MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017813	AATA	2	8	201	208	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017813	TATT	2	8	293	300	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017813	AACC	2	8	583	590	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017813	TATT	2	8	603	610	25 %	75 %	0 %	0 %	386858962
5	NC_017813	TAAA	2	8	657	664	75 %	25 %	0 %	0 %	386858962
6	NC_017813	TTCT	2	8	714	721	0 %	75 %	0 %	25 %	386858962
7	NC_017813	ATAA	2	8	838	845	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017813	TGTA	2	8	907	914	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017813	TTTA	2	8	1137	1144	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017813	TTTA	2	8	1163	1170	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017813	CTTT	2	8	1201	1208	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017813	AATT	2	8	3085	3092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017813	AAAG	2	8	3255	3262	75 %	0 %	25 %	0 %	386858963
14	NC_017813	TTTA	2	8	3433	3440	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017813	GAAT	2	8	3507	3514	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017813	AAGA	2	8	5619	5626	75 %	0 %	25 %	0 %	386858964
17	NC_017813	ATAA	2	8	5841	5848	75 %	25 %	0 %	0 %	386858964
18	NC_017813	TAAA	2	8	6054	6061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017813	ATAA	2	8	6727	6734	75 %	25 %	0 %	0 %	386858965
20	NC_017813	AAGA	2	8	7129	7136	75 %	0 %	25 %	0 %	386858965
21	NC_017813	AAGA	2	8	7144	7151	75 %	0 %	25 %	0 %	386858965
22	NC_017813	AAGG	2	8	7156	7163	50 %	0 %	50 %	0 %	386858965
23	NC_017813	AAAG	2	8	7167	7174	75 %	0 %	25 %	0 %	386858965
24	NC_017813	ATTA	3	12	7468	7479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017813	GAAG	2	8	7677	7684	50 %	0 %	50 %	0 %	386858966
26	NC_017813	TTGT	2	8	8092	8099	0 %	75 %	25 %	0 %	386858967
27	NC_017813	TTAA	2	8	8528	8535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017813	TAAA	2	8	8550	8557	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017813	TTTA	2	8	8866	8873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017813	TCAT	2	8	8898	8905	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017813	AAAG	2	8	8956	8963	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017813	AAAG	2	8	9002	9009	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017813	AGGA	2	8	9159	9166	50 %	0 %	50 %	0 %	386858968
34	NC_017813	AAGG	2	8	9181	9188	50 %	0 %	50 %	0 %	386858968
35	NC_017813	AATA	2	8	9750	9757	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017813	TAAT	2	8	9945	9952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017813	TAAG	2	8	10441	10448	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017813	AAAG	2	8	11204	11211	75 %	0 %	25 %	0 %	386858969
39	NC_017813	TTAA	2	8	11452	11459	50 %	50 %	0 %	0 %	386858969
40	NC_017813	TTAT	2	8	11541	11548	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017813	ATTT	2	8	11580	11587	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017813	AGAA	2	8	11626	11633	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017813	AATG	2	8	11653	11660	50 %	25 %	25 %	0 %	386858970
44	NC_017813	GAAG	2	8	11686	11693	50 %	0 %	50 %	0 %	386858970
45	NC_017813	GAAA	2	8	11700	11707	75 %	0 %	25 %	0 %	386858970
46	NC_017813	GAAG	2	8	12016	12023	50 %	0 %	50 %	0 %	386858970
47	NC_017813	AAAT	2	8	12769	12776	75 %	25 %	0 %	0 %	386858970
48	NC_017813	TAAG	2	8	12794	12801	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017813	ACAA	2	8	12967	12974	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017813	TGAG	2	8	13034	13041	25 %	25 %	50 %	0 %	386858971
51	NC_017813	GAAG	2	8	13293	13300	50 %	0 %	50 %	0 %	386858971
52	NC_017813	AAGA	2	8	13669	13676	75 %	0 %	25 %	0 %	386858971
53	NC_017813	AAAT	2	8	13779	13786	75 %	25 %	0 %	0 %	386858971
54	NC_017813	TAAT	2	8	13947	13954	50 %	50 %	0 %	0 %	386858971

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.