MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017810	TCC	2	6	1	6	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858955
2	NC_017810	CAT	2	6	14	19	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858955
3	NC_017810	CTC	3	9	43	51	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858955
4	NC_017810	CAC	2	6	94	99	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858955
5	NC_017810	CAT	2	6	106	111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858955
6	NC_017810	TGT	2	6	149	154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858955
7	NC_017810	ATA	2	6	166	171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858955
8	NC_017810	TGC	2	6	425	430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858955
9	NC_017810	TAA	2	6	431	436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858955
10	NC_017810	TGG	2	6	539	544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858955
11	NC_017810	CTG	2	6	559	564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858955
12	NC_017810	TTG	2	6	568	573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858955
13	NC_017810	TGC	3	9	584	592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858955
14	NC_017810	TAA	2	6	710	715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858955
15	NC_017810	AGC	3	9	782	790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858955
16	NC_017810	TGC	2	6	833	838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858955
17	NC_017810	AGC	2	6	860	865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858955
18	NC_017810	TAA	2	6	907	912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858955
19	NC_017810	GTG	2	6	982	987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858955
20	NC_017810	TGT	2	6	1022	1027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858955
21	NC_017810	TAA	2	6	1053	1058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017810	CTT	2	6	1076	1081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017810	TAT	2	6	1165	1170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017810	ATA	2	6	1227	1232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017810	ATA	2	6	1263	1268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017810	CAG	3	9	1290	1298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017810	TAA	2	6	1369	1374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858956
28	NC_017810	TGC	3	9	1402	1410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858956
29	NC_017810	ACT	2	6	1457	1462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858956
30	NC_017810	AGC	2	6	1489	1494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858956
31	NC_017810	GAT	2	6	1544	1549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858956
32	NC_017810	AGC	2	6	1585	1590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858956
33	NC_017810	TGA	2	6	1648	1653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858956
34	NC_017810	ATA	2	6	1884	1889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858957
35	NC_017810	GAA	2	6	1902	1907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858957
36	NC_017810	AGG	2	6	1914	1919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858957
37	NC_017810	ATA	2	6	1924	1929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858957
38	NC_017810	GAA	2	6	1991	1996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858957
39	NC_017810	CAA	2	6	2017	2022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858957
40	NC_017810	TTC	2	6	2073	2078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858957
41	NC_017810	CTC	2	6	2101	2106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858957
42	NC_017810	CAT	2	6	2138	2143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858957
43	NC_017810	CCT	2	6	2254	2259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017810	CAA	2	6	2328	2333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017810	ATG	2	6	2499	2504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017810	AAC	2	6	2671	2676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017810	TTA	2	6	2724	2729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017810	AGT	2	6	2765	2770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017810	TAG	2	6	2779	2784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017810	ATT	2	6	2870	2875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858958
51	NC_017810	CTG	2	6	2914	2919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858958
52	NC_017810	AGC	3	9	2945	2953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858958
53	NC_017810	TGC	3	9	2993	3001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858958
54	NC_017810	TTA	2	6	3030	3035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858958
55	NC_017810	TAG	2	6	3046	3051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858958
56	NC_017810	ATT	3	9	3068	3076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858958
57	NC_017810	CAA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858958
58	NC_017810	AGC	2	6	3167	3172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017810	GCA	2	6	3186	3191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017810	CAG	2	6	3205	3210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017810	ACC	2	6	3244	3249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858959
62	NC_017810	CAG	2	6	3342	3347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858959
63	NC_017810	GCA	5	15	3353	3367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858959
64	NC_017810	CAA	2	6	3390	3395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858959
65	NC_017810	CAA	2	6	3399	3404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858959
66	NC_017810	AAT	2	6	3433	3438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858959
67	NC_017810	TAA	2	6	3453	3458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858959
68	NC_017810	AGA	2	6	3493	3498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858959
69	NC_017810	ATC	2	6	3589	3594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858959
70	NC_017810	TCC	2	6	3622	3627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858959
71	NC_017810	AAG	2	6	3642	3647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858959
72	NC_017810	AAT	2	6	3679	3684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017810	TCT	3	9	3718	3726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017810	CAC	2	6	3740	3745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_017810	CAT	2	6	3756	3761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017810	CAC	2	6	3762	3767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_017810	AAT	2	6	3771	3776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017810	TTA	2	6	3868	3873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017810	ATA	2	6	3959	3964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017810	AAG	2	6	3994	3999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017810	ATT	2	6	4012	4017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017810	ATT	2	6	4088	4093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858960
83	NC_017810	TCT	2	6	4129	4134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858960
84	NC_017810	TAT	2	6	4200	4205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858960
85	NC_017810	ATC	2	6	4269	4274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858960
86	NC_017810	ATT	2	6	4275	4280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858960
87	NC_017810	GCA	2	6	4390	4395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858960
88	NC_017810	CAG	2	6	4400	4405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858960
89	NC_017810	CAG	2	6	4439	4444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858960
90	NC_017810	TCA	2	6	4447	4452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858960
91	NC_017810	CAC	2	6	4481	4486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858960
92	NC_017810	GCA	2	6	4516	4521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858960
93	NC_017810	CAG	3	9	4538	4546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858960
94	NC_017810	TAG	2	6	4595	4600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858960
95	NC_017810	CAC	2	6	4629	4634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858960
96	NC_017810	TAA	2	6	4658	4663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858960
97	NC_017810	TGC	2	6	4746	4751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858960
98	NC_017810	CTT	2	6	4763	4768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858960
99	NC_017810	ACT	2	6	4804	4809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858960
100	NC_017810	ATC	2	6	5068	5073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858960
101	NC_017810	TTC	2	6	5102	5107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858960

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.