MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 125

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017812	CTT	2	6	47	52	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858818
2	NC_017812	AGC	2	6	93	98	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858818
3	NC_017812	TCT	2	6	172	177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858818
4	NC_017812	ATT	2	6	264	269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858818
5	NC_017812	TAA	2	6	308	313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858818
6	NC_017812	TTG	2	6	333	338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858818
7	NC_017812	ATT	2	6	357	362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858818
8	NC_017812	GTA	2	6	370	375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858818
9	NC_017812	ACA	2	6	429	434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017812	TAT	2	6	506	511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017812	TAA	2	6	652	657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858819
12	NC_017812	TAA	2	6	824	829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858819
13	NC_017812	TAT	2	6	831	836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858819
14	NC_017812	TTA	2	6	869	874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858819
15	NC_017812	GAA	2	6	907	912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858819
16	NC_017812	TAG	2	6	1001	1006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858819
17	NC_017812	TAA	2	6	1028	1033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858819
18	NC_017812	ATA	2	6	1039	1044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858819
19	NC_017812	TAA	3	9	1046	1054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858819
20	NC_017812	AGA	2	6	1055	1060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858819
21	NC_017812	AAT	2	6	1251	1256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858819
22	NC_017812	TAT	2	6	1403	1408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858819
23	NC_017812	GAA	2	6	1499	1504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858819
24	NC_017812	ATA	2	6	1549	1554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858819
25	NC_017812	AAT	2	6	1632	1637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858819
26	NC_017812	TAT	2	6	1644	1649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858819
27	NC_017812	ATT	2	6	1652	1657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858819
28	NC_017812	AGA	2	6	1676	1681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858819
29	NC_017812	AGA	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858820
30	NC_017812	CAA	2	6	1864	1869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858820
31	NC_017812	TAA	2	6	2018	2023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858820
32	NC_017812	AGA	2	6	2026	2031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858820
33	NC_017812	AGA	2	6	2060	2065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858820
34	NC_017812	TAA	2	6	2066	2071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858820
35	NC_017812	TGT	2	6	2114	2119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858820
36	NC_017812	AGA	2	6	2138	2143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858820
37	NC_017812	TTA	2	6	2241	2246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858820
38	NC_017812	ATT	2	6	2279	2284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858820
39	NC_017812	AGG	2	6	2348	2353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858820
40	NC_017812	AAT	2	6	2386	2391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858820
41	NC_017812	GGT	2	6	2411	2416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858821
42	NC_017812	TAT	2	6	2437	2442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858821
43	NC_017812	ATT	2	6	2452	2457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858821
44	NC_017812	AAT	2	6	2540	2545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858821
45	NC_017812	AAG	2	6	2673	2678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858821
46	NC_017812	TAG	2	6	2793	2798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858821
47	NC_017812	ATA	2	6	2931	2936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858821
48	NC_017812	ATA	2	6	3030	3035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858821
49	NC_017812	TAA	2	6	3124	3129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017812	AGA	2	6	3248	3253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858822
51	NC_017812	CAA	2	6	3255	3260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858822
52	NC_017812	ATT	2	6	3271	3276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858822
53	NC_017812	TTA	2	6	3323	3328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858822
54	NC_017812	TAT	2	6	3375	3380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858822
55	NC_017812	TAT	2	6	3485	3490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858822
56	NC_017812	TTA	2	6	3666	3671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858822
57	NC_017812	ATT	2	6	3769	3774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017812	TTA	2	6	3779	3784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017812	TAG	3	9	3839	3847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017812	AAT	2	6	4048	4053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017812	GTT	2	6	4122	4127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858823
62	NC_017812	AGA	2	6	4177	4182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858823
63	NC_017812	ACA	2	6	4207	4212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858823
64	NC_017812	GAA	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858823
65	NC_017812	CAA	2	6	4257	4262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858823
66	NC_017812	TAT	2	6	4325	4330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858823
67	NC_017812	TAG	2	6	4392	4397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017812	GAT	2	6	4441	4446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017812	CAA	2	6	4467	4472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017812	AGT	2	6	4534	4539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017812	ATA	2	6	5786	5791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017812	TTA	2	6	5843	5848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017812	TCG	2	6	5898	5903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017812	TGA	2	6	5966	5971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017812	ATA	2	6	5980	5985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017812	TAA	2	6	5996	6001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017812	AAG	2	6	6039	6044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017812	TAT	2	6	6045	6050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017812	ATG	3	9	6152	6160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017812	TAA	2	6	6181	6186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017812	TAG	2	6	6232	6237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017812	GAA	3	9	6259	6267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017812	ATA	2	6	6286	6291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017812	CAT	2	6	6292	6297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017812	ATT	2	6	6347	6352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017812	GTT	3	9	6389	6397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017812	TAT	2	6	6419	6424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858824
88	NC_017812	ATT	2	6	6461	6466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858824
89	NC_017812	ATT	2	6	6484	6489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858824
90	NC_017812	CAT	2	6	6506	6511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858824
91	NC_017812	AGG	2	6	6624	6629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017812	ACA	2	6	6649	6654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858825
93	NC_017812	ATA	2	6	6660	6665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858825
94	NC_017812	ATT	2	6	6714	6719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858825
95	NC_017812	TAA	3	9	6763	6771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858825
96	NC_017812	TTA	2	6	6772	6777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858825
97	NC_017812	AAT	2	6	6935	6940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858825
98	NC_017812	CAA	2	6	6960	6965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858825
99	NC_017812	ATA	2	6	6966	6971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858825
100	NC_017812	ATC	2	6	7020	7025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858825
101	NC_017812	TTA	2	6	7062	7067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017812	ATT	2	6	7074	7079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017812	CTT	2	6	7257	7262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017812	GTA	2	6	7274	7279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017812	ATT	2	6	7339	7344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858826
106	NC_017812	TAT	2	6	7588	7593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858826
107	NC_017812	TTA	2	6	7705	7710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858826
108	NC_017812	ATT	2	6	7730	7735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858826
109	NC_017812	TCT	2	6	7738	7743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858826
110	NC_017812	ATC	2	6	7775	7780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017812	ATT	3	9	7781	7789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017812	TTC	2	6	7790	7795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017812	TCA	2	6	7806	7811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017812	AAT	2	6	8576	8581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017812	GCA	2	6	8835	8840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017812	AAT	2	6	8844	8849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017812	TAA	2	6	8872	8877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017812	ATT	2	6	9099	9104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017812	TAC	2	6	9163	9168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858827
120	NC_017812	TGT	2	6	9188	9193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858827
121	NC_017812	TTG	2	6	9394	9399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858828
122	NC_017812	TTA	2	6	9443	9448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858828
123	NC_017812	TAA	2	6	9475	9480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858828
124	NC_017812	ATT	2	6	9557	9562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017812	ATT	2	6	9586	9591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.