MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017812	TAAT	2	8	80	87	50 %	50 %	0 %	0 %	386858818
2	NC_017812	ATTC	2	8	197	204	25 %	50 %	0 %	25 %	386858818
3	NC_017812	GTTT	2	8	256	263	0 %	75 %	25 %	0 %	386858818
4	NC_017812	ATTC	2	8	339	346	25 %	50 %	0 %	25 %	386858818
5	NC_017812	TATG	2	8	421	428	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017812	AAGT	2	8	512	519	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017812	TAGC	2	8	555	562	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017812	AATA	2	8	633	640	75 %	25 %	0 %	0 %	386858819
9	NC_017812	AAAG	2	8	927	934	75 %	0 %	25 %	0 %	386858819
10	NC_017812	AATA	3	12	959	970	75 %	25 %	0 %	0 %	386858819
11	NC_017812	AAGC	2	8	1388	1395	50 %	0 %	25 %	25 %	386858819
12	NC_017812	AAAC	2	8	1595	1602	75 %	0 %	0 %	25 %	386858819
13	NC_017812	ATTA	2	8	1713	1720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017812	ATGA	2	8	1944	1951	50 %	25 %	25 %	0 %	386858820
15	NC_017812	TAAA	2	8	3045	3052	75 %	25 %	0 %	0 %	386858821
16	NC_017812	GAAG	2	8	3549	3556	50 %	0 %	50 %	0 %	386858822
17	NC_017812	AGCA	2	8	3616	3623	50 %	0 %	25 %	25 %	386858822
18	NC_017812	GTTT	2	8	3741	3748	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017812	TGAT	2	8	3864	3871	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017812	TCAA	2	8	4065	4072	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017812	ATAA	2	8	4301	4308	75 %	25 %	0 %	0 %	386858823
22	NC_017812	AGAT	2	8	5850	5857	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017812	GATT	2	8	6666	6673	25 %	50 %	25 %	0 %	386858825
24	NC_017812	TGTT	2	8	6691	6698	0 %	75 %	25 %	0 %	386858825
25	NC_017812	TTAC	2	8	6728	6735	25 %	50 %	0 %	25 %	386858825
26	NC_017812	AATA	2	8	7487	7494	75 %	25 %	0 %	0 %	386858826
27	NC_017812	TATT	2	8	7579	7586	25 %	75 %	0 %	0 %	386858826
28	NC_017812	AAAT	2	8	7619	7626	75 %	25 %	0 %	0 %	386858826
29	NC_017812	ATTT	2	8	8800	8807	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017812	TTCT	2	8	8900	8907	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017812	CTTT	2	8	9051	9058	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017812	ATTA	2	8	9493	9500	50 %	50 %	0 %	0 %	386858828
33	NC_017812	ATTT	2	8	9650	9657	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017812	CTTT	2	8	9710	9717	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.