MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017811	ATT	2	6	1	6	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858812
2	NC_017811	TGT	2	6	13	18	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858812
3	NC_017811	ATT	2	6	43	48	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858812
4	NC_017811	ATT	2	6	149	154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017811	CTT	2	6	215	220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017811	TTA	2	6	230	235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017811	ACC	2	6	259	264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017811	CAA	2	6	299	304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017811	TAC	3	9	305	313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017811	ATA	2	6	317	322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017811	TAA	2	6	329	334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017811	AAT	2	6	442	447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858813
13	NC_017811	TTC	3	9	624	632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858813
14	NC_017811	CTT	2	6	641	646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858813
15	NC_017811	TCA	2	6	862	867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858813
16	NC_017811	TAA	2	6	869	874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858813
17	NC_017811	ATT	2	6	952	957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017811	TAA	2	6	991	996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858814
19	NC_017811	TAT	2	6	1067	1072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858814
20	NC_017811	TTC	2	6	1082	1087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858814
21	NC_017811	TCT	2	6	1096	1101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858814
22	NC_017811	TTC	2	6	1171	1176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858814
23	NC_017811	TTA	3	9	1187	1195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858814
24	NC_017811	ATT	2	6	1285	1290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858814
25	NC_017811	TCA	2	6	1426	1431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858814
26	NC_017811	ATA	2	6	1489	1494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858814
27	NC_017811	TAG	2	6	1589	1594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858814
28	NC_017811	TAA	2	6	1644	1649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858814
29	NC_017811	CCT	2	6	1749	1754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858815
30	NC_017811	TAA	2	6	1920	1925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858815
31	NC_017811	ATT	2	6	1950	1955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858815
32	NC_017811	TTC	2	6	1961	1966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858815
33	NC_017811	ATA	2	6	1977	1982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858815
34	NC_017811	GTC	2	6	2027	2032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858815
35	NC_017811	TCT	2	6	2181	2186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858815
36	NC_017811	TAA	2	6	2197	2202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858815
37	NC_017811	CAA	2	6	2275	2280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017811	CTC	2	6	2291	2296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_017811	TCT	2	6	3638	3643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017811	TTC	2	6	3644	3649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017811	TGT	2	6	3682	3687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017811	ATC	2	6	3715	3720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017811	TCT	3	9	3788	3796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858816
44	NC_017811	TAT	2	6	3800	3805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858816
45	NC_017811	TTA	3	9	3808	3816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858816
46	NC_017811	TAT	3	9	3818	3826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858816
47	NC_017811	ATT	2	6	3873	3878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858816
48	NC_017811	GTT	2	6	3911	3916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858816
49	NC_017811	TCT	2	6	3925	3930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858816
50	NC_017811	TTG	2	6	4117	4122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858816
51	NC_017811	TTA	3	9	4129	4137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858816

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.