MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 126

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017813	TTA	2	6	649	654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858962
2	NC_017813	TAA	2	6	708	713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858962
3	NC_017813	TGA	2	6	3143	3148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858963
4	NC_017813	ATG	2	6	3181	3186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858963
5	NC_017813	AAT	2	6	3264	3269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858963
6	NC_017813	AGA	2	6	3272	3277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858963
7	NC_017813	GAA	2	6	3300	3305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858963
8	NC_017813	CAA	2	6	5140	5145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858964
9	NC_017813	TGA	2	6	5207	5212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858964
10	NC_017813	ACA	2	6	5220	5225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858964
11	NC_017813	AAG	2	6	5251	5256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858964
12	NC_017813	AAG	2	6	5361	5366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858964
13	NC_017813	TTG	2	6	5368	5373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858964
14	NC_017813	GAA	2	6	5421	5426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858964
15	NC_017813	TGG	2	6	5456	5461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858964
16	NC_017813	GTG	2	6	5473	5478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858964
17	NC_017813	AGC	3	9	5486	5494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858964
18	NC_017813	GTG	2	6	5521	5526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858964
19	NC_017813	TGC	3	9	5609	5617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858964
20	NC_017813	ATA	2	6	5629	5634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858964
21	NC_017813	AGG	2	6	5672	5677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858964
22	NC_017813	TGA	2	6	5726	5731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858964
23	NC_017813	GGA	2	6	6659	6664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858965
24	NC_017813	AGA	2	6	6669	6674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858965
25	NC_017813	GAA	2	6	6739	6744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858965
26	NC_017813	AGC	2	6	6756	6761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858965
27	NC_017813	TGA	2	6	6777	6782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858965
28	NC_017813	AGG	2	6	6789	6794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858965
29	NC_017813	CTA	2	6	6797	6802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858965
30	NC_017813	TGG	2	6	6807	6812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858965
31	NC_017813	CAG	2	6	6827	6832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858965
32	NC_017813	TAG	2	6	6875	6880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858965
33	NC_017813	GTG	2	6	6883	6888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858965
34	NC_017813	ATT	2	6	6957	6962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858965
35	NC_017813	AAG	2	6	6967	6972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858965
36	NC_017813	CTG	2	6	7070	7075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858965
37	NC_017813	ATA	3	9	7076	7084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858965
38	NC_017813	GAA	2	6	7093	7098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858965
39	NC_017813	TGC	3	9	7119	7127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858965
40	NC_017813	GAT	2	6	7138	7143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858965
41	NC_017813	AGG	2	6	7188	7193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858965
42	NC_017813	AGG	2	6	7218	7223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858965
43	NC_017813	AAG	2	6	7613	7618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858966
44	NC_017813	GAA	2	6	7691	7696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858966
45	NC_017813	GAA	2	6	7710	7715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858966
46	NC_017813	TGG	2	6	7727	7732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858966
47	NC_017813	TGA	2	6	7733	7738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858966
48	NC_017813	GGA	2	6	7771	7776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858966
49	NC_017813	TGG	2	6	7857	7862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858967
50	NC_017813	TGC	2	6	7917	7922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858967
51	NC_017813	TGG	2	6	7932	7937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858967
52	NC_017813	GTA	2	6	7963	7968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858967
53	NC_017813	AAT	2	6	8068	8073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858967
54	NC_017813	TGC	2	6	8109	8114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858967
55	NC_017813	TGA	2	6	8118	8123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858967
56	NC_017813	GCA	2	6	8143	8148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858967
57	NC_017813	TGC	2	6	8211	8216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858967
58	NC_017813	GCT	2	6	8224	8229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858967
59	NC_017813	AAT	2	6	8230	8235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858967
60	NC_017813	AAT	4	12	8242	8253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858967
61	NC_017813	AGG	2	6	8283	8288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858967
62	NC_017813	TGG	2	6	8340	8345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858967
63	NC_017813	ATG	2	6	8348	8353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858967
