MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 146

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017814	ATT	2	6	676	681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858830
2	NC_017814	CAT	2	6	724	729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858830
3	NC_017814	CTT	2	6	748	753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858830
4	NC_017814	CTT	2	6	842	847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858830
5	NC_017814	AGC	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858830
6	NC_017814	ATT	2	6	1851	1856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858831
7	NC_017814	CTG	2	6	2004	2009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858831
8	NC_017814	CTG	2	6	2295	2300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858832
9	NC_017814	CTT	2	6	2333	2338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858832
10	NC_017814	TCT	2	6	2369	2374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858832
11	NC_017814	CTA	2	6	2393	2398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858832
12	NC_017814	CTT	2	6	2435	2440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858832
13	NC_017814	CTG	2	6	2471	2476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858832
14	NC_017814	CCT	2	6	2515	2520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858832
15	NC_017814	CTG	3	9	2525	2533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858832
16	NC_017814	ATT	2	6	2565	2570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858832
17	NC_017814	GTT	2	6	2593	2598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858832
18	NC_017814	CAC	2	6	2600	2605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858832
19	NC_017814	GCA	2	6	2608	2613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858832
20	NC_017814	TGT	2	6	2679	2684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858832
21	NC_017814	TGC	3	9	2691	2699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858832
22	NC_017814	CTG	4	12	2711	2722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858832
23	NC_017814	TTA	2	6	2725	2730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858832
24	NC_017814	ATA	2	6	2744	2749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858832
25	NC_017814	TTA	2	6	2764	2769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858832
26	NC_017814	CTG	2	6	2789	2794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858832
27	NC_017814	CTT	2	6	2822	2827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858832
28	NC_017814	CAT	2	6	2882	2887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858832
29	NC_017814	ATT	2	6	2913	2918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858832
30	NC_017814	CTA	2	6	2927	2932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858832
31	NC_017814	AGT	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858832
32	NC_017814	CTG	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858832
33	NC_017814	CTT	2	6	3041	3046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858832
34	NC_017814	TTC	2	6	3087	3092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858832
35	NC_017814	TCT	2	6	3142	3147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858832
36	NC_017814	CTT	2	6	3226	3231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858832
37	NC_017814	CAT	2	6	3315	3320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858832
38	NC_017814	CAT	2	6	3324	3329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858832
39	NC_017814	ATT	2	6	3334	3339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858832
40	NC_017814	TTC	2	6	3377	3382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858832
41	NC_017814	ACA	2	6	3591	3596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858833
42	NC_017814	TAC	2	6	3710	3715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858833
43	NC_017814	CAT	2	6	3745	3750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858833
44	NC_017814	TCC	2	6	3767	3772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858833
45	NC_017814	CTG	2	6	3799	3804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858833
46	NC_017814	TAT	2	6	3847	3852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858833
47	NC_017814	CAG	2	6	3877	3882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858833
48	NC_017814	CAT	2	6	3907	3912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858833
49	NC_017814	AGC	2	6	3917	3922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858833
50	NC_017814	TCA	2	6	3954	3959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858833
51	NC_017814	TGC	2	6	3986	3991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858833
52	NC_017814	CAT	2	6	4012	4017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858833
53	NC_017814	AGT	2	6	4181	4186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858833
54	NC_017814	CAC	2	6	4192	4197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858833
55	NC_017814	CTT	2	6	4231	4236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858833
56	NC_017814	CTT	2	6	4243	4248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858833
57	NC_017814	CTT	2	6	4394	4399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858833
58	NC_017814	ATC	2	6	4545	4550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858833
59	NC_017814	ACC	2	6	4551	4556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858833
60	NC_017814	TAC	2	6	4571	4576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858833
61	NC_017814	TTC	2	6	4612	4617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858833
62	NC_017814	TCT	2	6	4899	4904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858834
63	NC_017814	CTA	2	6	4923	4928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858834
64	NC_017814	ATT	2	6	4984	4989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858834
65	NC_017814	ACT	2	6	4991	4996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858834
66	NC_017814	ATT	2	6	5166	5171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858835
67	NC_017814	GCT	2	6	5172	5177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858835
68	NC_017814	CAT	2	6	5185	5190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858835
69	NC_017814	CAC	2	6	5209	5214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858835
70	NC_017814	TTA	2	6	5241	5246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858835
71	NC_017814	TGT	2	6	5267	5272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858835
72	NC_017814	ACC	2	6	5294	5299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858835
73	NC_017814	CAT	2	6	5359	5364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858835
74	NC_017814	ATT	2	6	5390	5395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858835
