MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017812	ACA	2	6	429	434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017812	TAT	2	6	506	511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017812	TAA	2	6	3124	3129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017812	ATT	2	6	3769	3774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017812	TTA	2	6	3779	3784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017812	TAG	3	9	3839	3847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017812	AAT	2	6	4048	4053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017812	TAG	2	6	4392	4397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017812	GAT	2	6	4441	4446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017812	CAA	2	6	4467	4472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017812	AGT	2	6	4534	4539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017812	ATA	2	6	5786	5791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017812	TTA	2	6	5843	5848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017812	TCG	2	6	5898	5903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017812	TGA	2	6	5966	5971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017812	ATA	2	6	5980	5985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017812	TAA	2	6	5996	6001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017812	AAG	2	6	6039	6044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017812	TAT	2	6	6045	6050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017812	ATG	3	9	6152	6160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017812	TAA	2	6	6181	6186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017812	TAG	2	6	6232	6237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017812	GAA	3	9	6259	6267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017812	ATA	2	6	6286	6291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017812	CAT	2	6	6292	6297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017812	ATT	2	6	6347	6352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017812	GTT	3	9	6389	6397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017812	AGG	2	6	6624	6629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017812	TTA	2	6	7062	7067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017812	ATT	2	6	7074	7079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017812	CTT	2	6	7257	7262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017812	GTA	2	6	7274	7279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017812	ATC	2	6	7775	7780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017812	ATT	3	9	7781	7789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017812	TTC	2	6	7790	7795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017812	TCA	2	6	7806	7811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017812	AAT	2	6	8576	8581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017812	GCA	2	6	8835	8840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017812	AAT	2	6	8844	8849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017812	TAA	2	6	8872	8877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017812	ATT	2	6	9099	9104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017812	ATT	2	6	9557	9562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017812	ATT	2	6	9586	9591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.