64	NC_017813	ACT	2	6	8497	8502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858967
65	NC_017813	GAA	2	6	9070	9075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858968
66	NC_017813	TGA	3	9	9108	9116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858968
67	NC_017813	TGG	2	6	9117	9122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858968
68	NC_017813	GGA	3	9	9146	9154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858968
69	NC_017813	AAG	2	6	9264	9269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858968
70	NC_017813	TGC	2	6	9343	9348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858968
71	NC_017813	TGA	2	6	9448	9453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858968
72	NC_017813	AAG	2	6	9537	9542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858968
73	NC_017813	GAC	2	6	9551	9556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858968
74	NC_017813	AGC	2	6	9565	9570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858968
75	NC_017813	ATA	2	6	9585	9590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858968
76	NC_017813	ATT	2	6	9643	9648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858968
77	NC_017813	GCT	2	6	9653	9658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858968
78	NC_017813	ATG	2	6	9672	9677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858968
79	NC_017813	CTA	2	6	9699	9704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858968
80	NC_017813	GAT	2	6	10950	10955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858969
81	NC_017813	AAG	2	6	10956	10961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858969
82	NC_017813	TGG	2	6	11000	11005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858969
83	NC_017813	AGC	3	9	11024	11032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858969
84	NC_017813	ATG	2	6	11131	11136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858969
85	NC_017813	CAG	2	6	11137	11142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858969
86	NC_017813	TGA	4	12	11171	11182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858969
87	NC_017813	ACT	2	6	11190	11195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858969
88	NC_017813	AGC	2	6	11222	11227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858969
89	NC_017813	ATA	2	6	11287	11292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858969
90	NC_017813	AGC	2	6	11321	11326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858969
91	NC_017813	GAG	2	6	11708	11713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858970
92	NC_017813	TGA	3	9	11757	11765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858970
93	NC_017813	GTG	2	6	11787	11792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858970
94	NC_017813	TGG	2	6	11841	11846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858970
95	NC_017813	TGG	2	6	11892	11897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858970
96	NC_017813	AAG	2	6	11954	11959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858970
97	NC_017813	TAA	2	6	11995	12000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858970
98	NC_017813	TTG	2	6	12003	12008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858970
99	NC_017813	TGC	2	6	12163	12168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858970
100	NC_017813	TGG	2	6	12172	12177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858970
101	NC_017813	TAA	2	6	12201	12206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858970
102	NC_017813	AAG	2	6	12240	12245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858970
103	NC_017813	TGG	2	6	12301	12306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858970
104	NC_017813	TGC	2	6	12310	12315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858970
105	NC_017813	TGA	3	9	12316	12324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858970
106	NC_017813	TGC	2	6	12358	12363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858970
107	NC_017813	CAG	2	6	12384	12389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858970
108	NC_017813	TGG	3	9	12454	12462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858970
109	NC_017813	GAT	3	9	12488	12496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858970
110	NC_017813	CTA	2	6	12504	12509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858970
111	NC_017813	TAT	2	6	12520	12525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858970
112	NC_017813	GGT	2	6	12560	12565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858970
113	NC_017813	TTG	2	6	12600	12605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858970
114	NC_017813	AAG	3	9	12667	12675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858970
115	NC_017813	AAG	2	6	12702	12707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858970
116	NC_017813	CTA	2	6	12729	12734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858970
117	NC_017813	TGG	2	6	12760	12765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858970
118	NC_017813	ATA	2	6	12977	12982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858971
119	NC_017813	ACT	2	6	13180	13185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858971
120	NC_017813	GTT	2	6	13243	13248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858971
121	NC_017813	TTA	2	6	13256	13261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858971
122	NC_017813	GAA	2	6	13462	13467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858971
123	NC_017813	GCA	3	9	13537	13545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858971
124	NC_017813	TGC	2	6	13644	13649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858971
125	NC_017813	TGC	3	9	13656	13664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858971
126	NC_017813	AGG	2	6	13719	13724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858971

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.