75	NC_017814	CTA	2	6	5404	5409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858835
76	NC_017814	ATC	2	6	5414	5419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858835
77	NC_017814	TTC	2	6	5519	5524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858835
78	NC_017814	AAT	2	6	5611	5616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858835
79	NC_017814	CTT	2	6	5630	5635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858835
80	NC_017814	CTC	2	6	5709	5714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858835
81	NC_017814	CAT	2	6	5723	5728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858835
82	NC_017814	CTC	3	9	5752	5760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858835
83	NC_017814	CAT	2	6	5804	5809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858835
84	NC_017814	TAA	2	6	7354	7359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858836
85	NC_017814	TCA	2	6	7361	7366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858836
86	NC_017814	ATC	3	9	7444	7452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858836
87	NC_017814	TCA	2	6	7475	7480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858836
88	NC_017814	AAT	2	6	7499	7504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858836
89	NC_017814	TCA	2	6	7544	7549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858836
90	NC_017814	CTA	2	6	7614	7619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858836
91	NC_017814	ATT	2	6	7633	7638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858836
92	NC_017814	CTT	2	6	7672	7677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858836
93	NC_017814	TTC	2	6	7682	7687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858836
94	NC_017814	TCA	2	6	7706	7711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858836
95	NC_017814	TCT	2	6	7773	7778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858836
96	NC_017814	TCC	2	6	7849	7854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858836
97	NC_017814	CAT	2	6	7876	7881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858836
98	NC_017814	CAC	2	6	7882	7887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858836
99	NC_017814	CAT	3	9	7888	7896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858836
100	NC_017814	ATT	2	6	8223	8228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858837
101	NC_017814	CTA	2	6	8267	8272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858837
102	NC_017814	ACC	2	6	8364	8369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858837
103	NC_017814	CCT	2	6	8395	8400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858837
104	NC_017814	TAG	2	6	8435	8440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858837
105	NC_017814	GCT	2	6	8452	8457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858837
106	NC_017814	GCA	2	6	8458	8463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858837
107	NC_017814	CTG	2	6	8468	8473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858837
108	NC_017814	ATT	3	9	8499	8507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858837
109	NC_017814	AGC	2	6	8508	8513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858837
110	NC_017814	GAA	2	6	8537	8542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858837
111	NC_017814	CAC	2	6	8549	8554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858837
112	NC_017814	TGC	3	9	8577	8585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858837
113	NC_017814	CAG	2	6	8606	8611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858837
114	NC_017814	AAC	2	6	8623	8628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858837
115	NC_017814	TAG	2	6	8663	8668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858837
116	NC_017814	TCT	2	6	8687	8692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858837
117	NC_017814	TAA	2	6	8726	8731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858837
118	NC_017814	CTG	2	6	8753	8758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858837
119	NC_017814	TGC	2	6	8817	8822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858837
120	NC_017814	CTG	2	6	8834	8839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858837
121	NC_017814	AAT	2	6	8859	8864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858837
122	NC_017814	CAA	2	6	8873	8878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858837
123	NC_017814	TAG	2	6	8936	8941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858837
124	NC_017814	CTT	2	6	8988	8993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858837
125	NC_017814	ATT	2	6	10209	10214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858838
126	NC_017814	ACT	2	6	10222	10227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858838
127	NC_017814	CTT	2	6	10316	10321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858838
128	NC_017814	CTG	2	6	10365	10370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858838
129	NC_017814	AGC	2	6	10402	10407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858838
130	NC_017814	CAC	2	6	10506	10511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858838
131	NC_017814	CAC	2	6	10533	10538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858838
132	NC_017814	CAT	2	6	10539	10544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858838
133	NC_017814	CAT	2	6	10668	10673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858838
134	NC_017814	TCT	2	6	10694	10699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858838
135	NC_017814	TAT	2	6	10707	10712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858838
136	NC_017814	ACT	2	6	10745	10750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858838
137	NC_017814	CTA	2	6	10752	10757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858838
138	NC_017814	CAC	2	6	10791	10796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858838
139	NC_017814	CAG	2	6	10818	10823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858838
140	NC_017814	CCT	2	6	10853	10858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858838
141	NC_017814	GCC	2	6	10940	10945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386858838
142	NC_017814	CAA	2	6	10977	10982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858838
143	NC_017814	TTA	2	6	10985	10990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858838
144	NC_017814	CTT	2	6	11053	11058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858838
145	NC_017814	CTC	2	6	11170	11175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858839
146	NC_017814	CTC	2	6	11182	11187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858839

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.