MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA2

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017807	CTGACG	2	12	563	574	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386844948
2	NC_017807	TACAGG	2	12	2302	2313	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386844951
3	NC_017807	CCGCCA	2	12	3810	3821	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386844953
4	NC_017807	CTTTCA	2	12	4368	4379	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386844953
5	NC_017807	GGTAGC	2	12	4618	4629	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386844954
6	NC_017807	GCTGGC	2	12	5409	5420	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386844956
7	NC_017807	GCATCA	2	12	13391	13402	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386844965
8	NC_017807	CGAAGC	2	12	13958	13969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844966
9	NC_017807	GGCACC	2	12	15968	15979	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386844970
10	NC_017807	CAAGGC	2	12	18732	18743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844972
11	NC_017807	ACAGGC	2	12	19538	19549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844973
12	NC_017807	GGCAGG	2	12	22001	22012	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386844979
13	NC_017807	CGCTGA	2	12	23781	23792	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386844980
14	NC_017807	CTGATT	2	12	24233	24244	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386844980
15	NC_017807	AACCTG	2	12	30803	30814	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386844984
16	NC_017807	ACCCGC	2	12	32664	32675	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386844985
17	NC_017807	CCAACG	2	12	33280	33291	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386844985
18	NC_017807	ACGGCA	2	12	36136	36147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844985
19	NC_017807	GGCAGG	2	12	36775	36786	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386844985
20	NC_017807	TCTCTG	2	12	39082	39093	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386844989
21	NC_017807	ACCGCG	2	12	39275	39286	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386844989

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.