860094
34	NC_017815	TTC	2	6	2200	2205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860094
35	NC_017815	CAA	2	6	3228	3233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017815	CTT	2	6	3245	3250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017815	AAG	2	6	3267	3272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017815	AGA	2	6	3278	3283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017815	TCT	2	6	3355	3360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017815	TTA	2	6	3418	3423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017815	ATA	2	6	3534	3539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017815	ATA	2	6	3573	3578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017815	TAG	2	6	3638	3643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017815	TAA	2	6	3682	3687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017815	TTG	2	6	3737	3742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017815	TTA	2	6	3796	3801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017815	TTA	2	6	3840	3845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017815	TAA	3	9	3850	3858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017815	ATT	2	6	3863	3868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017815	TAA	2	6	3871	3876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017815	ATT	2	6	3905	3910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017815	ATA	2	6	3927	3932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017815	ATT	3	9	3960	3968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017815	ATT	2	6	3977	3982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.