MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 191

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017813	ATT	2	6	53	58	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017813	TTA	2	6	254	259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017813	TAT	2	6	302	307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017813	AAG	2	6	375	380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017813	TCT	2	6	391	396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017813	TTA	2	6	419	424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017813	CTT	2	6	448	453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017813	TAT	3	9	494	502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017813	TCT	2	6	505	510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017813	TCA	2	6	520	525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017813	TTA	2	6	649	654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858962
12	NC_017813	TAA	2	6	708	713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858962
13	NC_017813	ATA	3	9	973	981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017813	CTA	2	6	1340	1345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017813	CTT	2	6	1425	1430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017813	CTT	2	6	1488	1493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017813	TAT	2	6	3033	3038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017813	ATT	3	9	3051	3059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017813	TGA	2	6	3143	3148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858963
20	NC_017813	ATG	2	6	3181	3186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858963
21	NC_017813	AAT	2	6	3264	3269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858963
22	NC_017813	AGA	2	6	3272	3277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858963
23	NC_017813	GAA	2	6	3300	3305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858963
24	NC_017813	AGT	2	6	3363	3368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017813	GAT	2	6	3525	3530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017813	TGT	2	6	3675	3680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017813	GTT	2	6	3778	3783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017813	GTT	2	6	3807	3812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017813	CAA	2	6	5140	5145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858964
30	NC_017813	TGA	2	6	5207	5212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858964
31	NC_017813	ACA	2	6	5220	5225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858964
32	NC_017813	AAG	2	6	5251	5256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858964
33	NC_017813	AAG	2	6	5361	5366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858964
34	NC_017813	TTG	2	6	5368	5373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858964
35	NC_017813	GAA	2	6	5421	5426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858964
36	NC_017813	TGG	2	6	5456	5461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858964
37	NC_017813	GTG	2	6	5473	5478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858964
38	NC_017813	AGC	3	9	5486	5494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858964
39	NC_017813	GTG	2	6	5521	5526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858964
40	NC_017813	TGC	3	9	5609	5617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858964
41	NC_017813	ATA	2	6	5629	5634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858964
42	NC_017813	AGG	2	6	5672	5677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858964
43	NC_017813	TGA	2	6	5726	5731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858964
44	NC_017813	ATT	2	6	5941	5946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017813	TGT	2	6	6036	6041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017813	GGA	2	6	6659	6664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858965
47	NC_017813	AGA	2	6	6669	6674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858965
48	NC_017813	GAA	2	6	6739	6744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858965
49	NC_017813	AGC	2	6	6756	6761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858965
50	NC_017813	TGA	2	6	6777	6782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858965
51	NC_017813	AGG	2	6	6789	6794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858965
52	NC_017813	CTA	2	6	6797	6802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858965
53	NC_017813	TGG	2	6	6807	6812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858965
54	NC_017813	CAG	2	6	6827	6832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858965
55	NC_017813	TAG	2	6	6875	6880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858965
56	NC_017813	GTG	2	6	6883	6888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858965
57	NC_017813	ATT	2	6	6957	6962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858965
58	NC_017813	AAG	2	6	6967	6972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858965
59	NC_017813	CTG	2	6	7070	7075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858965
60	NC_017813	ATA	3	9	7076	7084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858965
61	NC_017813	GAA	2	6	7093	7098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858965
62	NC_017813	TGC	3	9	7119	7127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858965
63	NC_017813	GAT	2	6	7138	7143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858965
64	NC_017813	AGG	2	6	7188	7193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858965
65	NC_017813	AGG	2	6	7218	7223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858965
66	NC_017813	TAA	2	6	7555	7560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017813	AGG	2	6	7595	7600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017813	GAA	2	6	7602	7607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017813	AAG	2	6	7613	7618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858966
70	NC_017813	GAA	2	6	7691	7696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858966
71	NC_017813	GAA	2	6	7710	7715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858966
72	NC_017813	TGG	2	6	7727	7732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858966
73	NC_017813	TGA	2	6	7733	7738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858966
74	NC_017813	GGA	2	6	7771	7776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858966
75	NC_017813	TGG	2	6	7857	7862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858967
76	NC_017813	TGC	2	6	7917	7922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858967
77	NC_017813	TGG	2	6	7932	7937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858967
78	NC_017813	GTA	2	6	7963	7968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858967
79	NC_017813	AAT	2	6	8068	8073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858967
80	NC_017813	TGC	2	6	8109	8114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858967
81	NC_017813	TGA	2	6	8118	8123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858967
82	NC_017813	GCA	2	6	8143	8148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858967
83	NC_017813	TGC	2	6	8211	8216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858967
84	NC_017813	GCT	2	6	8224	8229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858967
85	NC_017813	AAT	2	6	8230	8235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858967
86	NC_017813	AAT	4	12	8242	8253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858967
87	NC_017813	AGG	2	6	8283	8288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858967
88	NC_017813	TGG	2	6	8340	8345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858967
89	NC_017813	ATG	2	6	8348	8353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858967
90	NC_017813	ACT	2	6	8497	8502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858967
91	NC_017813	ATT	2	6	8558	8563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017813	TAT	2	6	8706	8711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017813	AAC	2	6	8730	8735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017813	TAA	2	6	8743	8748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017813	AGT	2	6	8768	8773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017813	GAT	2	6	8787	8792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017813	ATC	2	6	8860	8865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017813	AGG	2	6	8974	8979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017813	ATT	2	6	9017	9022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017813	TAG	2	6	9046	9051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017813	GAA	2	6	9070	9075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858968
102	NC_017813	TGA	3	9	9108	9116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858968
103	NC_017813	TGG	2	6	9117	9122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858968
104	NC_017813	GGA	3	9	9146	9154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858968
105	NC_017813	AAG	2	6	9264	9269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858968
106	NC_017813	TGC	2	6	9343	9348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858968
107	NC_017813	TGA	2	6	9448	9453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858968
108	NC_017813	AAG	2	6	9537	9542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858968
109	NC_017813	GAC	2	6	9551	9556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858968
110	NC_017813	AGC	2	6	9565	9570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858968
111	NC_017813	ATA	2	6	9585	9590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858968
112	NC_017813	ATT	2	6	9643	9648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858968
113	NC_017813	GCT	2	6	9653	9658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858968
114	NC_017813	ATG	2	6	9672	9677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858968
115	NC_017813	CTA	2	6	9699	9704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858968
116	NC_017813	AGA	2	6	9735	9740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017813	GTA	2	6	9833	9838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017813	CTG	2	6	9902	9907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017813	TTG	2	6	9908	9913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017813	ATT	2	6	9963	9968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017813	ATG	2	6	10077	10082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017813	TTA	2	6	10119	10124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017813	TAT	2	6	10144	10149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017813	AAC	2	6	10159	10164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017813	ATA	2	6	10238	10243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017813	AGA	2	6	10244	10249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017813	AAT	2	6	10269	10274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017813	AGA	2	6	10382	10387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017813	AGA	2	6	10421	10426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017813	GAA	2	6	10452	10457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017813	AAG	2	6	10464	10469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017813	TGG	2	6	10502	10507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017813	TTG	2	6	10564	10569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017813	TTG	2	6	10585	10590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017813	TTG	2	6	10870	10875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017813	TTG	2	6	10891	10896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.